RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeastyeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR104WYKR104W MDE1P47095 244 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W VPS4P52917 437 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data5.24□□□□□ -1.57not detected
YKR104WYKR104W ICL2Q12031 575 aa5.24□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W ALY1P36117 915 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W RTS1P38903 757 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W RSC9Q03124 581 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W TLG1Q03322 224 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W RSF1Q05043 376 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W GRX6Q12438 231 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W YOL159C-AQ3E769 90 aa5.23□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W VMR1P38735 1592 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W RRP7P25368 297 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W YJU2P28320 278 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W SWH1P35845 1188 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W SPC97P38863 823 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W YHR218WP38899 603 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W SMF1P38925 575 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W PSD1P39006 500 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W ARB1P40024 610 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W PCL7P40186 285 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data5.22□□□□□ -1.57not detected
YKR104WYKR104W AAD10P47182 288 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W ASE1P50275 885 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W YPL107WQ02873 248 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W VAM6Q07468 1049 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data5.22□□□□□ -1.57not detected
YKR104WYKR104W RIX7Q07844 837 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W PRS5Q12265 496 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W SUL2Q12325 893 aa5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YKR104WYKR104W APE1P14904 514 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W ERG8P24521 451 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W PAP1P29468 568 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W YAP3P38749 330 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W MET18P40469 1032 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W DOT5P40553 215 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W HST1P53685 503 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W HRD3Q05787 833 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W TPO3Q06451 622 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W TMA16Q08687 178 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W APL4Q12028 832 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W YLR111WQ12528 110 aa5.21□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W POL4P25615 582 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W YCR051WP25631 222 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W UIP5P36137 443 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W STB5P38699 743 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W YEL057CP39983 233 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W JHD1P40034 492 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W RTT105P40063 208 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W RGI2P40188 164 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W COS12P53053 380 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W CUL3P53202 744 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W COG2P53271 262 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W BNI5P53890 448 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W MAK10Q02197 733 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W DPB4Q04603 196 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W TCO89Q08921 799 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W VCX1Q99385 411 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W CAT8P39113 1433 aa5.2□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W TFB1P32776 642 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W MAL33P38157 468 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W TAM41P53230 385 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W YGR066CP53242 292 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W YNL092WP53934 400 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data5.19□□□□□ -1.58not detected
YKR104WYKR104W YPL068CQ02749 293 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W HOT1Q03213 719 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W RAD33Q04231 177 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W CYK3Q07533 885 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W AIM6Q07716 390 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W GEP3Q08622 556 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W CEX1Q12453 761 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W AFI1Q99222 893 aa5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W CHO2P05374 869 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W YML002WP0CF17 737 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W KAR3P17119 729 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W MSP1P28737 362 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W GDA1P32621 518 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W VID24P38263 362 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W OTU2P38747 307 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W LNP1P38878 278 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W AFG3P39925 761 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W SLZ1P40167 298 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W PCI8P40512 444 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W EFM4P40516 257 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W IDS2P46958 469 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W LCL3P53153 274 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W YML037CQ03703 340 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR104WYKR104W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 95.4 ms