RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340766.9

PPP1CC-202, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-202ENST00000340766 FGD6Q6ZV73 1430 aa44.05■■■■■ 4.64
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PPP1CC-202ENST00000340766 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
PPP1CC-202ENST00000340766 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.01■■■■■ 4.64
PPP1CC-202ENST00000340766 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.99■■■■■ 4.63
PPP1CC-202ENST00000340766 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
PPP1CC-202ENST00000340766 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
PPP1CC-202ENST00000340766 FANCAO15360 1455 aa43.95■■■■■ 4.63
PPP1CC-202ENST00000340766 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
PPP1CC-202ENST00000340766 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.93■■■■■ 4.62
PPP1CC-202ENST00000340766 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.91■■■■■ 4.62
PPP1CC-202ENST00000340766 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
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PPP1CC-202ENST00000340766 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.89■■■■■ 4.62
PPP1CC-202ENST00000340766 NEO1Q92859 1461 aa43.86■■■■■ 4.61
PPP1CC-202ENST00000340766 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
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PPP1CC-202ENST00000340766 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.8■■■■■ 4.6
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PPP1CC-202ENST00000340766 ADGRL1O94910 1474 aa43.74■■■■■ 4.59
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PPP1CC-202ENST00000340766 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.67■■■■■ 4.58
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PPP1CC-202ENST00000340766 MBD5Q9P267 1494 aa43.64■■■■■ 4.58
PPP1CC-202ENST00000340766 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.63■■■■■ 4.57
PPP1CC-202ENST00000340766 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.62■■■■■ 4.57
PPP1CC-202ENST00000340766 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.58■■■■■ 4.57
PPP1CC-202ENST00000340766 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.58■■■■■ 4.57
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PPP1CC-202ENST00000340766 DAPK1P53355 1430 aa43.55■■■■■ 4.56
PPP1CC-202ENST00000340766 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
PPP1CC-202ENST00000340766 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.54■■■■■ 4.56
PPP1CC-202ENST00000340766 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.54■■■■■ 4.56
PPP1CC-202ENST00000340766 ABCC5O15440 1437 aa43.52■■■■■ 4.56
PPP1CC-202ENST00000340766 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43.51■■■■■ 4.56
PPP1CC-202ENST00000340766 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.51■■■■■ 4.56
PPP1CC-202ENST00000340766 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.49■■■■■ 4.55
PPP1CC-202ENST00000340766 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.47■■■■■ 4.55
PPP1CC-202ENST00000340766 KDM5CP41229 1560 aa43.47■■■■■ 4.55
PPP1CC-202ENST00000340766 KDM6BO15054 1643 aa43.44■■■■■ 4.54
PPP1CC-202ENST00000340766 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.43■■■■■ 4.54
PPP1CC-202ENST00000340766 ADGBQ8N7X0 1667 aa43.43■■■■■ 4.54
PPP1CC-202ENST00000340766 ITGAEP38570 1179 aa43.42■■■■■ 4.54
PPP1CC-202ENST00000340766 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
PPP1CC-202ENST00000340766 PTPRKQ15262 1439 aa43.4■■■■■ 4.54
PPP1CC-202ENST00000340766 AFAP1Q8N556 730 aa43.39■■■■■ 4.54
PPP1CC-202ENST00000340766 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.38■■■■■ 4.54
PPP1CC-202ENST00000340766 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.53
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PPP1CC-202ENST00000340766 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.37■■■■■ 4.53
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PPP1CC-202ENST00000340766 TSPY4P0CV99 314 aa43.36■■■■■ 4.53
PPP1CC-202ENST00000340766 TSPY10P0CW01 314 aa43.36■■■■■ 4.53
PPP1CC-202ENST00000340766 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.35■■■■■ 4.53
PPP1CC-202ENST00000340766 ATP7AQ04656 1500 aa43.32■■■■■ 4.53
PPP1CC-202ENST00000340766 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa43.31■■■■■ 4.52
PPP1CC-202ENST00000340766 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
PPP1CC-202ENST00000340766 ADGRL2O95490 1459 aa43.3■■■■■ 4.52
PPP1CC-202ENST00000340766 MLH3Q9UHC1 1453 aa43.29■■■■■ 4.52
PPP1CC-202ENST00000340766 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa43.28■■■■■ 4.52
PPP1CC-202ENST00000340766 PLXNC1O60486 1568 aa43.28■■■■■ 4.52
PPP1CC-202ENST00000340766 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.25■■■■■ 4.51
PPP1CC-202ENST00000340766 ROCK1Q13464 1354 aa43.24■■■■■ 4.51
PPP1CC-202ENST00000340766 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.21■■■■■ 4.51
PPP1CC-202ENST00000340766 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa43.2■■■■■ 4.51
PPP1CC-202ENST00000340766 NCOA1Q15788 1441 aa43.18■■■■■ 4.5
PPP1CC-202ENST00000340766 GCC2Q8IWJ2 1684 aa43.18■■■■■ 4.5
PPP1CC-202ENST00000340766 ABCA6Q8N139 1617 aa43.18■■■■■ 4.5
PPP1CC-202ENST00000340766 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.15■■■■■ 4.5
PPP1CC-202ENST00000340766 MYT1LQ9UL68 1186 aa43.15■■■■■ 4.5
PPP1CC-202ENST00000340766 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa43.13■■■■■ 4.5
PPP1CC-202ENST00000340766 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.13■■■■■ 4.5
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PPP1CC-202ENST00000340766 HFM1A2PYH4 1435 aa43.09■■■■■ 4.49
PPP1CC-202ENST00000340766 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.08■■■■■ 4.49
PPP1CC-202ENST00000340766 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.06■■■■■ 4.48
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PPP1CC-202ENST00000340766 NAIPQ13075 1403 aa43.05■■■■■ 4.48
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PPP1CC-202ENST00000340766 REREQ9P2R6 1566 aa42.96■■■■■ 4.47
PPP1CC-202ENST00000340766 ATP10AO60312 1499 aa42.95■■■■■ 4.47
PPP1CC-202ENST00000340766 ERBINQ96RT1 1412 aa42.93■■■■■ 4.46
PPP1CC-202ENST00000340766 SETD5Q9C0A6 1442 aa42.93■■■■■ 4.46
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PPP1CC-202ENST00000340766 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.83■■■■■ 4.45
PPP1CC-202ENST00000340766 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.82■■■■■ 4.45
PPP1CC-202ENST00000340766 AGLP35573 1532 aa42.78■■■■■ 4.44
PPP1CC-202ENST00000340766 DEPDC5O75140 1603 aa42.74■■■■■ 4.43
PPP1CC-202ENST00000340766 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
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PPP1CC-202ENST00000340766 KIF3BO15066 747 aa42.67■■■■■ 4.42
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