RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000099514.9

Sgms1-201, Transcript of Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sgms1, Length 3,665 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sgms1-201ENSMUST00000099514 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.56■■□□□ 1.36
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Sgms1-201ENSMUST00000099514 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa23.47■■□□□ 1.35
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Sycp2Q9CUU3 1500 aa23.47■■□□□ 1.35
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa23.37■■□□□ 1.33
Sgms1-201ENSMUST00000099514 NefmP08553 848 aa23.35■■□□□ 1.33
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Sgms1-201ENSMUST00000099514 Golga3P55937 1487 aa23.32■■□□□ 1.32
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa23.28■■□□□ 1.32
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Crybg2B7ZCC2 1516 aa23.21■■□□□ 1.31
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Synj1Q8CHC4 1574 aa23.14■■□□□ 1.29
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Sall2Q9QX96 1004 aa23.08■■□□□ 1.29
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Sgms1-201ENSMUST00000099514 Neurod1Q60867 357 aa22.96■■□□□ 1.27
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Sgms1-201ENSMUST00000099514 Ube2uB1AUC4 352 aa22.89■■□□□ 1.26
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Sgms1-201ENSMUST00000099514 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa22.61■■□□□ 1.21
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa22.61■■□□□ 1.21
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Cep162Q6ZQ06 1403 aa22.6■■□□□ 1.21
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Sgms1-201ENSMUST00000099514 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa22.56■■□□□ 1.2
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Kif15Q6P9L6 1387 aa22.55■■□□□ 1.2
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Sgms1-201ENSMUST00000099514 Ubl4bQ9CQ84 188 aa22.45■■□□□ 1.19
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Gm38655A0A286YDK6 273 aa22.44■■□□□ 1.18
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Sgms1-201ENSMUST00000099514 Slc24a1Q91WD8 1130 aa22.42■■□□□ 1.18
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Csrnp3P59055 597 aa22.38■■□□□ 1.17
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa22.36■■□□□ 1.17
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Sgms1-201ENSMUST00000099514 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Eea1Q8BL66 1411 aa22.24■■□□□ 1.15
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Sgms1-201ENSMUST00000099514 Arhgap35Q91YM2 1499 aa21.97■■□□□ 1.11
Sgms1-201ENSMUST00000099514 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa21.97■■□□□ 1.11
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Sgms1-201ENSMUST00000099514 Cux2P70298 1426 aa21.96■■□□□ 1.11
Sgms1-201ENSMUST00000099514 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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Sgms1-201ENSMUST00000099514 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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