RNA–Protein interactions for RNA: YBR253W

SRB6, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene SRB6, Length 366 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRB6	YBR253W	HPF1	Q05164	967 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	HMI1	Q12039	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	SWT1	Q12104	458 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	TRM11	Q12463	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
SRB6	YBR253W	SRB5	P32585	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	SWH1	P35845	1188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	UIP5	P36137	443 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	TAT1	P38085	619 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	SIF2	P38262	535 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	FMO1	P38866	432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	CHA4	P43634	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	TOF1	P53840	1238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	ATG29	Q12092	213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	SKS1	Q12505	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	CPR2	P23285	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	EMC1	P25574	760 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	TFB1	P32776	642 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	YHR054C	P38780	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	YJL206C	P39529	758 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	PCL7	P40186	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	FKH2	P41813	862 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	CTK2	P46962	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	PET130	P47065	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	ADA2	Q02336	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	NKP2	Q06162	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	MMR1	Q06324	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	TDA6	Q06466	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	AI1	P03875	834 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	PRP28	P23394	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	YIH1	P25637	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	HEL1	P36113	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	YHR218W	P38899	603 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	NUP60	P39705	539 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	AFG3	P39925	761 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	PIG2	P40187	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	YGR079W	P53249	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	USA1	Q03714	838 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	GTB1	Q04924	702 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	VPS38	Q05919	439 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRB6	YBR253W	GAL80	P04387	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	TPK2	P06245	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	CDC6	P09119	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	SYN8	P31377	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	COQ2	P32378	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	GYP6	P32806	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	MRPL7	P36519	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	MUP3	P38734	546 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	ATF1	P40353	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	FET5	P43561	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	CTR1	P49573	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	IMO32	P53219	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	VPS62	P53285	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	YNR068C	P53754	272 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	RIA1	P53893	1110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	CTF3	Q12748	733 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	SIR4	P11978	1358 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	EDE1	P34216	1381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	SNF2	P22082	1703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	BUD14	P27637	709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	PMT1	P33775	817 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB6	YBR253W	THI2	P38141	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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