RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRK-201ENST00000368202 ABCC9O60706 1549 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-201ENST00000368202 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRK-201ENST00000368202 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-201ENST00000368202 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRK-201ENST00000368202 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRK-201ENST00000368202 NACADO15069 1562 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRK-201ENST00000368202 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRK-201ENST00000368202 SCRIBQ14160 1630 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-201ENST00000368202 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRK-201ENST00000368202 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-201ENST00000368202 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-201ENST00000368202 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-201ENST00000368202 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRK-201ENST00000368202 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRK-201ENST00000368202 SMARCA4P51532 1647 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRK-201ENST00000368202 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRK-201ENST00000368202 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PTPRK-201ENST00000368202 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRK-201ENST00000368202 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRK-201ENST00000368202 WIZO95785 1651 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRK-201ENST00000368202 SMARCA2P51531 1590 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRK-201ENST00000368202 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRK-201ENST00000368202 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRK-201ENST00000368202 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRK-201ENST00000368202 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.45■■□□□ 1.03
PTPRK-201ENST00000368202 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRK-201ENST00000368202 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRK-201ENST00000368202 HMGXB3Q12766 1538 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRK-201ENST00000368202 NCAPD3P42695 1498 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRK-201ENST00000368202 PRDM2Q13029 1718 aa20.83■□□□□ 0.92
PTPRK-201ENST00000368202 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-201ENST00000368202 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-201ENST00000368202 CFTRP13569 1480 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-201ENST00000368202 NESP48681 1621 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRK-201ENST00000368202 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRK-201ENST00000368202 ABCC8Q09428 1581 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRK-201ENST00000368202 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRK-201ENST00000368202 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRK-201ENST00000368202 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRK-201ENST00000368202 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM41Q8WV44 630 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRK-201ENST00000368202 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
PTPRK-201ENST00000368202 ERCC6Q03468 1493 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRK-201ENST00000368202 SYNJ1O43426 1573 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRK-201ENST00000368202 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRK-201ENST00000368202 TOP2BQ02880 1626 aa20.39■□□□□ 0.86
PTPRK-201ENST00000368202 CUX1P39880 1505 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRK-201ENST00000368202 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-201ENST00000368202 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRK-201ENST00000368202 TOPBP1Q92547 1522 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRK-201ENST00000368202 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRK-201ENST00000368202 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRK-201ENST00000368202 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRK-201ENST00000368202 WDR62O43379 1518 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRK-201ENST00000368202 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRK-201ENST00000368202 SOGA1O94964 1423 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-201ENST00000368202 EEA1Q15075 1411 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRK-201ENST00000368202 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-201ENST00000368202 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-201ENST00000368202 WDR97A6NE52 1622 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-201ENST00000368202 CUX2O14529 1486 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRK-201ENST00000368202 KIF27Q86VH2 1401 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRK-201ENST00000368202 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRK-201ENST00000368202 IFT140Q96RY7 1462 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRK-201ENST00000368202 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
PTPRK-201ENST00000368202 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRK-201ENST00000368202 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRK-201ENST00000368202 PBRM1Q86U86 1689 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
PTPRK-201ENST00000368202 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRK-201ENST00000368202 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CUL7Q14999 1698 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
PTPRK-201ENST00000368202 KIF21BO75037 1637 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRK-201ENST00000368202 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.83■□□□□ 0.769e-8■■■■■ 30.5
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PTPRK-201ENST00000368202 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRK-201ENST00000368202 IGF1RP08069 1367 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRK-201ENST00000368202 GOLGA3Q08378 1498 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-201ENST00000368202 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRK-201ENST00000368202 PRXQ9BXM0 1461 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRK-201ENST00000368202 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ADAMTS12P58397 1594 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.7■□□□□ 0.74
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PTPRK-201ENST00000368202 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRK-201ENST00000368202 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRK-201ENST00000368202 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SYNJ2O15056 1496 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
PTPRK-201ENST00000368202 FBLN2P98095 1184 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRK-201ENST00000368202 CHD1O14646 1710 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRK-201ENST00000368202 GRIN2AQ12879 1464 aa19.54■□□□□ 0.72
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