RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
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CSNK1G2-201ENST00000255641 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.09■■■□□ 2.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.09■■■□□ 2.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 IQGAP2Q13576 1575 aa29.08■■■□□ 2.25
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CSNK1G2-201ENST00000255641 KIAA0556O60303 1618 aa28.76■■■□□ 2.19
CSNK1G2-201ENST00000255641 HECW1Q76N89 1606 aa28.75■■■□□ 2.19
CSNK1G2-201ENST00000255641 NUDCQ9Y266 331 aa28.73■■■□□ 2.19
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.73■■■□□ 2.19
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CSNK1G2-201ENST00000255641 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.67■■■□□ 2.18
CSNK1G2-201ENST00000255641 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.66■■■□□ 2.18
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CSNK1G2-201ENST00000255641 ABCC5O15440 1437 aa28.53■■■□□ 2.16
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CSNK1G2-201ENST00000255641 IL27Q8NEV9 243 aa28.52■■■□□ 2.16
CSNK1G2-201ENST00000255641 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.51■■■□□ 2.16
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CSNK1G2-201ENST00000255641 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.41■■■□□ 2.14
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CSNK1G2-201ENST00000255641 PDE4AP27815 886 aa28.36■■■□□ 2.13
CSNK1G2-201ENST00000255641 NEFMP07197 916 aa28.36■■■□□ 2.13
CSNK1G2-201ENST00000255641 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.35■■■□□ 2.13
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATP10BO94823 1461 aa28.34■■■□□ 2.13
CSNK1G2-201ENST00000255641 ROCK1Q13464 1354 aa28.34■■■□□ 2.13
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.3■■■□□ 2.12
CSNK1G2-201ENST00000255641 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.29■■■□□ 2.12
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC4A3P48751 1232 aa28.29■■■□□ 2.12
CSNK1G2-201ENST00000255641 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CSNK1G2-201ENST00000255641 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.125e-11■■■■□ 20.3
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