RNA–Protein interactions for RNA: YLR356W

ATG33, Transcript of Mitochondrial mitophagy-specific protein, yeast

Gene ATG33, Length 594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG33	YLR356W	GLE1	Q12315	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	HSP42	Q12329	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	FRT1	Q99332	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	CLC1	P17891	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YSR3	P23501	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PSY4	P38193	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	AIM18	P38884	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	ELO3	P40319	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	STR2	P47164	639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YGL108C	P53139	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	GND2	P53319	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	DIC1	Q06143	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	TMA16	Q08687	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YPR015C	Q12531	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	COX5A	P00424	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SPC110	P32380	944 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
ATG33	YLR356W	RRN6	P32786	894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	NIP100	P33420	868 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SEF1	P34228	1148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	ARA1	P38115	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	MSR1	P38714	643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SMF1	P38925	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	ATM1	P40416	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SSU1	P41930	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	BIR1	P47134	954 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	VPS9	P54787	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	UFO1	Q04511	668 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	ENT2	Q05785	613 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PGC1	Q08959	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PFA4	Q12006	378 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	TRM8	Q12009	286 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	NHA1	Q99271	985 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PCT1	P13259	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	RED1	P14291	827 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	NTH1	P32356	751 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	AEP1	P32493	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	BIT2	P38346	545 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	DBP8	P38719	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	MMM1	P41800	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PMT3	P47190	753 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	HST3	P53687	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	ARP4	P80428	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	TMS1	Q12116	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	AIM44	Q99299	758 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
ATG33	YLR356W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	EPT1	P22140	391 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	RBK1	P25332	333 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	EMC1	P25574	760 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SKN1	P33336	771 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PET112	P33893	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	VFA1	P40080	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	FAU1	P40099	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	LRO1	P40345	661 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YFR018C	P43599	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	RIM21	P48565	533 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	RFX1	P48743	811 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	FRE4	P53746	719 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	CLN1	P20437	546 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YCR015C	P25616	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SIN4	P32259	974 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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