RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	RPO26	P20435	155 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	DAL2	P25335	343 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	SEC9	P40357	651 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	HOS4	P40480	1083 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YML122C	Q03207	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	VPS72	Q03388	795 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	VTI1	Q04338	217 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	CTF3	Q12748	733 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YLR462W	O13556	202 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	COX4	P04037	155 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	GAL80	P04387	435 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	HAP2	P06774	265 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	PUT4	P15380	627 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	SFL1	P20134	766 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	AEP2	P22136	580 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
CPR4	YCR069W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	MMS21	P38632	267 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YHL049C	P38722	271 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	OCA5	P38738	679 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YHR202W	P38887	602 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YEL075C	P39972	122 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	DSE1	P40077	573 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YER189W	P40104	122 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YFL064C	P43540	174 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	SNZ3	P43545	298 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	HLJ1	P48353	224 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	MAL11	P53048	616 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	SNZ2	P53824	298 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	RPN4	Q03465	531 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	IVY1	Q04934	453 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	LAA1	P39526	2014 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	ERG11	P10614	530 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	RRT12	P25381	491 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	GAC1	P28006	793 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	PRR1	P28708	518 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	CBF2	P32504	956 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	MTC2	P34246	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	RPC37	P36121	282 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	DRE2	P36152	348 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	HMT1	P38074	348 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	PCA1	P38360	1216 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	LYS9	P38999	446 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	FMP52	P40008	231 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	PXA1	P41909	870 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	GAD1	Q04792	585 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	ATG23	Q06671	453 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	SGO1	Q08490	590 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
CPR4	YCR069W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	TPK1	P06244	397 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	CHS1	P08004	1131 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	IME1	P21190	360 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	VBA3	P25594	458 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	MRP4	P32902	394 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	LTV1	P34078	463 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	APN2	P38207	520 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	SLX1	P38324	304 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	SWC5	P38326	303 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	RRT2	P38332	387 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	SMF1	P38925	575 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	ERP2	P39704	215 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	ATF1	P40353	525 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	ARG2	P40360	574 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	BAP3	P41815	604 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	VPS25	P47142	202 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	UBC11	P52492	156 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	TEL2	P53038	688 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	STP1	Q00947	519 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	ECI1	Q05871	280 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	SIL1	Q08199	421 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	AIM41	Q12032	185 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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