RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.42■■■■□ 3.42
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.39■■■■□ 3.42
PDSS1-201ENST00000376215 FANCAO15360 1455 aa36.34■■■■□ 3.41
PDSS1-201ENST00000376215 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
PDSS1-201ENST00000376215 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.3■■■■□ 3.4
PDSS1-201ENST00000376215 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.3■■■■□ 3.4
PDSS1-201ENST00000376215 MIA2Q96PC5 1412 aa36.29■■■■□ 3.4
PDSS1-201ENST00000376215 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.29■■■■□ 3.4
PDSS1-201ENST00000376215 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.29■■■■□ 3.4
PDSS1-201ENST00000376215 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.28■■■■□ 3.4
PDSS1-201ENST00000376215 NEO1Q92859 1461 aa36.25■■■■□ 3.39
PDSS1-201ENST00000376215 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.25■■■■□ 3.39
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
PDSS1-201ENST00000376215 AKNAQ7Z591 1439 aa36.22■■■■□ 3.39
PDSS1-201ENST00000376215 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.21■■■■□ 3.39
PDSS1-201ENST00000376215 ABCC1P33527 1531 aa36.18■■■■□ 3.38
PDSS1-201ENST00000376215 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
PDSS1-201ENST00000376215 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
PDSS1-201ENST00000376215 ADGRL1O94910 1474 aa36.16■■■■□ 3.38
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.15■■■■□ 3.38
PDSS1-201ENST00000376215 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.14■■■■□ 3.38
PDSS1-201ENST00000376215 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.12■■■■□ 3.37
PDSS1-201ENST00000376215 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.11■■■■□ 3.37
PDSS1-201ENST00000376215 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.09■■■■□ 3.37
PDSS1-201ENST00000376215 MBD5Q9P267 1494 aa36.07■■■■□ 3.37
PDSS1-201ENST00000376215 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
PDSS1-201ENST00000376215 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.06■■■■□ 3.36
PDSS1-201ENST00000376215 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
PDSS1-201ENST00000376215 RICTORQ6R327 1708 aa36.03■■■■□ 3.36
PDSS1-201ENST00000376215 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.02■■■■□ 3.36
PDSS1-201ENST00000376215 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.02■■■■□ 3.36
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.02■■■■□ 3.36
PDSS1-201ENST00000376215 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.35
PDSS1-201ENST00000376215 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36■■■■□ 3.35
PDSS1-201ENST00000376215 POGZQ7Z3K3 1410 aa36■■■■□ 3.35
PDSS1-201ENST00000376215 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
PDSS1-201ENST00000376215 KDM6BO15054 1643 aa35.98■■■■□ 3.35
PDSS1-201ENST00000376215 RAPGEF3O95398 923 aa35.97■■■■□ 3.35
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.95■■■■□ 3.35
PDSS1-201ENST00000376215 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.95■■■■□ 3.35
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.95■■■■□ 3.34
PDSS1-201ENST00000376215 AFAP1Q8N556 730 aa35.94■■■■□ 3.34
PDSS1-201ENST00000376215 ABCC5O15440 1437 aa35.93■■■■□ 3.34
PDSS1-201ENST00000376215 KDM5CP41229 1560 aa35.92■■■■□ 3.34
PDSS1-201ENST00000376215 DAPK1P53355 1430 aa35.92■■■■□ 3.34
PDSS1-201ENST00000376215 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.89■■■■□ 3.34
PDSS1-201ENST00000376215 PTPRKQ15262 1439 aa35.85■■■■□ 3.33
PDSS1-201ENST00000376215 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.85■■■■□ 3.33
PDSS1-201ENST00000376215 ITGAEP38570 1179 aa35.83■■■■□ 3.33
PDSS1-201ENST00000376215 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.82■■■■□ 3.33
PDSS1-201ENST00000376215 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
PDSS1-201ENST00000376215 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.81■■■■□ 3.32
PDSS1-201ENST00000376215 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.81■■■■□ 3.32
PDSS1-201ENST00000376215 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.8■■■■□ 3.32
PDSS1-201ENST00000376215 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.8■■■■□ 3.32
PDSS1-201ENST00000376215 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.8■■■■□ 3.32
PDSS1-201ENST00000376215 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
PDSS1-201ENST00000376215 TSPY4P0CV99 314 aa35.78■■■■□ 3.32
PDSS1-201ENST00000376215 TSPY10P0CW01 314 aa35.78■■■■□ 3.32
PDSS1-201ENST00000376215 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.78■■■■□ 3.32
PDSS1-201ENST00000376215 ATP7AQ04656 1500 aa35.77■■■■□ 3.32
PDSS1-201ENST00000376215 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
PDSS1-201ENST00000376215 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.75■■■■□ 3.31
PDSS1-201ENST00000376215 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.74■■■■□ 3.31
PDSS1-201ENST00000376215 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.73■■■■□ 3.31
PDSS1-201ENST00000376215 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.71■■■■□ 3.31
PDSS1-201ENST00000376215 ABCA6Q8N139 1617 aa35.7■■■■□ 3.31
PDSS1-201ENST00000376215 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.7■■■■□ 3.31
PDSS1-201ENST00000376215 ADGRL2O95490 1459 aa35.69■■■■□ 3.3
PDSS1-201ENST00000376215 PLXNC1O60486 1568 aa35.68■■■■□ 3.3
PDSS1-201ENST00000376215 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.67■■■■□ 3.3
PDSS1-201ENST00000376215 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.66■■■■□ 3.3
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.65■■■■□ 3.3
PDSS1-201ENST00000376215 NCOA1Q15788 1441 aa35.64■■■■□ 3.3
PDSS1-201ENST00000376215 ROCK1Q13464 1354 aa35.63■■■■□ 3.29
PDSS1-201ENST00000376215 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.62■■■■□ 3.29
PDSS1-201ENST00000376215 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.57■■■■□ 3.29
PDSS1-201ENST00000376215 KIF15Q9NS87 1388 aa35.56■■■■□ 3.28
PDSS1-201ENST00000376215 ATP10AO60312 1499 aa35.53■■■■□ 3.28
PDSS1-201ENST00000376215 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.52■■■■□ 3.28
PDSS1-201ENST00000376215 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.52■■■■□ 3.28
PDSS1-201ENST00000376215 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.51■■■■□ 3.27
PDSS1-201ENST00000376215 A2MP01023 1474 aa35.51■■■■□ 3.27
PDSS1-201ENST00000376215 HFM1A2PYH4 1435 aa35.49■■■■□ 3.27
PDSS1-201ENST00000376215 NAIPQ13075 1403 aa35.49■■■■□ 3.27
PDSS1-201ENST00000376215 REREQ9P2R6 1566 aa35.49■■■■□ 3.27
PDSS1-201ENST00000376215 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
PDSS1-201ENST00000376215 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.43■■■■□ 3.26
PDSS1-201ENST00000376215 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.41■■■■□ 3.26
PDSS1-201ENST00000376215 ERBINQ96RT1 1412 aa35.4■■■■□ 3.26
PDSS1-201ENST00000376215 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
PDSS1-201ENST00000376215 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.36■■■■□ 3.25
PDSS1-201ENST00000376215 AGLP35573 1532 aa35.36■■■■□ 3.25
PDSS1-201ENST00000376215 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.34■■■■□ 3.25
PDSS1-201ENST00000376215 KIF3BO15066 747 aa35.28■■■■□ 3.24
PDSS1-201ENST00000376215 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
PDSS1-201ENST00000376215 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.26■■■■□ 3.24
PDSS1-201ENST00000376215 DEPDC5O75140 1603 aa35.26■■■■□ 3.24
PDSS1-201ENST00000376215 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms