Protein–RNA interactions for Protein: P59111

Kcnh8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnh8P59111 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
Kcnh8P59111 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Kcnh8P59111 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Kcnh8P59111 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Kcnh8P59111 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
Kcnh8P59111 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Kcnh8P59111 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Kcnh8P59111 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Kcnh8P59111 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Kcnh8P59111 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Kcnh8P59111 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Kcnh8P59111 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Kcnh8P59111 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Kcnh8P59111 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Kcnh8P59111 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Kcnh8P59111 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
Kcnh8P59111 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Kcnh8P59111 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
Kcnh8P59111 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Kcnh8P59111 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Kcnh8P59111 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Kcnh8P59111 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Kcnh8P59111 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Kcnh8P59111 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Kcnh8P59111 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Kcnh8P59111 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Kcnh8P59111 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Kcnh8P59111 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Kcnh8P59111 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Kcnh8P59111 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Kcnh8P59111 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Kcnh8P59111 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Kcnh8P59111 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Kcnh8P59111 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Kcnh8P59111 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Kcnh8P59111 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Kcnh8P59111 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
Kcnh8P59111 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Kcnh8P59111 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Kcnh8P59111 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Kcnh8P59111 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Kcnh8P59111 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Kcnh8P59111 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Kcnh8P59111 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Kcnh8P59111 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Kcnh8P59111 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Kcnh8P59111 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Kcnh8P59111 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Kcnh8P59111 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Kcnh8P59111 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Kcnh8P59111 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Kcnh8P59111 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kcnh8P59111 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Kcnh8P59111 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kcnh8P59111 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Kcnh8P59111 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Kcnh8P59111 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Kcnh8P59111 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Kcnh8P59111 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Kcnh8P59111 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Kcnh8P59111 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Kcnh8P59111 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Kcnh8P59111 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Kcnh8P59111 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kcnh8P59111 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Kcnh8P59111 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kcnh8P59111 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Kcnh8P59111 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kcnh8P59111 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kcnh8P59111 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Kcnh8P59111 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Kcnh8P59111 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Kcnh8P59111 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kcnh8P59111 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Kcnh8P59111 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Kcnh8P59111 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Kcnh8P59111 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Kcnh8P59111 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Kcnh8P59111 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Kcnh8P59111 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Kcnh8P59111 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Kcnh8P59111 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Kcnh8P59111 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kcnh8P59111 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Kcnh8P59111 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Kcnh8P59111 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Kcnh8P59111 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Kcnh8P59111 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Kcnh8P59111 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kcnh8P59111 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kcnh8P59111 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kcnh8P59111 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kcnh8P59111 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Kcnh8P59111 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Kcnh8P59111 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Kcnh8P59111 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Kcnh8P59111 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kcnh8P59111 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Kcnh8P59111 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Kcnh8P59111 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms