RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262055.8

LETMD1-201, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LETMD1, Length 2,112 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-201ENST00000262055 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.2■■□□□ 1.15
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LETMD1-201ENST00000262055 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.19■■□□□ 1.14
LETMD1-201ENST00000262055 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.19■■□□□ 1.14
LETMD1-201ENST00000262055 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LETMD1-201ENST00000262055 CD109Q6YHK3 1445 aa22.16■■□□□ 1.14
LETMD1-201ENST00000262055 PLCH2O75038 1416 aa22.15■■□□□ 1.14
LETMD1-201ENST00000262055 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.14■■□□□ 1.13
LETMD1-201ENST00000262055 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.12■■□□□ 1.13
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LETMD1-201ENST00000262055 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.11■■□□□ 1.13
LETMD1-201ENST00000262055 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LETMD1-201ENST00000262055 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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LETMD1-201ENST00000262055 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.09■■□□□ 1.13
LETMD1-201ENST00000262055 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
LETMD1-201ENST00000262055 MIA2Q96PC5 1412 aa22.08■■□□□ 1.13
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LETMD1-201ENST00000262055 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.06■■□□□ 1.12
LETMD1-201ENST00000262055 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LETMD1-201ENST00000262055 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.02■■□□□ 1.12
LETMD1-201ENST00000262055 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.02■■□□□ 1.12
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LETMD1-201ENST00000262055 SYCP2Q9BX26 1530 aa22■■□□□ 1.11
LETMD1-201ENST00000262055 AKNAQ7Z591 1439 aa21.99■■□□□ 1.11
LETMD1-201ENST00000262055 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.98■■□□□ 1.11
LETMD1-201ENST00000262055 NEO1Q92859 1461 aa21.97■■□□□ 1.11
LETMD1-201ENST00000262055 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
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LETMD1-201ENST00000262055 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.95■■□□□ 1.1
LETMD1-201ENST00000262055 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
LETMD1-201ENST00000262055 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
LETMD1-201ENST00000262055 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.93■■□□□ 1.1
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LETMD1-201ENST00000262055 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.92■■□□□ 1.1
LETMD1-201ENST00000262055 ITGAEP38570 1179 aa21.91■■□□□ 1.1
LETMD1-201ENST00000262055 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.91■■□□□ 1.1
LETMD1-201ENST00000262055 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.91■■□□□ 1.1
LETMD1-201ENST00000262055 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
LETMD1-201ENST00000262055 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.91■■□□□ 1.1
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LETMD1-201ENST00000262055 DAPK1P53355 1430 aa21.89■■□□□ 1.1
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LETMD1-201ENST00000262055 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LETMD1-201ENST00000262055 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.78■■□□□ 1.08
LETMD1-201ENST00000262055 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.78■■□□□ 1.08
LETMD1-201ENST00000262055 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.78■■□□□ 1.08
LETMD1-201ENST00000262055 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.78■■□□□ 1.08
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LETMD1-201ENST00000262055 KDM6BO15054 1643 aa21.77■■□□□ 1.08
LETMD1-201ENST00000262055 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.75■■□□□ 1.07
LETMD1-201ENST00000262055 TSPY4P0CV99 314 aa21.74■■□□□ 1.07
LETMD1-201ENST00000262055 TSPY10P0CW01 314 aa21.74■■□□□ 1.07
LETMD1-201ENST00000262055 ATP7AQ04656 1500 aa21.74■■□□□ 1.07
LETMD1-201ENST00000262055 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LETMD1-201ENST00000262055 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.74■■□□□ 1.07
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LETMD1-201ENST00000262055 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.72■■□□□ 1.07
LETMD1-201ENST00000262055 ABCA6Q8N139 1617 aa21.71■■□□□ 1.07
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LETMD1-201ENST00000262055 ROCK1Q13464 1354 aa21.69■■□□□ 1.06
LETMD1-201ENST00000262055 NAIPQ13075 1403 aa21.67■■□□□ 1.06
LETMD1-201ENST00000262055 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.67■■□□□ 1.06
LETMD1-201ENST00000262055 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.67■■□□□ 1.06
LETMD1-201ENST00000262055 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.66■■□□□ 1.06
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LETMD1-201ENST00000262055 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.63■■□□□ 1.05
LETMD1-201ENST00000262055 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.62■■□□□ 1.05
LETMD1-201ENST00000262055 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.62■■□□□ 1.05
LETMD1-201ENST00000262055 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.59■■□□□ 1.05
LETMD1-201ENST00000262055 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.58■■□□□ 1.05
LETMD1-201ENST00000262055 A2MP01023 1474 aa21.57■■□□□ 1.04
LETMD1-201ENST00000262055 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.57■■□□□ 1.04
LETMD1-201ENST00000262055 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.57■■□□□ 1.04
LETMD1-201ENST00000262055 ATP10AO60312 1499 aa21.55■■□□□ 1.04
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