RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR078WYKR078W GYL1Q04322 720 aa2.81□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W COG4Q06096 861 aa2.81□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W DAP1Q12091 152 aa2.81□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W YOR093CQ12275 1648 aa2.81□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W YSP2Q06681 1438 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W NOP1P15646 327 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W RPB8P20436 146 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W MRPS28P21771 286 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W TOM20P35180 183 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W GRX7P38068 203 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W OLA1P38219 394 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W SPT8P38915 602 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W RPT2P40327 437 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W NDL1Q06568 189 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W TMA16Q08687 178 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W COX17Q12287 69 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W PCD1Q12524 340 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W SMC6Q12749 1114 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W ATP4P05626 244 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W KRS1P15180 591 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W GLN3P18494 730 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W PRD1P25375 712 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W NPR3P38742 1146 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W YFR020WP43600 232 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W ASE1P50275 885 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W IMP4P53941 290 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W UBX2Q04228 584 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W RBA50Q04418 439 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W SWI1P09547 1314 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W CDC37P06101 506 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W PDA1P16387 420 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W GID7P25569 745 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W SRB5P32585 307 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W YME2P32843 850 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W STV1P37296 890 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W KRE9P39005 276 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W YIL060WP40519 144 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W VID30P53076 958 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W JJJ1P53863 590 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W YDL218WQ07629 317 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W CSR2Q12734 1121 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W TY2A-FP0CX61 438 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W TY2A-GR2P0CX62 438 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W TY2A-CP25383 438 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W NUF2P33895 451 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data2.78□□□□□ -1.96not detected
YKR078WYKR078W HEL1P36113 551 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W SDS24P38314 527 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W PSF2P40359 213 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W AZF1P41696 914 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W CTK3P46963 296 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W ILM1P47155 203 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W COG1P53079 417 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W NUP100Q02629 959 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W TLG1Q03322 224 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W TY2A-DR2Q03483 438 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W RRB1Q04225 511 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W RTT109Q07794 436 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W ATG9Q12142 997 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W TY2A-BQ12260 438 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W TY2A-OR2Q12293 438 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W TY2A-DR1Q12392 438 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W TY2A-OR1Q12439 438 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W TY2A-DR3Q99303 438 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W DOP1Q03921 1698 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR078WYKR078W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W YCL049CP25577 312 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W DPB3P27344 201 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TFC3P34111 1160 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W YBR139WP38109 508 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W ARC35P53731 342 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W ARO80Q04052 950 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W CIA1Q05583 330 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W IML1P47170 1584 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-HO13535 1793 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-JR1P47098 1755 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-ER1Q03612 1755 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-GR2Q12269 1755 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-OLQ12273 1755 aa2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.9 ms