Protein–RNA interactions for Protein: P47027

DPB11, DNA replication regulator DPB11, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB11P47027 NSR1YGR159C 1245 nt17.97■□□□□ 0.47
DPB11P47027 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.97■□□□□ 0.47
DPB11P47027 NOP1YDL014W 984 nt17.54■□□□□ 0.4
DPB11P47027 MDJ1YFL016C 1536 nt16.21■□□□□ 0.19
DPB11P47027 YKL036CYKL036C 393 nt16.1■□□□□ 0.17
DPB11P47027 Q0297Q0297 156 nt15.33■□□□□ 0.04
DPB11P47027 SRX1YKL086W 384 nt15.3■□□□□ 0.04
DPB11P47027 YJL027CYJL027C 417 nt15□□□□□ -0.01
DPB11P47027 SCS3YGL126W 1143 nt14.59□□□□□ -0.07
DPB11P47027 YCR051WYCR051W 669 nt14.47□□□□□ -0.09
DPB11P47027 DBP2YNL112W 1641 nt14.15□□□□□ -0.14
DPB11P47027 YBR190WYBR190W 312 nt13.97□□□□□ -0.17
DPB11P47027 YOL085CYOL085C 342 nt13.93□□□□□ -0.18
DPB11P47027 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.84□□□□□ -0.19
DPB11P47027 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.84□□□□□ -0.19
DPB11P47027 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.84□□□□□ -0.19
DPB11P47027 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.84□□□□□ -0.19
DPB11P47027 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.84□□□□□ -0.19
DPB11P47027 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.84□□□□□ -0.19
DPB11P47027 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.84□□□□□ -0.19
DPB11P47027 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.84□□□□□ -0.19
DPB11P47027 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.84□□□□□ -0.19
DPB11P47027 RPP1BYDL130W 321 nt13.74□□□□□ -0.21
DPB11P47027 PKP1YIL042C 1185 nt13.65□□□□□ -0.22
DPB11P47027 CCC1YLR220W 969 nt13.64□□□□□ -0.23
DPB11P47027 RTC3YHR087W 336 nt13.61□□□□□ -0.23
DPB11P47027 SSA3YBL075C 1950 nt13.34□□□□□ -0.27
DPB11P47027 RVS167YDR388W 1449 nt13.3□□□□□ -0.28
DPB11P47027 SCJ1YMR214W 1134 nt13.13□□□□□ -0.31
DPB11P47027 PET122YER153C 765 nt13.08□□□□□ -0.32
DPB11P47027 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.07□□□□□ -0.32
DPB11P47027 ATS1YAL020C 1002 nt13.06□□□□□ -0.32
DPB11P47027 PUT4YOR348C 1884 nt13.04□□□□□ -0.32
DPB11P47027 SCR1SCR1 522 nt12.99□□□□□ -0.33
DPB11P47027 SHR5YOL110W 714 nt12.8□□□□□ -0.36
DPB11P47027 RRN5YLR141W 1092 nt12.7□□□□□ -0.38
DPB11P47027 YDJ1YNL064C 1230 nt12.69□□□□□ -0.38
DPB11P47027 ARE1YCR048W 1833 nt12.65□□□□□ -0.38
DPB11P47027 POA1YBR022W 534 nt12.58□□□□□ -0.4
DPB11P47027 URN1YPR152C 1398 nt12.57□□□□□ -0.4
DPB11P47027 SAH1YER043C 1350 nt12.53□□□□□ -0.4
DPB11P47027 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.51□□□□□ -0.41
DPB11P47027 OPI9YLR338W 858 nt12.5□□□□□ -0.41
DPB11P47027 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.46□□□□□ -0.41
DPB11P47027 RSB1YOR049C 1065 nt12.43□□□□□ -0.42
DPB11P47027 BSC6YOL137W 1494 nt12.42□□□□□ -0.42
DPB11P47027 DEP1YAL013W 1218 nt12.41□□□□□ -0.42
DPB11P47027 GAR1YHR089C 618 nt12.34□□□□□ -0.43
DPB11P47027 RPN10YHR200W 807 nt12.32□□□□□ -0.44
DPB11P47027 YNL208WYNL208W 600 nt12.26□□□□□ -0.45
DPB11P47027 SPT5YML010W 3192 nt12.18□□□□□ -0.46
DPB11P47027 BUD23YCR047C 828 nt12.16□□□□□ -0.46
DPB11P47027 PUN1YLR414C 792 nt12.14□□□□□ -0.47
DPB11P47027 PST2YDR032C 597 nt12.11□□□□□ -0.47
DPB11P47027 PTC2YER089C 1395 nt12.05□□□□□ -0.48
DPB11P47027 SSA4YER103W 1929 nt11.99□□□□□ -0.49
DPB11P47027 NAB2YGL122C 1578 nt11.97□□□□□ -0.49
DPB11P47027 TIR1YER011W 765 nt11.96□□□□□ -0.49
DPB11P47027 YJR018WYJR018W 363 nt11.96□□□□□ -0.49
DPB11P47027 Q0182Q0182 405 nt11.84□□□□□ -0.51
DPB11P47027 SSA1YAL005C 1929 nt11.8□□□□□ -0.52
DPB11P47027 FIS1YIL065C 468 nt11.78□□□□□ -0.52
DPB11P47027 DAL1YIR027C 1383 nt11.73□□□□□ -0.53
DPB11P47027 MEP2YNL142W 1500 nt11.7□□□□□ -0.54
DPB11P47027 YJR120WYJR120W 351 nt11.69□□□□□ -0.54
DPB11P47027 FPR4YLR449W 1179 nt11.67□□□□□ -0.54
DPB11P47027 RPP2BYDR382W 333 nt11.66□□□□□ -0.54
DPB11P47027 PHO4YFR034C 939 nt11.62□□□□□ -0.55
DPB11P47027 YKL097CYKL097C 411 nt11.61□□□□□ -0.55
DPB11P47027 INM2YDR287W 879 nt11.6□□□□□ -0.55
DPB11P47027 SHU1YHL006C 453 nt11.59□□□□□ -0.55
DPB11P47027 BDF1YLR399C 2061 nt11.56□□□□□ -0.56
DPB11P47027 YPS1YLR120C 1710 nt11.55□□□□□ -0.56
DPB11P47027 SRB2YHR041C 633 nt11.53□□□□□ -0.56
DPB11P47027 DCW1YKL046C 1350 nt11.5□□□□□ -0.57
DPB11P47027 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.46□□□□□ -0.57
DPB11P47027 TAT1YBR069C 1860 nt11.42□□□□□ -0.58
DPB11P47027 YDR095CYDR095C 411 nt11.42□□□□□ -0.58
DPB11P47027 YBL100CYBL100C 315 nt11.42□□□□□ -0.58
DPB11P47027 BDH2YAL061W 1254 nt11.41□□□□□ -0.58
DPB11P47027 YGR021WYGR021W 873 nt11.4□□□□□ -0.58
DPB11P47027 WWM1YFL010C 636 nt11.39□□□□□ -0.59
DPB11P47027 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.37□□□□□ -0.59
DPB11P47027 EMI2YDR516C 1503 nt11.35□□□□□ -0.59
DPB11P47027 YMR090WYMR090W 684 nt11.32□□□□□ -0.6
DPB11P47027 MOT3YMR070W 1473 nt11.32□□□□□ -0.6
DPB11P47027 HOM6YJR139C 1080 nt11.31□□□□□ -0.6
DPB11P47027 YBR220CYBR220C 1683 nt11.3□□□□□ -0.6
DPB11P47027 LSM3YLR438C-A 270 nt11.29□□□□□ -0.6
DPB11P47027 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.28□□□□□ -0.6
DPB11P47027 FUN26YAL022C 1554 nt11.26□□□□□ -0.61
DPB11P47027 YDL221WYDL221W 552 nt11.24□□□□□ -0.61
DPB11P47027 ALF1YNL148C 765 nt11.21□□□□□ -0.61
DPB11P47027 PTP1YDL230W 1008 nt11.2□□□□□ -0.62
DPB11P47027 TRM9YML014W 840 nt11.2□□□□□ -0.62
DPB11P47027 RPP2AYOL039W 321 nt11.2□□□□□ -0.62
DPB11P47027 MNP1YGL068W 585 nt11.19□□□□□ -0.62
DPB11P47027 SDH1YKL148C 1923 nt11.18□□□□□ -0.62
DPB11P47027 CAC2YML102W 1407 nt11.18□□□□□ -0.62
DPB11P47027 RKM5YLR137W 1104 nt11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms