Protein–RNA interactions for Protein: P16550

APA1, Protein APA1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APA1P16550 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.4■□□□□ 0.86
APA1P16550 NSR1YGR159C 1245 nt20.22■□□□□ 0.83
APA1P16550 NOP1YDL014W 984 nt19.9■□□□□ 0.78
APA1P16550 YKL036CYKL036C 393 nt18.41■□□□□ 0.54
APA1P16550 MDJ1YFL016C 1536 nt17.84■□□□□ 0.45
APA1P16550 Q0297Q0297 156 nt17.4■□□□□ 0.38
APA1P16550 SRX1YKL086W 384 nt17.35■□□□□ 0.37
APA1P16550 YJL027CYJL027C 417 nt17.2■□□□□ 0.34
APA1P16550 SCS3YGL126W 1143 nt16.75■□□□□ 0.27
APA1P16550 YCR051WYCR051W 669 nt16.5■□□□□ 0.23
APA1P16550 YOL085CYOL085C 342 nt15.93■□□□□ 0.14
APA1P16550 DBP2YNL112W 1641 nt15.78■□□□□ 0.12
APA1P16550 PKP1YIL042C 1185 nt15.67■□□□□ 0.1
APA1P16550 RPP1BYDL130W 321 nt15.62■□□□□ 0.09
APA1P16550 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.61■□□□□ 0.09
APA1P16550 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.61■□□□□ 0.09
APA1P16550 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.61■□□□□ 0.09
APA1P16550 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.61■□□□□ 0.09
APA1P16550 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.61■□□□□ 0.09
APA1P16550 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.61■□□□□ 0.09
APA1P16550 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.61■□□□□ 0.09
APA1P16550 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.61■□□□□ 0.09
APA1P16550 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.61■□□□□ 0.09
APA1P16550 CCC1YLR220W 969 nt15.51■□□□□ 0.07
APA1P16550 YBR190WYBR190W 312 nt15.22■□□□□ 0.03
APA1P16550 ATS1YAL020C 1002 nt15.02■□□□□ -0
APA1P16550 SCJ1YMR214W 1134 nt14.95□□□□□ -0.02
APA1P16550 RVS167YDR388W 1449 nt14.94□□□□□ -0.02
APA1P16550 RTC3YHR087W 336 nt14.93□□□□□ -0.02
APA1P16550 PET122YER153C 765 nt14.9□□□□□ -0.02
APA1P16550 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.82□□□□□ -0.04
APA1P16550 SCR1SCR1 522 nt14.81□□□□□ -0.04
APA1P16550 RRN5YLR141W 1092 nt14.5□□□□□ -0.09
APA1P16550 SHR5YOL110W 714 nt14.41□□□□□ -0.1
APA1P16550 YDJ1YNL064C 1230 nt14.34□□□□□ -0.11
APA1P16550 RSB1YOR049C 1065 nt14.24□□□□□ -0.13
APA1P16550 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.2□□□□□ -0.14
APA1P16550 GAR1YHR089C 618 nt14.02□□□□□ -0.17
APA1P16550 DEP1YAL013W 1218 nt13.99□□□□□ -0.17
APA1P16550 URN1YPR152C 1398 nt13.96□□□□□ -0.17
APA1P16550 PST2YDR032C 597 nt13.89□□□□□ -0.19
APA1P16550 RPN10YHR200W 807 nt13.82□□□□□ -0.2
APA1P16550 Q0182Q0182 405 nt13.79□□□□□ -0.2
APA1P16550 YNL208WYNL208W 600 nt13.78□□□□□ -0.2
APA1P16550 OPI9YLR338W 858 nt13.74□□□□□ -0.21
APA1P16550 SSA3YBL075C 1950 nt13.73□□□□□ -0.21
APA1P16550 PUT4YOR348C 1884 nt13.7□□□□□ -0.22
APA1P16550 SAH1YER043C 1350 nt13.63□□□□□ -0.23
APA1P16550 TIR1YER011W 765 nt13.54□□□□□ -0.24
APA1P16550 ARE1YCR048W 1833 nt13.48□□□□□ -0.25
APA1P16550 YKL097CYKL097C 411 nt13.4□□□□□ -0.26
APA1P16550 PUN1YLR414C 792 nt13.36□□□□□ -0.27
APA1P16550 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.34□□□□□ -0.27
APA1P16550 YJR018WYJR018W 363 nt13.34□□□□□ -0.27
APA1P16550 POA1YBR022W 534 nt13.33□□□□□ -0.28
APA1P16550 MOT3YMR070W 1473 nt13.32□□□□□ -0.28
APA1P16550 SSA1YAL005C 1929 nt13.32□□□□□ -0.28
APA1P16550 SHU1YHL006C 453 nt13.3□□□□□ -0.28
APA1P16550 PTC2YER089C 1395 nt13.17□□□□□ -0.3
APA1P16550 RPP2BYDR382W 333 nt13.12□□□□□ -0.31
APA1P16550 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.09□□□□□ -0.31
APA1P16550 BUD23YCR047C 828 nt13.08□□□□□ -0.32
APA1P16550 SRB2YHR041C 633 nt13.08□□□□□ -0.32
APA1P16550 YJR120WYJR120W 351 nt13.07□□□□□ -0.32
APA1P16550 BSC6YOL137W 1494 nt13.01□□□□□ -0.33
APA1P16550 NAB2YGL122C 1578 nt12.99□□□□□ -0.33
APA1P16550 WWM1YFL010C 636 nt12.95□□□□□ -0.34
APA1P16550 YGR021WYGR021W 873 nt12.92□□□□□ -0.34
APA1P16550 INM2YDR287W 879 nt12.87□□□□□ -0.35
APA1P16550 HOM6YJR139C 1080 nt12.84□□□□□ -0.35
APA1P16550 FPR4YLR449W 1179 nt12.84□□□□□ -0.35
APA1P16550 DAL1YIR027C 1383 nt12.83□□□□□ -0.36
APA1P16550 BDH2YAL061W 1254 nt12.83□□□□□ -0.36
APA1P16550 YOR139CYOR139C 393 nt12.8□□□□□ -0.36
APA1P16550 MNP1YGL068W 585 nt12.78□□□□□ -0.36
APA1P16550 FIS1YIL065C 468 nt12.76□□□□□ -0.37
APA1P16550 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.75□□□□□ -0.37
APA1P16550 NPL3YDR432W 1245 nt12.74□□□□□ -0.37
APA1P16550 YBL100CYBL100C 315 nt12.73□□□□□ -0.37
APA1P16550 PHO4YFR034C 939 nt12.7□□□□□ -0.38
APA1P16550 LSM3YLR438C-A 270 nt12.7□□□□□ -0.38
APA1P16550 RKM5YLR137W 1104 nt12.66□□□□□ -0.38
APA1P16550 TRM9YML014W 840 nt12.62□□□□□ -0.39
APA1P16550 YOL037CYOL037C 354 nt12.62□□□□□ -0.39
APA1P16550 FUN26YAL022C 1554 nt12.59□□□□□ -0.39
APA1P16550 ALF1YNL148C 765 nt12.43□□□□□ -0.42
APA1P16550 CCT6YDR188W 1641 nt12.43□□□□□ -0.42
APA1P16550 YPS1YLR120C 1710 nt12.4□□□□□ -0.42
APA1P16550 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.37□□□□□ -0.43
APA1P16550 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.37□□□□□ -0.43
APA1P16550 YDR095CYDR095C 411 nt12.35□□□□□ -0.43
APA1P16550 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.32□□□□□ -0.44
APA1P16550 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.32□□□□□ -0.44
APA1P16550 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.32□□□□□ -0.44
APA1P16550 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.32□□□□□ -0.44
APA1P16550 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.32□□□□□ -0.44
APA1P16550 YLR281CYLR281C 468 nt12.32□□□□□ -0.44
APA1P16550 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.31□□□□□ -0.44
APA1P16550 WHI5YOR083W 888 nt12.29□□□□□ -0.44
APA1P16550 PUS2YGL063W 1113 nt12.25□□□□□ -0.45
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