RNA–Protein interactions for RNA: YHR106W

TRR2, Transcript of Mitochondrial thioredoxin reductase, yeast

Gene TRR2, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRR2	YHR106W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.19	□□□□□ -1.26	not detected
TRR2	YHR106W	PLC1	P32383	869 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	UTR2	P32623	467 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	CTF13	P35203	478 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	POP4	P38336	279 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	SMF1	P38925	575 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	NDC80	P40460	691 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	DSN1	P40568	576 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	ERR3	P42222	437 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	RTA1	P53047	317 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	CDC73	Q06697	393 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	ADY3	Q07732	790 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	GAL11	P19659	1081 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	RBK1	P25332	333 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	SNT1	P25357	1226 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	DCC1	P25559	380 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	CIN8	P27895	1000 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	TFA2	P36145	328 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	MUM2	P38236	366 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	SCC4	P40090	624 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	SAP4	P53036	818 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	SWS2	P53937	143 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	EFM6	P53970	246 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	NUP100	Q02629	959 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	TRM82	Q03774	444 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	YDR132C	Q03900	495 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	VTI1	Q04338	217 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	ESC2	Q06340	456 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	OPT2	Q06593	877 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	YLR149C	Q99296	730 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	PEP5	P12868	1029 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	PET123	P17558	318 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	NDI1	P32340	513 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	TAE1	P38340	232 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	YFR018C	P43599	363 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	SUM1	P46676	1062 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	YGL108C	P53139	140 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	SWC4	P53201	476 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	TIM13	P53299	105 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	MAL13	P53338	473 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	CIA1	Q05583	330 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	RTT10	Q08924	1013 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	MCM16	Q12262	181 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	PHO11	P35842	467 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	BYE1	P36106	594 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	LDB7	P38210	180 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	IML3	P38265	245 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	VHC1	P38329	1120 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	PHO12	P38693	467 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	DBP8	P38719	431 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	NMD5	P46970	1048 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	YMR160W	Q03823	816 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	URH1	Q04179	340 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	NUT2	Q06213	157 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	YFT2	Q06676	274 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	ATG10	Q07879	167 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	VPS68	Q12016	184 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	PET111	P08468	800 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	MPH2	P0CD99	609 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	INO1	P11986	533 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	GID7	P25569	745 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	DPB3	P27344	201 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	CNS1	P33313	385 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	PEX5	P35056	612 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	YSW1	P38280	609 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	SMF2	P38778	549 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	ERV46	P39727	415 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	RGI2	P40188	164 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TRR2	YHR106W	FET5	P43561	622 aa		7.15	□□□□□ -1.26

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40.3 ms