RNA–Protein interactions for RNA: YOR179C

SYC1, Transcript of Subunit of the APT subcomplex of cleavage and polyadenylation factor, yeast

Gene SYC1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYC1	YOR179C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	UBP13	P38187	747 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	RTS1	P38903	757 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	PHM8	P40025	321 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	NDE1	P40215	560 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YPR003C	P53394	754 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	ATP23	P53722	227 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YKU80	Q04437	629 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	BSP1	Q06604	576 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	INH1	P01097	85 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	MAK32	P23060	363 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YBL029W	P38201	376 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	ERV46	P39727	415 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	JHD1	P40034	492 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	MRX1	P40050	688 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	RSM28	Q03430	361 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	TPO3	Q06451	622 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YCK1	P23291	538 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	MSS51	P32335	436 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	CIN1	P40987	1014 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	TCO89	Q08921	799 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	MAL33	P38157	468 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	ECM10	P39987	644 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	ORM2	Q06144	216 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	IRC3	Q06683	689 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	PET111	P08468	800 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	MET8	P15807	274 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	NUP1	P20676	1076 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	SGF29	P25554	259 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	ORC2	P32833	620 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	ESL1	P40456	1118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	YFR020W	P43600	232 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	ORC5	P50874	479 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	NGL3	Q03210	505 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	PSR1	Q07800	427 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	RTP1	Q12751	981 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	POL4	P25615	582 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	BUR6	P40096	142 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	CDC1	P40986	491 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	DSD1	P53095	428 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	TIM10	P87108	93 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	INA17	Q02888	182 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	PFA5	Q03289	374 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	ARP9	Q05123	467 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	SDH5	Q08230	162 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	FRE7	Q12333	620 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	MRP7	P12687	371 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	KAR3	P17119	729 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	VMA16	P23968	213 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	YCR006C	P25350	157 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	AGP2	P38090	596 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	IRC7	P43623	340 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	CTK2	P46962	323 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	LCL3	P53153	274 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	YML037C	Q03703	340 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	PDR8	Q06149	701 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	CIR2	Q08822	631 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	PFA4	Q12006	378 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	APN1	P22936	367 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	MBR1	P23493	339 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	PEP3	P27801	918 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SYC1	YOR179C	JNM1	P36224	373 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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