Protein–RNA interactions for Protein: P36075

CUE2, Ubiquitin-binding protein CUE2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE2P36075 NSR1YGR159C 1245 nt19.85■□□□□ 0.77
CUE2P36075 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.56■□□□□ 0.72
CUE2P36075 NOP1YDL014W 984 nt18.82■□□□□ 0.6
CUE2P36075 MDJ1YFL016C 1536 nt18.1■□□□□ 0.49
CUE2P36075 YKL036CYKL036C 393 nt16.91■□□□□ 0.3
CUE2P36075 YJL027CYJL027C 417 nt16.65■□□□□ 0.26
CUE2P36075 SRX1YKL086W 384 nt16.43■□□□□ 0.22
CUE2P36075 Q0297Q0297 156 nt16.3■□□□□ 0.2
CUE2P36075 DBP2YNL112W 1641 nt15.81■□□□□ 0.12
CUE2P36075 YCR051WYCR051W 669 nt15.56■□□□□ 0.08
CUE2P36075 YBR190WYBR190W 312 nt15.55■□□□□ 0.08
CUE2P36075 RTC3YHR087W 336 nt15.18■□□□□ 0.02
CUE2P36075 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.15■□□□□ 0.02
CUE2P36075 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.15■□□□□ 0.02
CUE2P36075 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.15■□□□□ 0.02
CUE2P36075 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.15■□□□□ 0.02
CUE2P36075 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.15■□□□□ 0.02
CUE2P36075 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.15■□□□□ 0.02
CUE2P36075 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.15■□□□□ 0.02
CUE2P36075 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.15■□□□□ 0.02
CUE2P36075 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.15■□□□□ 0.02
CUE2P36075 SCS3YGL126W 1143 nt15.14■□□□□ 0.01
CUE2P36075 CCC1YLR220W 969 nt14.99□□□□□ -0.01
CUE2P36075 RVS167YDR388W 1449 nt14.75□□□□□ -0.05
CUE2P36075 SSA3YBL075C 1950 nt14.71□□□□□ -0.05
CUE2P36075 YOL085CYOL085C 342 nt14.65□□□□□ -0.06
CUE2P36075 RPP1BYDL130W 321 nt14.63□□□□□ -0.07
CUE2P36075 SCJ1YMR214W 1134 nt14.6□□□□□ -0.07
CUE2P36075 PUT4YOR348C 1884 nt14.5□□□□□ -0.09
CUE2P36075 PKP1YIL042C 1185 nt14.49□□□□□ -0.09
CUE2P36075 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.17□□□□□ -0.14
CUE2P36075 SHR5YOL110W 714 nt14.13□□□□□ -0.15
CUE2P36075 ARE1YCR048W 1833 nt14.09□□□□□ -0.15
CUE2P36075 PET122YER153C 765 nt14.05□□□□□ -0.16
CUE2P36075 URN1YPR152C 1398 nt14.04□□□□□ -0.16
CUE2P36075 POA1YBR022W 534 nt14.01□□□□□ -0.17
CUE2P36075 SAH1YER043C 1350 nt13.97□□□□□ -0.17
CUE2P36075 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.92□□□□□ -0.18
CUE2P36075 OPI9YLR338W 858 nt13.92□□□□□ -0.18
CUE2P36075 DEP1YAL013W 1218 nt13.89□□□□□ -0.19
CUE2P36075 BSC6YOL137W 1494 nt13.8□□□□□ -0.2
CUE2P36075 SCR1SCR1 522 nt13.76□□□□□ -0.21
CUE2P36075 RPN10YHR200W 807 nt13.72□□□□□ -0.21
CUE2P36075 YDJ1YNL064C 1230 nt13.7□□□□□ -0.22
CUE2P36075 YNL208WYNL208W 600 nt13.62□□□□□ -0.23
CUE2P36075 RRN5YLR141W 1092 nt13.58□□□□□ -0.24
CUE2P36075 BUD23YCR047C 828 nt13.55□□□□□ -0.24
CUE2P36075 PUN1YLR414C 792 nt13.52□□□□□ -0.25
CUE2P36075 SPT5YML010W 3192 nt13.51□□□□□ -0.25
CUE2P36075 GAR1YHR089C 618 nt13.48□□□□□ -0.25
CUE2P36075 PTC2YER089C 1395 nt13.44□□□□□ -0.26
CUE2P36075 ATS1YAL020C 1002 nt13.39□□□□□ -0.27
CUE2P36075 YJR018WYJR018W 363 nt13.35□□□□□ -0.27
CUE2P36075 NAB2YGL122C 1578 nt13.33□□□□□ -0.28
CUE2P36075 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.31□□□□□ -0.28
CUE2P36075 SSA4YER103W 1929 nt13.27□□□□□ -0.29
CUE2P36075 RSB1YOR049C 1065 nt13.16□□□□□ -0.3
CUE2P36075 FIS1YIL065C 468 nt13.12□□□□□ -0.31
CUE2P36075 DAL1YIR027C 1383 nt13.07□□□□□ -0.32
CUE2P36075 TIR1YER011W 765 nt13.06□□□□□ -0.32
CUE2P36075 YJR120WYJR120W 351 nt13.05□□□□□ -0.32
CUE2P36075 FPR4YLR449W 1179 nt13.03□□□□□ -0.32
CUE2P36075 SSA1YAL005C 1929 nt13□□□□□ -0.33
CUE2P36075 MEP2YNL142W 1500 nt13□□□□□ -0.33
CUE2P36075 RPP2BYDR382W 333 nt12.96□□□□□ -0.33
CUE2P36075 PHO4YFR034C 939 nt12.95□□□□□ -0.34
CUE2P36075 INM2YDR287W 879 nt12.93□□□□□ -0.34
CUE2P36075 YPS1YLR120C 1710 nt12.87□□□□□ -0.35
CUE2P36075 BDF1YLR399C 2061 nt12.8□□□□□ -0.36
CUE2P36075 DCW1YKL046C 1350 nt12.79□□□□□ -0.36
CUE2P36075 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.76□□□□□ -0.37
CUE2P36075 YBL100CYBL100C 315 nt12.75□□□□□ -0.37
CUE2P36075 YDR095CYDR095C 411 nt12.7□□□□□ -0.38
CUE2P36075 SRB2YHR041C 633 nt12.7□□□□□ -0.38
CUE2P36075 TAT1YBR069C 1860 nt12.63□□□□□ -0.39
CUE2P36075 BDH2YAL061W 1254 nt12.62□□□□□ -0.39
CUE2P36075 EMI2YDR516C 1503 nt12.61□□□□□ -0.39
CUE2P36075 FUN26YAL022C 1554 nt12.58□□□□□ -0.4
CUE2P36075 YMR090WYMR090W 684 nt12.56□□□□□ -0.4
CUE2P36075 YBR220CYBR220C 1683 nt12.54□□□□□ -0.4
CUE2P36075 ALF1YNL148C 765 nt12.5□□□□□ -0.41
CUE2P36075 YDL221WYDL221W 552 nt12.49□□□□□ -0.41
CUE2P36075 PST2YDR032C 597 nt12.48□□□□□ -0.41
CUE2P36075 PTP1YDL230W 1008 nt12.47□□□□□ -0.41
CUE2P36075 RPP2AYOL039W 321 nt12.46□□□□□ -0.41
CUE2P36075 CAC2YML102W 1407 nt12.45□□□□□ -0.42
CUE2P36075 TRM9YML014W 840 nt12.45□□□□□ -0.42
CUE2P36075 SDH1YKL148C 1923 nt12.42□□□□□ -0.42
CUE2P36075 WWM1YFL010C 636 nt12.4□□□□□ -0.42
CUE2P36075 CCT6YDR188W 1641 nt12.37□□□□□ -0.43
CUE2P36075 LSM3YLR438C-A 270 nt12.35□□□□□ -0.43
CUE2P36075 SIS1YNL007C 1059 nt12.31□□□□□ -0.44
CUE2P36075 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.29□□□□□ -0.44
CUE2P36075 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.29□□□□□ -0.44
CUE2P36075 SCC4YER147C 1875 nt12.27□□□□□ -0.44
CUE2P36075 IRC15YPL017C 1500 nt12.27□□□□□ -0.44
CUE2P36075 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.21□□□□□ -0.45
CUE2P36075 GIS3YLR094C 1509 nt12.2□□□□□ -0.46
CUE2P36075 YGR021WYGR021W 873 nt12.18□□□□□ -0.46
CUE2P36075 ART5YGR068C 1761 nt12.18□□□□□ -0.46
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