RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRK-201ENST00000368202 ITGAEP38570 1179 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRK-201ENST00000368202 PLCH2O75038 1416 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRK-201ENST00000368202 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRK-201ENST00000368202 ARAP3Q8WWN8 1544 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRK-201ENST00000368202 GLI2P10070 1586 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRK-201ENST00000368202 CFAP74Q9C0B2 1584 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRK-201ENST00000368202 DIP2BQ9P265 1576 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRK-201ENST00000368202 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRK-201ENST00000368202 CD109Q6YHK3 1445 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRK-201ENST00000368202 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRK-201ENST00000368202 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.35■□□□□ 0.53
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PTPRK-201ENST00000368202 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
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PTPRK-201ENST00000368202 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRK-201ENST00000368202 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRK-201ENST00000368202 CROCC2H7BZ55 1655 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRK-201ENST00000368202 TSPOAP1O95153 1857 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRK-201ENST00000368202 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRK-201ENST00000368202 DAPK1P53355 1430 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRK-201ENST00000368202 ARHGEF5Q12774 1597 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRK-201ENST00000368202 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-201ENST00000368202 ABCC1P33527 1531 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRK-201ENST00000368202 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRK-201ENST00000368202 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-201ENST00000368202 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.51
PTPRK-201ENST00000368202 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.26■□□□□ 0.51
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PTPRK-201ENST00000368202 TSPY10P0CW01 314 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-201ENST00000368202 ADGRL1O94910 1474 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRK-201ENST00000368202 AKNAQ7Z591 1439 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRK-201ENST00000368202 NEO1Q92859 1461 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRK-201ENST00000368202 ABCC5O15440 1437 aa18.23■□□□□ 0.51
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PTPRK-201ENST00000368202 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRK-201ENST00000368202 MBD5Q9P267 1494 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRK-201ENST00000368202 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
PTPRK-201ENST00000368202 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRK-201ENST00000368202 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
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PTPRK-201ENST00000368202 MAST1Q9Y2H9 1570 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRK-201ENST00000368202 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRK-201ENST00000368202 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRK-201ENST00000368202 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRK-201ENST00000368202 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRK-201ENST00000368202 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRK-201ENST00000368202 ROCK1Q13464 1354 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRK-201ENST00000368202 ADGRL2O95490 1459 aa18.15■□□□□ 0.5
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PTPRK-201ENST00000368202 HFM1A2PYH4 1435 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRK-201ENST00000368202 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRK-201ENST00000368202 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.5
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PTPRK-201ENST00000368202 PLXNC1O60486 1568 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRK-201ENST00000368202 POGZQ7Z3K3 1410 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRK-201ENST00000368202 RICTORQ6R327 1708 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRK-201ENST00000368202 NAIPQ13075 1403 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRK-201ENST00000368202 NCOA1Q15788 1441 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRK-201ENST00000368202 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRK-201ENST00000368202 AFAP1Q8N556 730 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRK-201ENST00000368202 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
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PTPRK-201ENST00000368202 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRK-201ENST00000368202 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.08■□□□□ 0.49
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PTPRK-201ENST00000368202 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRK-201ENST00000368202 KIF15Q9NS87 1388 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRK-201ENST00000368202 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRK-201ENST00000368202 HRCP23327 699 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRK-201ENST00000368202 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRK-201ENST00000368202 DUOX2Q9NRD8 1548 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRK-201ENST00000368202 RAPGEF3O95398 923 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRK-201ENST00000368202 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRK-201ENST00000368202 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.02■□□□□ 0.48
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PTPRK-201ENST00000368202 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa18■□□□□ 0.47
PTPRK-201ENST00000368202 ERBINQ96RT1 1412 aa17.98■□□□□ 0.47
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PTPRK-201ENST00000368202 MAGI2Q86UL8 1455 aa17.97■□□□□ 0.47
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PTPRK-201ENST00000368202 A2MP01023 1474 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-201ENST00000368202 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-201ENST00000368202 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-201ENST00000368202 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-201ENST00000368202 UNC13BO14795 1591 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-201ENST00000368202 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-201ENST00000368202 YEATS2Q9ULM3 1422 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRK-201ENST00000368202 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRK-201ENST00000368202 KIF3BO15066 747 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRK-201ENST00000368202 ATP10AO60312 1499 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRK-201ENST00000368202 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.87■□□□□ 0.45
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