RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243189.11

RSRP1-201, Transcript of arginine and serine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RSRP1, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1-201ENST00000243189 PREX2Q70Z35 1606 aa26.1■■□□□ 1.77
RSRP1-201ENST00000243189 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.1■■□□□ 1.77
RSRP1-201ENST00000243189 FANCAO15360 1455 aa26.1■■□□□ 1.77
RSRP1-201ENST00000243189 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.08■■□□□ 1.77
RSRP1-201ENST00000243189 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.07■■□□□ 1.76
RSRP1-201ENST00000243189 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.06■■□□□ 1.76
RSRP1-201ENST00000243189 NEO1Q92859 1461 aa26.05■■□□□ 1.76
RSRP1-201ENST00000243189 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
RSRP1-201ENST00000243189 AKNAQ7Z591 1439 aa26.03■■□□□ 1.76
RSRP1-201ENST00000243189 MIA2Q96PC5 1412 aa26.02■■□□□ 1.76
RSRP1-201ENST00000243189 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.01■■□□□ 1.75
RSRP1-201ENST00000243189 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.99■■□□□ 1.75
RSRP1-201ENST00000243189 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
RSRP1-201ENST00000243189 ADGRL1O94910 1474 aa25.97■■□□□ 1.75
RSRP1-201ENST00000243189 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.96■■□□□ 1.75
RSRP1-201ENST00000243189 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.94■■□□□ 1.74
RSRP1-201ENST00000243189 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.92■■□□□ 1.74
RSRP1-201ENST00000243189 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.92■■□□□ 1.74
RSRP1-201ENST00000243189 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.92■■□□□ 1.74
RSRP1-201ENST00000243189 ABCC1P33527 1531 aa25.92■■□□□ 1.74
RSRP1-201ENST00000243189 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
RSRP1-201ENST00000243189 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
RSRP1-201ENST00000243189 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.9■■□□□ 1.74
RSRP1-201ENST00000243189 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.9■■□□□ 1.74
RSRP1-201ENST00000243189 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
RSRP1-201ENST00000243189 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
RSRP1-201ENST00000243189 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.88■■□□□ 1.73
RSRP1-201ENST00000243189 RAPGEF3O95398 923 aa25.88■■□□□ 1.73
RSRP1-201ENST00000243189 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
RSRP1-201ENST00000243189 KDM6BO15054 1643 aa25.87■■□□□ 1.73
RSRP1-201ENST00000243189 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
RSRP1-201ENST00000243189 MBD5Q9P267 1494 aa25.85■■□□□ 1.73
RSRP1-201ENST00000243189 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.85■■□□□ 1.73
RSRP1-201ENST00000243189 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.85■■□□□ 1.73
RSRP1-201ENST00000243189 AFAP1Q8N556 730 aa25.83■■□□□ 1.73
RSRP1-201ENST00000243189 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.82■■□□□ 1.72
RSRP1-201ENST00000243189 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.81■■□□□ 1.72
RSRP1-201ENST00000243189 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
RSRP1-201ENST00000243189 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.79■■□□□ 1.72
RSRP1-201ENST00000243189 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.78■■□□□ 1.72
RSRP1-201ENST00000243189 RICTORQ6R327 1708 aa25.78■■□□□ 1.72
RSRP1-201ENST00000243189 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.77■■□□□ 1.72
RSRP1-201ENST00000243189 ABCC5O15440 1437 aa25.74■■□□□ 1.71
RSRP1-201ENST00000243189 KDM5CP41229 1560 aa25.74■■□□□ 1.71
RSRP1-201ENST00000243189 TSPY4P0CV99 314 aa25.73■■□□□ 1.71
RSRP1-201ENST00000243189 TSPY10P0CW01 314 aa25.73■■□□□ 1.71
RSRP1-201ENST00000243189 DAPK1P53355 1430 aa25.73■■□□□ 1.71
RSRP1-201ENST00000243189 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
RSRP1-201ENST00000243189 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.71■■□□□ 1.71
RSRP1-201ENST00000243189 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.71■■□□□ 1.71
RSRP1-201ENST00000243189 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
RSRP1-201ENST00000243189 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.69■■□□□ 1.7
RSRP1-201ENST00000243189 ITGAEP38570 1179 aa25.68■■□□□ 1.7
RSRP1-201ENST00000243189 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.68■■□□□ 1.7
RSRP1-201ENST00000243189 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.66■■□□□ 1.7
RSRP1-201ENST00000243189 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.66■■□□□ 1.7
RSRP1-201ENST00000243189 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.66■■□□□ 1.7
RSRP1-201ENST00000243189 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.65■■□□□ 1.7
RSRP1-201ENST00000243189 PTPRKQ15262 1439 aa25.64■■□□□ 1.7
RSRP1-201ENST00000243189 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.64■■□□□ 1.69
RSRP1-201ENST00000243189 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.63■■□□□ 1.69
RSRP1-201ENST00000243189 ATP7AQ04656 1500 aa25.63■■□□□ 1.69
RSRP1-201ENST00000243189 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.63■■□□□ 1.69
RSRP1-201ENST00000243189 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
RSRP1-201ENST00000243189 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.62■■□□□ 1.69
RSRP1-201ENST00000243189 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.62■■□□□ 1.69
RSRP1-201ENST00000243189 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.61■■□□□ 1.69
RSRP1-201ENST00000243189 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.57■■□□□ 1.68
RSRP1-201ENST00000243189 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.56■■□□□ 1.68
RSRP1-201ENST00000243189 ABCA6Q8N139 1617 aa25.55■■□□□ 1.68
RSRP1-201ENST00000243189 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.55■■□□□ 1.68
RSRP1-201ENST00000243189 ADGRL2O95490 1459 aa25.55■■□□□ 1.68
RSRP1-201ENST00000243189 NCOA1Q15788 1441 aa25.55■■□□□ 1.68
RSRP1-201ENST00000243189 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.54■■□□□ 1.68
RSRP1-201ENST00000243189 ATP10AO60312 1499 aa25.54■■□□□ 1.68
RSRP1-201ENST00000243189 ROCK1Q13464 1354 aa25.53■■□□□ 1.68
RSRP1-201ENST00000243189 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
RSRP1-201ENST00000243189 PLXNC1O60486 1568 aa25.52■■□□□ 1.68
RSRP1-201ENST00000243189 KIF15Q9NS87 1388 aa25.51■■□□□ 1.67
RSRP1-201ENST00000243189 A2MP01023 1474 aa25.49■■□□□ 1.67
RSRP1-201ENST00000243189 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.49■■□□□ 1.67
RSRP1-201ENST00000243189 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
RSRP1-201ENST00000243189 REREQ9P2R6 1566 aa25.46■■□□□ 1.67
RSRP1-201ENST00000243189 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.44■■□□□ 1.66
RSRP1-201ENST00000243189 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
RSRP1-201ENST00000243189 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.4■■□□□ 1.66
RSRP1-201ENST00000243189 HFM1A2PYH4 1435 aa25.39■■□□□ 1.65
RSRP1-201ENST00000243189 NAIPQ13075 1403 aa25.39■■□□□ 1.65
RSRP1-201ENST00000243189 ERBINQ96RT1 1412 aa25.39■■□□□ 1.65
RSRP1-201ENST00000243189 AGLP35573 1532 aa25.39■■□□□ 1.65
RSRP1-201ENST00000243189 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.39■■□□□ 1.65
RSRP1-201ENST00000243189 KIF3BO15066 747 aa25.37■■□□□ 1.65
RSRP1-201ENST00000243189 MLECQ14165 292 aa25.32■■□□□ 1.64
RSRP1-201ENST00000243189 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
RSRP1-201ENST00000243189 GGT6Q6P531 493 aa25.31■■□□□ 1.64
RSRP1-201ENST00000243189 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.3■■□□□ 1.64
RSRP1-201ENST00000243189 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.28■■□□□ 1.64
RSRP1-201ENST00000243189 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.27■■□□□ 1.64
RSRP1-201ENST00000243189 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.27■■□□□ 1.64
RSRP1-201ENST00000243189 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.632e-7■■■□□ 15.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms