RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
OPN3-201ENST00000366554 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.02■■■□□ 2.24
OPN3-201ENST00000366554 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29■■■□□ 2.23
OPN3-201ENST00000366554 MTUS2Q5JR59 1369 aa29■■■□□ 2.23
OPN3-201ENST00000366554 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.99■■■□□ 2.23
OPN3-201ENST00000366554 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
OPN3-201ENST00000366554 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.98■■■□□ 2.23
OPN3-201ENST00000366554 NFKBIBQ15653 356 aa28.96■■■□□ 2.23
OPN3-201ENST00000366554 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
OPN3-201ENST00000366554 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.95■■■□□ 2.23
OPN3-201ENST00000366554 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
OPN3-201ENST00000366554 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.93■■■□□ 2.22
OPN3-201ENST00000366554 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.92■■■□□ 2.22
OPN3-201ENST00000366554 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.92■■■□□ 2.22
OPN3-201ENST00000366554 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.91■■■□□ 2.22
OPN3-201ENST00000366554 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.9■■■□□ 2.22
OPN3-201ENST00000366554 HMGXB3Q12766 1538 aa28.9■■■□□ 2.22
OPN3-201ENST00000366554 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.88■■■□□ 2.21
OPN3-201ENST00000366554 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.88■■■□□ 2.21
OPN3-201ENST00000366554 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
OPN3-201ENST00000366554 KDM6BO15054 1643 aa28.85■■■□□ 2.21
OPN3-201ENST00000366554 MIA2Q96PC5 1412 aa28.84■■■□□ 2.21
OPN3-201ENST00000366554 FAM43AQ8N2R8 423 aa28.84■■■□□ 2.21
OPN3-201ENST00000366554 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
OPN3-201ENST00000366554 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.82■■■□□ 2.2
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.81■■■□□ 2.2
OPN3-201ENST00000366554 FOXD1Q16676 465 aa28.81■■■□□ 2.2
OPN3-201ENST00000366554 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.8■■■□□ 2.2
OPN3-201ENST00000366554 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
OPN3-201ENST00000366554 TMC1Q8TDI8 760 aa28.79■■■□□ 2.2
OPN3-201ENST00000366554 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
OPN3-201ENST00000366554 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
OPN3-201ENST00000366554 ARHGEF11O15085 1522 aa28.76■■■□□ 2.19
OPN3-201ENST00000366554 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-201ENST00000366554 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-201ENST00000366554 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.73■■■□□ 2.19
OPN3-201ENST00000366554 SLC4A3P48751 1232 aa28.72■■■□□ 2.19
OPN3-201ENST00000366554 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
OPN3-201ENST00000366554 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.71■■■□□ 2.19
OPN3-201ENST00000366554 PRDM2Q13029 1718 aa28.71■■■□□ 2.19
OPN3-201ENST00000366554 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.71■■■□□ 2.19
OPN3-201ENST00000366554 GRIN2BQ13224 1484 aa28.68■■■□□ 2.18
OPN3-201ENST00000366554 SKAP1Q86WV1 359 aa28.67■■■□□ 2.18
OPN3-201ENST00000366554 PKNOX2Q96KN3 472 aa28.66■■■□□ 2.18
OPN3-201ENST00000366554 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
OPN3-201ENST00000366554 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.65■■■□□ 2.18
OPN3-201ENST00000366554 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
OPN3-201ENST00000366554 PDE3BQ13370 1112 aa28.64■■■□□ 2.18
OPN3-201ENST00000366554 USP47Q96K76 1375 aa28.64■■■□□ 2.18
OPN3-201ENST00000366554 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
OPN3-201ENST00000366554 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
OPN3-201ENST00000366554 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.63■■■□□ 2.17
OPN3-201ENST00000366554 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
OPN3-201ENST00000366554 KIF15Q9NS87 1388 aa28.6■■■□□ 2.17
OPN3-201ENST00000366554 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
OPN3-201ENST00000366554 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.58■■■□□ 2.17
OPN3-201ENST00000366554 MBD5Q9P267 1494 aa28.57■■■□□ 2.16
OPN3-201ENST00000366554 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
OPN3-201ENST00000366554 SAMD9Q5K651 1589 aa28.56■■■□□ 2.16
OPN3-201ENST00000366554 CRBNQ96SW2 442 aa28.54■■■□□ 2.16
OPN3-201ENST00000366554 PLIN1O60240 522 aa28.53■■■□□ 2.16
OPN3-201ENST00000366554 RALBP1Q15311 655 aa28.53■■■□□ 2.16
OPN3-201ENST00000366554 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.53■■■□□ 2.16
OPN3-201ENST00000366554 KDM5CP41229 1560 aa28.53■■■□□ 2.16
OPN3-201ENST00000366554 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.53■■■□□ 2.16
OPN3-201ENST00000366554 CUL7Q14999 1698 aa28.51■■■□□ 2.15
OPN3-201ENST00000366554 C8orf34Q49A92 452 aa28.5■■■□□ 2.15
OPN3-201ENST00000366554 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.5■■■□□ 2.15
OPN3-201ENST00000366554 FAM161AQ3B820 660 aa28.5■■■□□ 2.15
OPN3-201ENST00000366554 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
OPN3-201ENST00000366554 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
OPN3-201ENST00000366554 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.48■■■□□ 2.15
OPN3-201ENST00000366554 ROCK1Q13464 1354 aa28.47■■■□□ 2.15
OPN3-201ENST00000366554 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa28.46■■■□□ 2.15
OPN3-201ENST00000366554 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.45■■■□□ 2.14
OPN3-201ENST00000366554 KIF14Q15058 1648 aa28.43■■■□□ 2.14
OPN3-201ENST00000366554 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
OPN3-201ENST00000366554 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.4■■■□□ 2.14
OPN3-201ENST00000366554 NLRP13Q86W25 1043 aa28.4■■■□□ 2.14
OPN3-201ENST00000366554 POGKQ9P215 609 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-201ENST00000366554 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-201ENST00000366554 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
OPN3-201ENST00000366554 DAPK1P53355 1430 aa28.36■■■□□ 2.13
OPN3-201ENST00000366554 PZPP20742 1482 aa28.34■■■□□ 2.13
OPN3-201ENST00000366554 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.34■■■□□ 2.13
OPN3-201ENST00000366554 ZMYND15Q9H091 742 aa28.34■■■□□ 2.13
OPN3-201ENST00000366554 INSRP06213 1382 aa28.33■■■□□ 2.12
OPN3-201ENST00000366554 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.32■■■□□ 2.12
OPN3-201ENST00000366554 E9PCH4 1651 aa28.32■■■□□ 2.12
OPN3-201ENST00000366554 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.32■■■□□ 2.12
OPN3-201ENST00000366554 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
OPN3-201ENST00000366554 ABCC5O15440 1437 aa28.3■■■□□ 2.12
OPN3-201ENST00000366554 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.28■■■□□ 2.12
OPN3-201ENST00000366554 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.28■■■□□ 2.12
OPN3-201ENST00000366554 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
OPN3-201ENST00000366554 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.28■■■□□ 2.12
OPN3-201ENST00000366554 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
OPN3-201ENST00000366554 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.26■■■□□ 2.12
OPN3-201ENST00000366554 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.25■■■□□ 2.11
OPN3-201ENST00000366554 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms