RNA–Protein interactions for RNA: YDR288W

NSE3, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeast

Gene NSE3, Length 912 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	YDR288W	ERG7	P38604	731 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NSE3	YDR288W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NSE3	YDR288W	IRC6	P43615	237 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NSE3	YDR288W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NSE3	YDR288W	BET4	Q00618	327 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NSE3	YDR288W	NUP100	Q02629	959 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NSE3	YDR288W	SHR3	Q02774	210 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NSE3	YDR288W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NSE3	YDR288W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NSE3	YDR288W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NSE3	YDR288W	RIM20	Q12033	661 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NSE3	YDR288W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	MET17	P06106	444 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	MSR1	P38714	643 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YIL169C	P40442	995 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YGL082W	P53155	381 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	FIN1	Q03898	291 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	RSF1	Q05043	376 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	TRS65	P32893	560 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	PHD1	P36093	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	MIC60	P36112	540 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	MET30	P39014	640 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YEL057C	P39983	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YIL152W	P40455	235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	MET28	P40573	187 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	AXL1	P40851	1208 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	SAD1	P43589	448 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	PET130	P47065	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	TOF2	Q02208	771 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	SMA1	Q02651	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	PEP5	P12868	1029 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	RED1	P14291	827 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	RAD24	P32641	659 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	RKM3	P38222	552 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	VID24	P38263	362 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	MSC1	Q03104	513 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	SPC19	Q03954	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	FMP42	Q04991	504 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	SRL1	Q08673	210 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	ARP6	Q12509	438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YCR043C	P25361	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	SNM1	P40993	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	AZF1	P41696	914 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	TWF1	P53250	332 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	TAF11	Q04226	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	GLO2	Q05584	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	ATG29	Q12092	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	HNM1	P19807	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	GPI10	P30777	616 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	MRE11	P32829	692 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	SHP1	P34223	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	MUM2	P38236	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	FET5	P43561	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	MSS11	Q03825	758 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	COQ9	Q05779	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	FMP45	Q07651	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	THP1	Q08231	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	BSC1	Q12140	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	SEC39	Q12745	709 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	PRD1	P25375	712 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	CMC1	P36064	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	BZZ1	P38822	633 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	MET18	P40469	1032 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	ATG27	P46989	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	BUD32	P53323	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	DIC1	Q06143	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	TYR1	P20049	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	ROX1	P25042	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	VPS17	P32913	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	PMT1	P33775	817 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	YHR210C	P38893	341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSE3	YDR288W	STB2	P46679	850 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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