RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RDS3	YPR094W	KKQ8	P36004	724 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	MRPL10	P36520	322 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	YBR138C	P38277	524 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	MSG5	P38590	489 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	GCD10	P41814	478 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	YNR061C	P53747	219 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	CAF40	P53829	373 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	GOR1	P53839	350 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	PEX25	Q02969	394 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	VPS74	Q06385	345 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	SSP2	Q08646	371 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	FDH1	Q08911	376 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	YLR108C	Q12259	485 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	ARG81	P05085	880 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	MAS2	P11914	482 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	PEP5	P12868	1029 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	YKL050C	P35736	922 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	TSC10	P38342	320 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	TIM17	P39515	158 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	FAU1	P40099	211 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	PRM5	P40476	318 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	GAB1	P41733	394 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	RRT5	P43607	289 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	YJR120W	P47157	116 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	AVT4	P50944	713 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	ALT2	P52892	507 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	COG6	P53959	839 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	RSM23	Q01163	450 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	ECM30	Q06673	1274 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	SDH5	Q08230	162 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	TMA16	Q08687	178 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	YCR007C	P25354	239 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	MNS1	P32906	549 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	MRPS9	P38120	278 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	DBP8	P38719	431 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	RIC1	P40395	1056 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	SSU1	P41930	458 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	SGM1	P47166	707 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	DUG3	P53871	357 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	SHR3	Q02774	210 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	AIM32	Q04689	311 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	IVY1	Q04934	453 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	RTT109	Q07794	436 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	PCD1	Q12524	340 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	YOR019W	Q99248	730 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RDS3	YPR094W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	SUC2	P00724	532 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	NFT1	P0CE68	1218 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	SPE2	P21182	396 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	RAD16	P31244	790 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	YME2	P32843	850 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	TFC3	P34111	1160 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	NUP120	P35729	1037 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	STB6	P36085	766 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	ARA1	P38115	344 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	MIX23	P38162	196 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	ELO1	P39540	310 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	UIP3	P39547	235 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	SPC72	P39723	622 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	YPS6	P40583	537 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	ELP2	P42935	788 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	NCA3	P46955	337 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	YJR154W	P47181	346 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	ASE1	P50275	885 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	FLC3	P53121	802 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	YGR018C	P53211	109 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	MTM1	P53320	366 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	CBK1	P53894	756 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	TRS130	Q03660	1102 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	PHO92	Q06390	306 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	0.15	□□□□□ -2.39	not detected
RDS3	YPR094W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	YOL114C	Q12322	202 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	NKP1	Q12493	238 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	TY2A-C	P25383	438 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RDS3	YPR094W	NDI1	P32340	513 aa		0.14	□□□□□ -2.39

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