RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000099514.9

Sgms1-201, Transcript of Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sgms1, Length 3,665 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1-201ENSMUST00000099514 UacaQ8CGB3 1411 aa20.98■□□□□ 0.95
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Crocc2F6XLV1 1638 aa20.98■□□□□ 0.95
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Mrc2Q64449 1479 aa20.96■□□□□ 0.95
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Ofd1Q80Z25 1017 aa20.96■□□□□ 0.95
Sgms1-201ENSMUST00000099514 NexmifQ5DTT1 1515 aa20.96■□□□□ 0.95
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Gpatch8A2A6A1 1505 aa20.95■□□□□ 0.94
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Erich3F6QRE9 1637 aa20.93■□□□□ 0.94
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Grin2aP35436 1464 aa20.92■□□□□ 0.94
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa20.92■□□□□ 0.94
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Pla2r1Q62028 1487 aa20.88■□□□□ 0.93
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Ift140E9PY46 1464 aa20.88■□□□□ 0.93
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
Sgms1-201ENSMUST00000099514 BC005561E9Q5E2 1589 aa20.87■□□□□ 0.93
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa20.87■□□□□ 0.93
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
Sgms1-201ENSMUST00000099514 PxdnQ3UQ28 1475 aa20.86■□□□□ 0.93
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Ttll5Q8CHB8 1328 aa20.85■□□□□ 0.93
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Abcc5Q9R1X5 1436 aa20.84■□□□□ 0.93
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa20.84■□□□□ 0.93
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Arid3cA6PWV5 409 aa20.84■□□□□ 0.93
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa20.83■□□□□ 0.93
Sgms1-201ENSMUST00000099514 NeflP08551 543 aa20.83■□□□□ 0.93
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Naip5Q9R016 1403 aa20.82■□□□□ 0.92
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Ncoa2Q61026 1462 aa20.82■□□□□ 0.92
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Mug1P28665 1476 aa20.81■□□□□ 0.92
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Ncoa3O09000 1398 aa20.81■□□□□ 0.92
Sgms1-201ENSMUST00000099514 WizO88286 1684 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Kif21aQ9QXL2 1672 aa20.8■□□□□ 0.92
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Dapk1Q80YE7 1442 aa20.78■□□□□ 0.92
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Gm13695A2AK44 830 aa20.77■□□□□ 0.92
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Jph4Q80WT0 628 aa20.77■□□□□ 0.92
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Clstn2Q9ER65 966 aa20.77■□□□□ 0.92
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Stk24Q99KH8 431 aa20.76■□□□□ 0.91
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Disp1Q3TDN0 1521 aa20.76■□□□□ 0.91
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Atp1b4Q99ME6 356 aa20.75■□□□□ 0.91
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Fam135aQ6NS59 1506 aa20.75■□□□□ 0.91
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Apbb1Q9QXJ1 710 aa20.74■□□□□ 0.91
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Magi3Q9EQJ9 1476 aa20.73■□□□□ 0.91
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Ecm2Q5FW85 670 aa20.73■□□□□ 0.91
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Nlrp6Q91WS2 869 aa20.72■□□□□ 0.91
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Cnga1P29974 684 aa20.7■□□□□ 0.9
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Polr3glQ8R0C0 218 aa20.68■□□□□ 0.9
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Soga1E1U8D0 1418 aa20.68■□□□□ 0.9
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa20.67■□□□□ 0.9
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Supt16hQ920B9 1047 aa20.67■□□□□ 0.9
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Kcnh8P59111 1102 aa20.64■□□□□ 0.9
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Neurod2Q62414 383 aa20.64■□□□□ 0.89
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Plppr3Q7TPB0 716 aa20.63■□□□□ 0.89
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Myt1Q8CFC2 1127 aa20.62■□□□□ 0.89
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Gm20521D3Z5F7 333 aa20.61■□□□□ 0.89
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Inpp5dQ9ES52 1191 aa20.61■□□□□ 0.89
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa20.6■□□□□ 0.89
Sgms1-201ENSMUST00000099514 ArxO35085 564 aa20.6■□□□□ 0.89
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa20.6■□□□□ 0.89
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Map3k5O35099 1380 aa20.6■□□□□ 0.89
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Q7TT23 1179 aa20.6■□□□□ 0.89
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Neo1P97798 1493 aa20.6■□□□□ 0.89
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Kif3bQ61771 747 aa20.59■□□□□ 0.89
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Pank3Q8R2W9 370 aa20.59■□□□□ 0.89
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Peg3Q3URU2 1571 aa20.57■□□□□ 0.88
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Trim26Q99PN3 545 aa20.57■□□□□ 0.88
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Slc4a1apE9PX68 744 aa20.56■□□□□ 0.88
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa20.55■□□□□ 0.88
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa20.55■□□□□ 0.88
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Sgms1-201ENSMUST00000099514 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Sgms1-201ENSMUST00000099514 CrbnQ8C7D2 445 aa20.54■□□□□ 0.88
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Dbr1Q923B1 550 aa20.53■□□□□ 0.88
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Magi1Q6RHR9 1471 aa20.53■□□□□ 0.88
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Zscan21Q07231 555 aa20.53■□□□□ 0.88
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa20.53■□□□□ 0.88
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Sgms1-201ENSMUST00000099514 B4galnt3Q6L8S8 986 aa20.51■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Fam163aQ8CAA5 168 aa20.51■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Il16O54824 1322 aa20.51■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Ncoa1P70365 1447 aa20.51■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Rock2P70336 1388 aa20.5■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Esx1O88933 382 aa20.49■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Shroom2A2ALU4 1481 aa20.49■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Abca5Q8K448 1642 aa20.48■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Pak3Q61036 559 aa20.48■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Fan1Q69ZT1 1020 aa20.48■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Prex2Q3LAC4 1598 aa20.48■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Srcin1Q9QWI6 1250 aa20.48■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa20.47■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Pde4cQ3UEI1 686 aa20.46■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Sall3Q62255 1320 aa20.45■□□□□ 0.87
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa20.45■□□□□ 0.86
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Arhgap5P97393 1501 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.6 ms