Protein–RNA interactions for Protein: P38324

SLX1, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, yeastyeast

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX1P38324 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.1■■□□□ 1.13
SLX1P38324 NOP1YDL014W 984 nt21.62■■□□□ 1.05
SLX1P38324 NSR1YGR159C 1245 nt21.53■■□□□ 1.04
SLX1P38324 YKL036CYKL036C 393 nt20.35■□□□□ 0.85
SLX1P38324 YJL027CYJL027C 417 nt19.1■□□□□ 0.65
SLX1P38324 Q0297Q0297 156 nt19.05■□□□□ 0.64
SLX1P38324 SRX1YKL086W 384 nt18.88■□□□□ 0.61
SLX1P38324 MDJ1YFL016C 1536 nt18.77■□□□□ 0.6
SLX1P38324 SCS3YGL126W 1143 nt18.74■□□□□ 0.59
SLX1P38324 YCR051WYCR051W 669 nt18.01■□□□□ 0.47
SLX1P38324 YOL085CYOL085C 342 nt17.63■□□□□ 0.41
SLX1P38324 PKP1YIL042C 1185 nt17.36■□□□□ 0.37
SLX1P38324 RPP1BYDL130W 321 nt17.11■□□□□ 0.33
SLX1P38324 SCJ1YMR214W 1134 nt17.08■□□□□ 0.32
SLX1P38324 ATS1YAL020C 1002 nt16.89■□□□□ 0.29
SLX1P38324 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SLX1P38324 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SLX1P38324 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SLX1P38324 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SLX1P38324 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SLX1P38324 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SLX1P38324 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SLX1P38324 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SLX1P38324 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SLX1P38324 DBP2YNL112W 1641 nt16.74■□□□□ 0.27
SLX1P38324 CCC1YLR220W 969 nt16.74■□□□□ 0.27
SLX1P38324 PET122YER153C 765 nt16.31■□□□□ 0.2
SLX1P38324 SCR1SCR1 522 nt16.25■□□□□ 0.19
SLX1P38324 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.08■□□□□ 0.16
SLX1P38324 RRN5YLR141W 1092 nt15.91■□□□□ 0.14
SLX1P38324 YBR190WYBR190W 312 nt15.85■□□□□ 0.13
SLX1P38324 RVS167YDR388W 1449 nt15.85■□□□□ 0.13
SLX1P38324 RSB1YOR049C 1065 nt15.71■□□□□ 0.11
SLX1P38324 RTC3YHR087W 336 nt15.62■□□□□ 0.09
SLX1P38324 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.59■□□□□ 0.09
SLX1P38324 PST2YDR032C 597 nt15.56■□□□□ 0.08
SLX1P38324 YDJ1YNL064C 1230 nt15.52■□□□□ 0.08
SLX1P38324 SHR5YOL110W 714 nt15.38■□□□□ 0.05
SLX1P38324 YKL097CYKL097C 411 nt15.18■□□□□ 0.02
SLX1P38324 GAR1YHR089C 618 nt15.17■□□□□ 0.02
SLX1P38324 DEP1YAL013W 1218 nt14.88□□□□□ -0.03
SLX1P38324 SHU1YHL006C 453 nt14.85□□□□□ -0.03
SLX1P38324 URN1YPR152C 1398 nt14.72□□□□□ -0.05
SLX1P38324 YNL208WYNL208W 600 nt14.64□□□□□ -0.07
SLX1P38324 TIR1YER011W 765 nt14.61□□□□□ -0.07
SLX1P38324 RPN10YHR200W 807 nt14.58□□□□□ -0.08
SLX1P38324 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.54□□□□□ -0.08
SLX1P38324 YOR139CYOR139C 393 nt14.49□□□□□ -0.09
SLX1P38324 SSA3YBL075C 1950 nt14.46□□□□□ -0.09
SLX1P38324 OPI9YLR338W 858 nt14.39□□□□□ -0.11
SLX1P38324 SSA1YAL005C 1929 nt14.35□□□□□ -0.11
SLX1P38324 NPL3YDR432W 1245 nt14.29□□□□□ -0.12
SLX1P38324 SAH1YER043C 1350 nt14.22□□□□□ -0.13
SLX1P38324 SRB2YHR041C 633 nt14.2□□□□□ -0.14
SLX1P38324 MNP1YGL068W 585 nt14.08□□□□□ -0.16
SLX1P38324 YJR018WYJR018W 363 nt14.07□□□□□ -0.16
SLX1P38324 WWM1YFL010C 636 nt14.06□□□□□ -0.16
SLX1P38324 YGR021WYGR021W 873 nt14.06□□□□□ -0.16
SLX1P38324 PUT4YOR348C 1884 nt14.05□□□□□ -0.16
SLX1P38324 HOM6YJR139C 1080 nt14.04□□□□□ -0.16
SLX1P38324 PUN1YLR414C 792 nt13.97□□□□□ -0.17
SLX1P38324 YOL037CYOL037C 354 nt13.96□□□□□ -0.17
SLX1P38324 ARE1YCR048W 1833 nt13.94□□□□□ -0.18
SLX1P38324 YJR120WYJR120W 351 nt13.92□□□□□ -0.18
SLX1P38324 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.91□□□□□ -0.18
SLX1P38324 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.91□□□□□ -0.18
SLX1P38324 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.91□□□□□ -0.18
SLX1P38324 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.91□□□□□ -0.18
SLX1P38324 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.91□□□□□ -0.18
SLX1P38324 RPP2BYDR382W 333 nt13.9□□□□□ -0.18
SLX1P38324 RKM5YLR137W 1104 nt13.84□□□□□ -0.19
SLX1P38324 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.78□□□□□ -0.2
SLX1P38324 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.78□□□□□ -0.2
SLX1P38324 PTC2YER089C 1395 nt13.76□□□□□ -0.21
SLX1P38324 POA1YBR022W 534 nt13.7□□□□□ -0.22
SLX1P38324 PUS2YGL063W 1113 nt13.68□□□□□ -0.22
SLX1P38324 BDH2YAL061W 1254 nt13.68□□□□□ -0.22
SLX1P38324 YLR281CYLR281C 468 nt13.62□□□□□ -0.23
SLX1P38324 LSM3YLR438C-A 270 nt13.57□□□□□ -0.24
SLX1P38324 BUD23YCR047C 828 nt13.54□□□□□ -0.24
SLX1P38324 WHI5YOR083W 888 nt13.54□□□□□ -0.24
SLX1P38324 MOT3YMR070W 1473 nt13.53□□□□□ -0.24
SLX1P38324 INM2YDR287W 879 nt13.5□□□□□ -0.25
SLX1P38324 NAB2YGL122C 1578 nt13.49□□□□□ -0.25
SLX1P38324 FPR4YLR449W 1179 nt13.46□□□□□ -0.25
SLX1P38324 YBL100CYBL100C 315 nt13.45□□□□□ -0.26
SLX1P38324 DAL1YIR027C 1383 nt13.41□□□□□ -0.26
SLX1P38324 TRM9YML014W 840 nt13.38□□□□□ -0.27
SLX1P38324 FMP45YDL222C 930 nt13.33□□□□□ -0.28
SLX1P38324 BSC6YOL137W 1494 nt13.32□□□□□ -0.28
SLX1P38324 FIS1YIL065C 468 nt13.32□□□□□ -0.28
SLX1P38324 YPR011CYPR011C 981 nt13.32□□□□□ -0.28
SLX1P38324 FUN26YAL022C 1554 nt13.31□□□□□ -0.28
SLX1P38324 DSK2YMR276W 1122 nt13.29□□□□□ -0.28
SLX1P38324 PHO4YFR034C 939 nt13.27□□□□□ -0.29
SLX1P38324 YLR236CYLR236C 324 nt13.24□□□□□ -0.29
SLX1P38324 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.22□□□□□ -0.29
SLX1P38324 YCH1YGR203W 447 nt13.19□□□□□ -0.3
SLX1P38324 IMP2'YIL154C 1041 nt13.19□□□□□ -0.3
SLX1P38324 CCT6YDR188W 1641 nt13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.3 ms