RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	YML037C	Q03703	340 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	RTT109	Q07794	436 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	PUT2	P07275	575 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YCK1	P23291	538 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	CHS3	P29465	1165 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	MIC60	P36112	540 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YBL029W	P38201	376 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YJL068C	P40363	299 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	AXL1	P40851	1208 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	PTR3	P43606	678 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	DUG3	P53871	357 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	DIC1	Q06143	298 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	OPY2	Q06810	360 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	SSK1	Q07084	712 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	NKP1	Q12493	238 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	SYN8	P31377	255 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	ACH1	P32316	526 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YER130C	P39959	443 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	VID27	P40157	782 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YPL014W	Q02606	381 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	MSS11	Q03825	758 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	CDC16	P09798	840 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	KAR3	P17119	729 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	IMG1	P25626	169 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	UBP11	P36026	717 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	ICS2	P38284	255 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YJL070C	P40361	888 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	GUF1	P46943	645 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	CRZ1	P53968	678 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YMR160W	Q03823	816 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	RBA50	Q04418	439 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	DAP1	Q12091	152 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YKL100C	P34248	587 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	NGL3	Q03210	505 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	HUA2	Q12134	243 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	SPE4	Q12455	300 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	ENT1	Q12518	454 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	SGS1	P35187	1447 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YML002W	P0CF17	737 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	PMS1	P14242	873 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	BOS1	P25385	244 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YIH1	P25637	258 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	SNC1	P31109	117 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	SPC34	P36131	295 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	LAG1	P38703	411 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	EFM6	P53970	246 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	YDR056C	Q12025	205 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RSM27	YGR215W	PHO2	P07269	559 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	TYR1	P20049	452 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	SEC62	P21825	274 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	NUP133	P36161	1157 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	FAR3	P46671	204 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	SNG1	P46950	547 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	YGR127W	P53275	312 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	YDL057W	Q07379	328 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	ARP6	Q12509	438 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	AAC3	P18238	307 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	SAN1	P22470	610 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	RGT1	P32862	1170 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	YBR144C	P34215	104 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	IKS1	P47042	667 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	YGL082W	P53155	381 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	BUD32	P53323	261 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	SAM50	P53969	484 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	YMR087W	Q04299	284 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	YKU80	Q04437	629 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RSM27	YGR215W	MRS3	P10566	314 aa		3.69	□□□□□ -1.82

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