RNA–Protein interactions for RNA: YOR038C

HIR2, Transcript of Subunit of HIR nucleosome assembly complex, yeast

Gene HIR2, Length 2,628 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HIR2	YOR038C	PCA1	P38360	1216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YHL049C	P38722	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	GIP4	P39732	760 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YEL075C	P39972	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YER189W	P40104	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	DSN1	P40568	576 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YFL064C	P43540	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SLD3	P53135	668 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SLG1	P54867	378 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	GRX8	Q05926	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	VHS3	Q08438	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	NUR1	Q12066	484 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SGF29	P25554	259 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	AGP2	P38090	596 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	RRT2	P38332	387 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SMF2	P38778	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YRB2	P40517	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	TEP1	P53916	434 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YAP6	Q03935	383 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	BSC2	Q05611	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	THI7	Q05998	598 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	RSC3	Q06639	885 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	CWH43	P25618	953 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	PCL2	P25693	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	RPC17	P47076	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	TAF9	Q05027	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	PEX15	Q08215	383 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	NBP2	Q12163	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	HER1	Q12276	1246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	ARP7	Q12406	477 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	ARG80	P07249	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	RPO26	P20435	155 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	YGL015C	P33199	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	MND2	P40577	368 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	GTB1	Q04924	702 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	TOP3	P13099	656 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	PHO91	P27514	894 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	SRB2	P34162	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	GCS1	P35197	352 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	ECM13	P38195	257 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	SMF1	P38925	575 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	YDR089W	P38966	869 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	END3	P39013	349 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	MRX1	P40050	688 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	SMA1	Q02651	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	VID22	Q05934	901 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	VIK1	Q12045	647 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	NSI1	Q12457	570 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	SRP101	P32916	621 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	YKR051W	P36142	418 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	ALG3	P38179	458 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	PPE1	P38796	400 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	DUN1	P39009	513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	PIK1	P39104	1066 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	TUB4	P53378	473 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	TGL5	Q12043	749 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	DIN7	Q12086	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	HMG2	P12684	1045 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	STE6	P12866	1290 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	APE1	P14904	514 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	YPK2	P18961	677 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HIR2	YOR038C	APD1	P38281	316 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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