RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038356.12

Ube2q1-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2q1, Length 3,077 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ccnb3Q810T2 1396 aa30.07■■■□□ 2.4
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Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
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Ube2q1-201ENSMUST00000038356 NexmifQ5DTT1 1515 aa29.92■■■□□ 2.38
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Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa29.81■■■□□ 2.36
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Ube2q1-201ENSMUST00000038356 NrdcQ8BHG1 1161 aa29.78■■■□□ 2.36
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Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
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Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa29.62■■■□□ 2.33
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Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Gm14025A2AP89 1413 aa29.62■■■□□ 2.33
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Pprc1Q6NZN1 1644 aa29.61■■■□□ 2.33
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Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mtus2Q3UHD3 1353 aa29.52■■■□□ 2.32
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa29.51■■■□□ 2.32
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Usp47Q8BY87 1376 aa29.51■■■□□ 2.31
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Egfem1Q8C088 590 aa29.51■■■□□ 2.31
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Plekhh2Q8C115 1491 aa29.5■■■□□ 2.31
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa29.5■■■□□ 2.31
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Pkd2O35245 966 aa29.5■■■□□ 2.31
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Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Adcy10Q8C0T9 1614 aa29.48■■■□□ 2.31
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Zfp644E9QA22 1323 aa29.47■■■□□ 2.31
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Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Fhod3Q76LL6 1578 aa29.42■■■□□ 2.3
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa29.41■■■□□ 2.3
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Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Fancd2Q80V62 1450 aa29.39■■■□□ 2.3
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Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Chd1P40201 1711 aa29.31■■■□□ 2.28
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Arid3cA6PWV5 409 aa29.3■■■□□ 2.28
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Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ipo9Q91YE6 1041 aa29.26■■■□□ 2.28
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa29.26■■■□□ 2.27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa29.25■■■□□ 2.27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rgl3Q3UYI5 709 aa29.25■■■□□ 2.27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Arhgap5P97393 1501 aa29.22■■■□□ 2.27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 SphkapQ6NSW3 1687 aa29.22■■■□□ 2.27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rfx7F8VPJ6 1459 aa29.22■■■□□ 2.27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Il16O54824 1322 aa29.21■■■□□ 2.27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Znf608Q56A10 1511 aa29.2■■■□□ 2.27
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa29.2■■■□□ 2.26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Atp10dQ8K2X1 1416 aa29.19■■■□□ 2.26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Trappc8E9PWG2 1437 aa29.17■■■□□ 2.26
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