RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)P

tK(UUU)P, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)P, Length 73 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)PtK(UUU)P CDC12P32468 407 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P CYM1P32898 989 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P RPS1AP33442 255 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P LRG1P35688 1017 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P ASK1P35734 292 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P CAB3P36076 571 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P ASC1P38011 319 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P YBR071WP38243 211 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P BMT2P38278 337 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P IFA38P38286 347 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P YHL008CP38750 627 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P GGC1P38988 300 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P RGA1P39083 1007 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P FRT2P39734 528 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P GID8P40208 455 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P YRB1P41920 201 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P FAR3P46671 204 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P URB2P47108 1174 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P LIA1P47120 325 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P TRM9P49957 279 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P NOP19P53317 196 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P SLM2P53955 656 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P MRS2Q01926 470 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P ECM9Q02202 377 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P USA1Q03714 838 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P TAF12Q03761 539 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P YMR155WQ03795 547 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P CSN9Q03981 162 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P BUD22Q04347 519 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P ROY1Q04847 553 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P PNP1Q05788 311 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P GIC2Q06648 383 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P CDA1Q06702 301 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P VAM6Q07468 1049 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P PFA4Q12006 378 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P NMD4Q12129 218 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P HAL9Q12180 1030 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P YPR011CQ12251 326 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P Q0010Q9ZZX9 128 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P PHO5P00635 467 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P PRT1P06103 763 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P STE7P06784 515 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P SPT3P06844 337 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P KIN2P13186 1147 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P HSC82P15108 705 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P PRP2P20095 876 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P SEC15P22224 910 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P SEC14P24280 304 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P MGR1P25573 417 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P LDB16P25587 256 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P YJU2P28320 278 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P KAP122P32767 1081 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.16□□□□□ -1.9not detected
tK(UUU)PtK(UUU)P SDH3P33421 198 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P KKQ8P36004 724 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P MUD2P36084 527 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P APT2P36973 181 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P RRN10P38204 145 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P FTH1P38310 465 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P LIN1P38852 340 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P MET30P39014 640 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P PRP39P39682 629 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P YIL001WP40560 513 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P AXL1P40851 1208 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P SPG5P42933 373 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P ELP2P42935 788 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P PRP31P49704 494 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P SDT1P53078 280 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P KXD1P53158 218 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P SGF73P53165 657 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P ERG26P53199 349 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P GTR2P53290 341 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P RMI1Q02685 241 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P GOT1Q03554 138 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P HDA3Q06623 655 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P RAD34Q06665 692 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P YLR053CQ12026 108 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P REX3Q12090 404 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P GET4Q12125 312 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P YLL054CQ12244 843 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P ATG34Q12292 412 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P NTO1Q12311 748 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P GLE1Q12315 538 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P GLO4Q12320 285 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P YVC1Q12324 675 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P HSP42Q12329 375 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P PST1Q12355 444 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P YLR111WQ12528 110 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)PtK(UUU)P RPL17AP05740 184 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)PtK(UUU)P RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)PtK(UUU)P RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)PtK(UUU)P CBS2P14905 389 aa3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)PtK(UUU)P PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)PtK(UUU)P MSB1P21339 1137 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)PtK(UUU)P NAR1P23503 491 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)PtK(UUU)P PHO87P25360 923 aa3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 62 ms