RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000159111.8

KDM4B-201, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDM4B, Length 5,593 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-201ENST00000159111 RALBP1Q15311 655 aa21.99■■□□□ 1.11
KDM4B-201ENST00000159111 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.99■■□□□ 1.11
KDM4B-201ENST00000159111 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
KDM4B-201ENST00000159111 RGS3P49796 1198 aa21.97■■□□□ 1.11
KDM4B-201ENST00000159111 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.97■■□□□ 1.11
KDM4B-201ENST00000159111 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
KDM4B-201ENST00000159111 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.96■■□□□ 1.11
KDM4B-201ENST00000159111 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
KDM4B-201ENST00000159111 FOXD1Q16676 465 aa21.94■■□□□ 1.1
KDM4B-201ENST00000159111 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.93■■□□□ 1.1
KDM4B-201ENST00000159111 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
KDM4B-201ENST00000159111 GGT6Q6P531 493 aa21.9■■□□□ 1.1
KDM4B-201ENST00000159111 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.89■■□□□ 1.09
KDM4B-201ENST00000159111 CFAP44Q96MT7 982 aa21.89■■□□□ 1.09
KDM4B-201ENST00000159111 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
KDM4B-201ENST00000159111 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
KDM4B-201ENST00000159111 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.86■■□□□ 1.09
KDM4B-201ENST00000159111 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
KDM4B-201ENST00000159111 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
KDM4B-201ENST00000159111 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
KDM4B-201ENST00000159111 MLECQ14165 292 aa21.83■■□□□ 1.09
KDM4B-201ENST00000159111 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
KDM4B-201ENST00000159111 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
KDM4B-201ENST00000159111 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.081e-6■■□□□ 11.5
KDM4B-201ENST00000159111 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.8■■□□□ 1.08
KDM4B-201ENST00000159111 HSCBQ8IWL3 235 aa21.8■■□□□ 1.08
KDM4B-201ENST00000159111 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.086e-7■■■■□ 19.6
KDM4B-201ENST00000159111 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
KDM4B-201ENST00000159111 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.79■■□□□ 1.08
KDM4B-201ENST00000159111 STK26Q9P289 416 aa21.79■■□□□ 1.08
KDM4B-201ENST00000159111 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
KDM4B-201ENST00000159111 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
KDM4B-201ENST00000159111 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.77■■□□□ 1.07
KDM4B-201ENST00000159111 MCCP23508 829 aa21.75■■□□□ 1.07
KDM4B-201ENST00000159111 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.75■■□□□ 1.07
KDM4B-201ENST00000159111 KIF3BO15066 747 aa21.74■■□□□ 1.07
KDM4B-201ENST00000159111 JPH4Q96JJ6 628 aa21.74■■□□□ 1.07
KDM4B-201ENST00000159111 KCNJ4P48050 445 aa21.72■■□□□ 1.07
KDM4B-201ENST00000159111 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
KDM4B-201ENST00000159111 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
KDM4B-201ENST00000159111 KIF15Q9NS87 1388 aa21.71■■□□□ 1.07
KDM4B-201ENST00000159111 PDE3BQ13370 1112 aa21.71■■□□□ 1.07
KDM4B-201ENST00000159111 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 NLRP13Q86W25 1043 aa21.7■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.7■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 UACAQ9BZF9 1416 aa21.69■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 FGD1P98174 961 aa21.69■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 SOX12O15370 315 aa21.68■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.68■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.67■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.66■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.66■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.66■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 CUX1P39880 1505 aa21.65■■□□□ 1.06
KDM4B-201ENST00000159111 GOLGA2Q08379 1002 aa21.64■■□□□ 1.05
KDM4B-201ENST00000159111 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.64■■□□□ 1.05
KDM4B-201ENST00000159111 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
KDM4B-201ENST00000159111 NPHP1O15259 732 aa21.63■■□□□ 1.05
KDM4B-201ENST00000159111 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
KDM4B-201ENST00000159111 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.62■■□□□ 1.05
KDM4B-201ENST00000159111 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.62■■□□□ 1.05
KDM4B-201ENST00000159111 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
KDM4B-201ENST00000159111 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.61■■□□□ 1.05
KDM4B-201ENST00000159111 PTMSP20962 102 aa21.61■■□□□ 1.05
KDM4B-201ENST00000159111 PTPRGP23470 1445 aa21.61■■□□□ 1.05
KDM4B-201ENST00000159111 IGF1RP08069 1367 aa21.59■■□□□ 1.05
KDM4B-201ENST00000159111 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.57■■□□□ 1.04
KDM4B-201ENST00000159111 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.57■■□□□ 1.04
KDM4B-201ENST00000159111 EID1Q9Y6B2 187 aa21.56■■□□□ 1.04
KDM4B-201ENST00000159111 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.56■■□□□ 1.04
KDM4B-201ENST00000159111 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
KDM4B-201ENST00000159111 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
KDM4B-201ENST00000159111 NRDCO43847 1150 aa21.54■■□□□ 1.04
KDM4B-201ENST00000159111 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.54■■□□□ 1.04
KDM4B-201ENST00000159111 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
KDM4B-201ENST00000159111 NCAPD3P42695 1498 aa21.53■■□□□ 1.04
KDM4B-201ENST00000159111 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.53■■□□□ 1.04
KDM4B-201ENST00000159111 KIF21BO75037 1637 aa21.53■■□□□ 1.04
KDM4B-201ENST00000159111 STK31Q9BXU1 1019 aa21.53■■□□□ 1.04
KDM4B-201ENST00000159111 PLCB2Q00722 1185 aa21.52■■□□□ 1.04
KDM4B-201ENST00000159111 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.51■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.51■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.51■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 USP47Q96K76 1375 aa21.51■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 GBP4Q96PP9 640 aa21.5■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.49■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 HMMRO75330 724 aa21.49■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 PANK3Q9H999 370 aa21.48■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.48■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.48■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.47■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.46■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.46■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 APBB1O00213 710 aa21.45■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
KDM4B-201ENST00000159111 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms