Protein–RNA interactions for Protein: P34243

HCS1, DNA polymerase alpha-associated DNA helicase A, yeastyeast

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCS1P34243 NSR1YGR159C 1245 nt18.93■□□□□ 0.62
HCS1P34243 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.81■□□□□ 0.6
HCS1P34243 NOP1YDL014W 984 nt18.11■□□□□ 0.49
HCS1P34243 MDJ1YFL016C 1536 nt17.2■□□□□ 0.34
HCS1P34243 YKL036CYKL036C 393 nt16.37■□□□□ 0.21
HCS1P34243 YJL027CYJL027C 417 nt15.84■□□□□ 0.13
HCS1P34243 SRX1YKL086W 384 nt15.79■□□□□ 0.12
HCS1P34243 Q0297Q0297 156 nt15.69■□□□□ 0.1
HCS1P34243 DBP2YNL112W 1641 nt15□□□□□ -0.01
HCS1P34243 YCR051WYCR051W 669 nt15□□□□□ -0.01
HCS1P34243 SSA3YBL075C 1950 nt14.89□□□□□ -0.03
HCS1P34243 YBR190WYBR190W 312 nt14.72□□□□□ -0.05
HCS1P34243 SCS3YGL126W 1143 nt14.71□□□□□ -0.05
HCS1P34243 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.5□□□□□ -0.09
HCS1P34243 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.5□□□□□ -0.09
HCS1P34243 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.5□□□□□ -0.09
HCS1P34243 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.5□□□□□ -0.09
HCS1P34243 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.5□□□□□ -0.09
HCS1P34243 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.5□□□□□ -0.09
HCS1P34243 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.5□□□□□ -0.09
HCS1P34243 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.5□□□□□ -0.09
HCS1P34243 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.5□□□□□ -0.09
HCS1P34243 RTC3YHR087W 336 nt14.43□□□□□ -0.1
HCS1P34243 CCC1YLR220W 969 nt14.39□□□□□ -0.11
HCS1P34243 YOL085CYOL085C 342 nt14.17□□□□□ -0.14
HCS1P34243 RVS167YDR388W 1449 nt14.11□□□□□ -0.15
HCS1P34243 RPP1BYDL130W 321 nt14.1□□□□□ -0.15
HCS1P34243 PKP1YIL042C 1185 nt14.03□□□□□ -0.16
HCS1P34243 SCJ1YMR214W 1134 nt13.94□□□□□ -0.18
HCS1P34243 PUT4YOR348C 1884 nt13.62□□□□□ -0.23
HCS1P34243 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.6□□□□□ -0.23
HCS1P34243 PET122YER153C 765 nt13.53□□□□□ -0.24
HCS1P34243 SHR5YOL110W 714 nt13.5□□□□□ -0.25
HCS1P34243 URN1YPR152C 1398 nt13.35□□□□□ -0.27
HCS1P34243 SCR1SCR1 522 nt13.31□□□□□ -0.28
HCS1P34243 ARE1YCR048W 1833 nt13.27□□□□□ -0.28
HCS1P34243 DEP1YAL013W 1218 nt13.26□□□□□ -0.29
HCS1P34243 SAH1YER043C 1350 nt13.23□□□□□ -0.29
HCS1P34243 OPI9YLR338W 858 nt13.21□□□□□ -0.29
HCS1P34243 POA1YBR022W 534 nt13.19□□□□□ -0.3
HCS1P34243 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.16□□□□□ -0.3
HCS1P34243 YDJ1YNL064C 1230 nt13.14□□□□□ -0.31
HCS1P34243 RPN10YHR200W 807 nt13.09□□□□□ -0.31
HCS1P34243 RRN5YLR141W 1092 nt13.08□□□□□ -0.32
HCS1P34243 ATS1YAL020C 1002 nt13.03□□□□□ -0.32
HCS1P34243 YNL208WYNL208W 600 nt12.99□□□□□ -0.33
HCS1P34243 BSC6YOL137W 1494 nt12.98□□□□□ -0.33
HCS1P34243 GAR1YHR089C 618 nt12.95□□□□□ -0.34
HCS1P34243 BUD23YCR047C 828 nt12.85□□□□□ -0.35
HCS1P34243 PUN1YLR414C 792 nt12.85□□□□□ -0.35
HCS1P34243 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.82□□□□□ -0.36
HCS1P34243 SPT5YML010W 3192 nt12.81□□□□□ -0.36
HCS1P34243 SSA4YER103W 1929 nt12.8□□□□□ -0.36
HCS1P34243 RSB1YOR049C 1065 nt12.76□□□□□ -0.37
HCS1P34243 PTC2YER089C 1395 nt12.75□□□□□ -0.37
HCS1P34243 YJR018WYJR018W 363 nt12.71□□□□□ -0.37
HCS1P34243 PAC11YDR488C 1602 nt12.63□□□□□ -0.39
HCS1P34243 NAB2YGL122C 1578 nt12.62□□□□□ -0.39
HCS1P34243 NVJ2YPR091C 2313 nt12.54□□□□□ -0.4
HCS1P34243 TIR1YER011W 765 nt12.52□□□□□ -0.41
HCS1P34243 SSA1YAL005C 1929 nt12.43□□□□□ -0.42
HCS1P34243 FIS1YIL065C 468 nt12.42□□□□□ -0.42
HCS1P34243 YJR120WYJR120W 351 nt12.41□□□□□ -0.42
HCS1P34243 BDF1YLR399C 2061 nt12.41□□□□□ -0.42
HCS1P34243 FPR4YLR449W 1179 nt12.4□□□□□ -0.42
HCS1P34243 DAL1YIR027C 1383 nt12.4□□□□□ -0.42
HCS1P34243 RPP2BYDR382W 333 nt12.38□□□□□ -0.43
HCS1P34243 FPS1YLL043W 2010 nt12.32□□□□□ -0.44
HCS1P34243 PHO4YFR034C 939 nt12.29□□□□□ -0.44
HCS1P34243 INM2YDR287W 879 nt12.28□□□□□ -0.44
HCS1P34243 TAT1YBR069C 1860 nt12.23□□□□□ -0.45
HCS1P34243 MEP2YNL142W 1500 nt12.21□□□□□ -0.46
HCS1P34243 YPS1YLR120C 1710 nt12.15□□□□□ -0.46
HCS1P34243 Q0182Q0182 405 nt12.14□□□□□ -0.47
HCS1P34243 SRB2YHR041C 633 nt12.14□□□□□ -0.47
HCS1P34243 YBL100CYBL100C 315 nt12.14□□□□□ -0.47
HCS1P34243 PST2YDR032C 597 nt12.1□□□□□ -0.47
HCS1P34243 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.09□□□□□ -0.47
HCS1P34243 BDH2YAL061W 1254 nt12.04□□□□□ -0.48
HCS1P34243 YDR095CYDR095C 411 nt12.03□□□□□ -0.48
HCS1P34243 DCW1YKL046C 1350 nt12.02□□□□□ -0.49
HCS1P34243 FUN26YAL022C 1554 nt11.97□□□□□ -0.49
HCS1P34243 ALF1YNL148C 765 nt11.92□□□□□ -0.5
HCS1P34243 WWM1YFL010C 636 nt11.9□□□□□ -0.5
HCS1P34243 TRM9YML014W 840 nt11.88□□□□□ -0.51
HCS1P34243 EMI2YDR516C 1503 nt11.86□□□□□ -0.51
HCS1P34243 YMR090WYMR090W 684 nt11.82□□□□□ -0.52
HCS1P34243 LSM3YLR438C-A 270 nt11.8□□□□□ -0.52
HCS1P34243 RPP2AYOL039W 321 nt11.8□□□□□ -0.52
HCS1P34243 CCT6YDR188W 1641 nt11.77□□□□□ -0.53
HCS1P34243 YDL221WYDL221W 552 nt11.75□□□□□ -0.53
HCS1P34243 PTP1YDL230W 1008 nt11.75□□□□□ -0.53
HCS1P34243 YGR021WYGR021W 873 nt11.74□□□□□ -0.53
HCS1P34243 YBR220CYBR220C 1683 nt11.74□□□□□ -0.53
HCS1P34243 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.73□□□□□ -0.53
HCS1P34243 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.73□□□□□ -0.53
HCS1P34243 SHU1YHL006C 453 nt11.73□□□□□ -0.53
HCS1P34243 CAC2YML102W 1407 nt11.73□□□□□ -0.53
HCS1P34243 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.72□□□□□ -0.53
HCS1P34243 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23 ms