RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	ASI2	P53895	289 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	DON1	Q05610	365 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	PHO92	Q06390	306 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	POM34	Q12445	299 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	AVL9	Q12500	764 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	YLR415C	O13578	112 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	GRR1	P24814	1151 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	APL1	P27351	700 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	PHO91	P27514	894 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	ERV1	P27882	189 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	MRE11	P32829	692 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	COS111	P38308	924 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	SIC1	P38634	284 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	CCT6	P39079	546 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	OSW5	P40219	148 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	CHS6	P40955	746 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	PFA3	P42836	336 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	VID30	P53076	958 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.41	□□□□□ -1.7	not detected
RPS1B	YML063W	TOF2	Q02208	771 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	VPS38	Q05919	439 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	SPH1	Q06160	661 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	VPS36	Q06696	566 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	DCI1	Q08558	271 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	SWT1	Q12104	458 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	YVC1	Q12324	675 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	SPE4	Q12455	300 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPS1B	YML063W	SOD2	P00447	233 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	VPS33	P20795	691 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	VPS34	P22543	875 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YIH1	P25637	258 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	SRB5	P32585	307 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	SEF1	P34228	1148 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PIM1	P36775	1133 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	WSS1	P38838	269 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	NUP60	P39705	539 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	JHD1	P40034	492 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	FTR1	P40088	404 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YIL089W	P40500	205 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	IME4	P41833	600 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	AGX1	P43567	385 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	IDS2	P46958	469 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YNL144C	P53907	740 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	FIN1	Q03898	291 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	RSM24	Q03976	319 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	ASM4	Q05166	528 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	UAF30	Q08747	228 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	SEC15	P22224	910 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	RNQ1	P25367	405 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	AFG1	P32317	509 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YSW1	P38280	609 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YJL193W	P39542	402 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	LRO1	P40345	661 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	ALT2	P52892	507 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	COS12	P53053	380 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YML037C	Q03703	340 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PPM1	Q04081	328 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	MSC3	Q05812	728 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	SIR4	P11978	1358 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	SPE1	P08432	466 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	HNM1	P19807	563 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PEX1	P24004	1043 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	URK1	P27515	501 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	BUD14	P27637	709 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	SPC110	P32380	944 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	HCS1	P34243	683 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	RRT2	P38332	387 aa		4.38	□□□□□ -1.71

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