Protein–RNA interactions for Protein: P22217

TRX1, Thioredoxin-1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRX1P22217 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.34■■□□□ 1.01
TRX1P22217 NSR1YGR159C 1245 nt21.3■■□□□ 1
TRX1P22217 NOP1YDL014W 984 nt20.7■□□□□ 0.9
TRX1P22217 YKL036CYKL036C 393 nt19.02■□□□□ 0.64
TRX1P22217 MDJ1YFL016C 1536 nt19■□□□□ 0.63
TRX1P22217 Q0297Q0297 156 nt18.1■□□□□ 0.49
TRX1P22217 SRX1YKL086W 384 nt18.1■□□□□ 0.49
TRX1P22217 YJL027CYJL027C 417 nt17.74■□□□□ 0.43
TRX1P22217 SCS3YGL126W 1143 nt17.26■□□□□ 0.35
TRX1P22217 YCR051WYCR051W 669 nt17.18■□□□□ 0.34
TRX1P22217 DBP2YNL112W 1641 nt16.79■□□□□ 0.28
TRX1P22217 YOL085CYOL085C 342 nt16.5■□□□□ 0.23
TRX1P22217 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.41■□□□□ 0.22
TRX1P22217 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.41■□□□□ 0.22
TRX1P22217 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.41■□□□□ 0.22
TRX1P22217 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.41■□□□□ 0.22
TRX1P22217 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.41■□□□□ 0.22
TRX1P22217 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.41■□□□□ 0.22
TRX1P22217 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.41■□□□□ 0.22
TRX1P22217 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.41■□□□□ 0.22
TRX1P22217 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.41■□□□□ 0.22
TRX1P22217 CCC1YLR220W 969 nt16.29■□□□□ 0.2
TRX1P22217 PKP1YIL042C 1185 nt16.28■□□□□ 0.2
TRX1P22217 RPP1BYDL130W 321 nt16.24■□□□□ 0.19
TRX1P22217 YBR190WYBR190W 312 nt16.22■□□□□ 0.19
TRX1P22217 RTC3YHR087W 336 nt15.87■□□□□ 0.13
TRX1P22217 RVS167YDR388W 1449 nt15.73■□□□□ 0.11
TRX1P22217 SCJ1YMR214W 1134 nt15.64■□□□□ 0.09
TRX1P22217 PET122YER153C 765 nt15.53■□□□□ 0.08
TRX1P22217 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.51■□□□□ 0.07
TRX1P22217 ATS1YAL020C 1002 nt15.42■□□□□ 0.06
TRX1P22217 SCR1SCR1 522 nt15.33■□□□□ 0.04
TRX1P22217 SHR5YOL110W 714 nt15.16■□□□□ 0.02
TRX1P22217 RRN5YLR141W 1092 nt15.1■□□□□ 0.01
TRX1P22217 YDJ1YNL064C 1230 nt14.99□□□□□ -0.01
TRX1P22217 URN1YPR152C 1398 nt14.82□□□□□ -0.04
TRX1P22217 PUT4YOR348C 1884 nt14.81□□□□□ -0.04
TRX1P22217 DEP1YAL013W 1218 nt14.8□□□□□ -0.04
TRX1P22217 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.79□□□□□ -0.04
TRX1P22217 RSB1YOR049C 1065 nt14.74□□□□□ -0.05
TRX1P22217 GAR1YHR089C 618 nt14.69□□□□□ -0.06
TRX1P22217 OPI9YLR338W 858 nt14.61□□□□□ -0.07
TRX1P22217 SAH1YER043C 1350 nt14.57□□□□□ -0.08
TRX1P22217 RPN10YHR200W 807 nt14.54□□□□□ -0.08
TRX1P22217 YNL208WYNL208W 600 nt14.53□□□□□ -0.08
TRX1P22217 ARE1YCR048W 1833 nt14.52□□□□□ -0.08
TRX1P22217 POA1YBR022W 534 nt14.36□□□□□ -0.11
TRX1P22217 PST2YDR032C 597 nt14.32□□□□□ -0.12
TRX1P22217 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.31□□□□□ -0.12
TRX1P22217 TIR1YER011W 765 nt14.2□□□□□ -0.14
TRX1P22217 PUN1YLR414C 792 nt14.17□□□□□ -0.14
TRX1P22217 YJR018WYJR018W 363 nt14.13□□□□□ -0.15
TRX1P22217 SSA1YAL005C 1929 nt14.06□□□□□ -0.16
TRX1P22217 PTC2YER089C 1395 nt14.05□□□□□ -0.16
TRX1P22217 BSC6YOL137W 1494 nt14.04□□□□□ -0.16
TRX1P22217 SSA3YBL075C 1950 nt14□□□□□ -0.17
TRX1P22217 BUD23YCR047C 828 nt13.99□□□□□ -0.17
TRX1P22217 YJR120WYJR120W 351 nt13.9□□□□□ -0.18
TRX1P22217 NAB2YGL122C 1578 nt13.86□□□□□ -0.19
TRX1P22217 SRB2YHR041C 633 nt13.82□□□□□ -0.2
TRX1P22217 RPP2BYDR382W 333 nt13.8□□□□□ -0.2
TRX1P22217 SHU1YHL006C 453 nt13.75□□□□□ -0.21
TRX1P22217 YKL097CYKL097C 411 nt13.67□□□□□ -0.22
TRX1P22217 DAL1YIR027C 1383 nt13.66□□□□□ -0.22
TRX1P22217 INM2YDR287W 879 nt13.64□□□□□ -0.23
TRX1P22217 FPR4YLR449W 1179 nt13.64□□□□□ -0.23
TRX1P22217 FIS1YIL065C 468 nt13.63□□□□□ -0.23
TRX1P22217 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.6□□□□□ -0.23
TRX1P22217 WWM1YFL010C 636 nt13.58□□□□□ -0.24
TRX1P22217 PHO4YFR034C 939 nt13.52□□□□□ -0.25
TRX1P22217 BDH2YAL061W 1254 nt13.52□□□□□ -0.25
TRX1P22217 YBL100CYBL100C 315 nt13.48□□□□□ -0.25
TRX1P22217 SPT5YML010W 3192 nt13.47□□□□□ -0.25
TRX1P22217 YGR021WYGR021W 873 nt13.42□□□□□ -0.26
TRX1P22217 HOM6YJR139C 1080 nt13.39□□□□□ -0.27
TRX1P22217 FUN26YAL022C 1554 nt13.33□□□□□ -0.28
TRX1P22217 LSM3YLR438C-A 270 nt13.33□□□□□ -0.28
TRX1P22217 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.32□□□□□ -0.28
TRX1P22217 MNP1YGL068W 585 nt13.32□□□□□ -0.28
TRX1P22217 YPS1YLR120C 1710 nt13.31□□□□□ -0.28
TRX1P22217 TRM9YML014W 840 nt13.3□□□□□ -0.28
TRX1P22217 YDR095CYDR095C 411 nt13.2□□□□□ -0.3
TRX1P22217 RKM5YLR137W 1104 nt13.19□□□□□ -0.3
TRX1P22217 MEP2YNL142W 1500 nt13.18□□□□□ -0.3
TRX1P22217 YOR139CYOR139C 393 nt13.17□□□□□ -0.3
TRX1P22217 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.16□□□□□ -0.3
TRX1P22217 CCT6YDR188W 1641 nt13.15□□□□□ -0.3
TRX1P22217 ALF1YNL148C 765 nt13.15□□□□□ -0.3
TRX1P22217 NPL3YDR432W 1245 nt13.05□□□□□ -0.32
TRX1P22217 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.03□□□□□ -0.32
TRX1P22217 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.03□□□□□ -0.32
TRX1P22217 YOL037CYOL037C 354 nt13.02□□□□□ -0.33
TRX1P22217 DCW1YKL046C 1350 nt13□□□□□ -0.33
TRX1P22217 SSA4YER103W 1929 nt12.98□□□□□ -0.33
TRX1P22217 SIS1YNL007C 1059 nt12.97□□□□□ -0.33
TRX1P22217 RPP2AYOL039W 321 nt12.96□□□□□ -0.33
TRX1P22217 PTP1YDL230W 1008 nt12.94□□□□□ -0.34
TRX1P22217 Q0182Q0182 405 nt12.86□□□□□ -0.35
TRX1P22217 CAC2YML102W 1407 nt12.86□□□□□ -0.35
TRX1P22217 EMI2YDR516C 1503 nt12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.9 ms