Protein–RNA interactions for Protein: Q07879

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG10Q07879 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.34■□□□□ 0.85
ATG10Q07879 NSR1YGR159C 1245 nt20.08■□□□□ 0.81
ATG10Q07879 NOP1YDL014W 984 nt19.88■□□□□ 0.77
ATG10Q07879 YKL036CYKL036C 393 nt18.55■□□□□ 0.56
ATG10Q07879 MDJ1YFL016C 1536 nt17.6■□□□□ 0.41
ATG10Q07879 Q0297Q0297 156 nt17.5■□□□□ 0.39
ATG10Q07879 SRX1YKL086W 384 nt17.39■□□□□ 0.37
ATG10Q07879 YJL027CYJL027C 417 nt17.34■□□□□ 0.37
ATG10Q07879 SCS3YGL126W 1143 nt16.99■□□□□ 0.31
ATG10Q07879 YCR051WYCR051W 669 nt16.49■□□□□ 0.23
ATG10Q07879 YOL085CYOL085C 342 nt16.08■□□□□ 0.16
ATG10Q07879 PKP1YIL042C 1185 nt15.78■□□□□ 0.12
ATG10Q07879 RPP1BYDL130W 321 nt15.7■□□□□ 0.1
ATG10Q07879 DBP2YNL112W 1641 nt15.69■□□□□ 0.1
ATG10Q07879 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.6■□□□□ 0.09
ATG10Q07879 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.6■□□□□ 0.09
ATG10Q07879 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.6■□□□□ 0.09
ATG10Q07879 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.6■□□□□ 0.09
ATG10Q07879 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.6■□□□□ 0.09
ATG10Q07879 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.6■□□□□ 0.09
ATG10Q07879 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.6■□□□□ 0.09
ATG10Q07879 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.6■□□□□ 0.09
ATG10Q07879 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.6■□□□□ 0.09
ATG10Q07879 CCC1YLR220W 969 nt15.41■□□□□ 0.06
ATG10Q07879 SCJ1YMR214W 1134 nt15.34■□□□□ 0.05
ATG10Q07879 ATS1YAL020C 1002 nt15.27■□□□□ 0.04
ATG10Q07879 YBR190WYBR190W 312 nt14.97□□□□□ -0.01
ATG10Q07879 PET122YER153C 765 nt14.96□□□□□ -0.01
ATG10Q07879 SCR1SCR1 522 nt14.84□□□□□ -0.03
ATG10Q07879 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.83□□□□□ -0.04
ATG10Q07879 RVS167YDR388W 1449 nt14.75□□□□□ -0.05
ATG10Q07879 RTC3YHR087W 336 nt14.62□□□□□ -0.07
ATG10Q07879 RRN5YLR141W 1092 nt14.56□□□□□ -0.08
ATG10Q07879 YDJ1YNL064C 1230 nt14.35□□□□□ -0.11
ATG10Q07879 SHR5YOL110W 714 nt14.31□□□□□ -0.12
ATG10Q07879 RSB1YOR049C 1065 nt14.29□□□□□ -0.12
ATG10Q07879 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.28□□□□□ -0.12
ATG10Q07879 PST2YDR032C 597 nt14.12□□□□□ -0.15
ATG10Q07879 GAR1YHR089C 618 nt13.96□□□□□ -0.17
ATG10Q07879 DEP1YAL013W 1218 nt13.82□□□□□ -0.2
ATG10Q07879 URN1YPR152C 1398 nt13.78□□□□□ -0.2
ATG10Q07879 YNL208WYNL208W 600 nt13.64□□□□□ -0.23
ATG10Q07879 YKL097CYKL097C 411 nt13.63□□□□□ -0.23
ATG10Q07879 RPN10YHR200W 807 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG10Q07879 OPI9YLR338W 858 nt13.56□□□□□ -0.24
ATG10Q07879 TIR1YER011W 765 nt13.5□□□□□ -0.25
ATG10Q07879 SHU1YHL006C 453 nt13.48□□□□□ -0.25
ATG10Q07879 PUT4YOR348C 1884 nt13.44□□□□□ -0.26
ATG10Q07879 SAH1YER043C 1350 nt13.4□□□□□ -0.26
ATG10Q07879 SSA1YAL005C 1929 nt13.31□□□□□ -0.28
ATG10Q07879 ARE1YCR048W 1833 nt13.26□□□□□ -0.29
ATG10Q07879 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.2□□□□□ -0.3
ATG10Q07879 YJR018WYJR018W 363 nt13.17□□□□□ -0.3
ATG10Q07879 PUN1YLR414C 792 nt13.15□□□□□ -0.3
ATG10Q07879 SRB2YHR041C 633 nt13.14□□□□□ -0.31
ATG10Q07879 YOR139CYOR139C 393 nt13.08□□□□□ -0.32
ATG10Q07879 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.06□□□□□ -0.32
ATG10Q07879 YJR120WYJR120W 351 nt13.04□□□□□ -0.32
ATG10Q07879 POA1YBR022W 534 nt13.02□□□□□ -0.33
ATG10Q07879 WWM1YFL010C 636 nt12.95□□□□□ -0.34
ATG10Q07879 PTC2YER089C 1395 nt12.94□□□□□ -0.34
ATG10Q07879 RPP2BYDR382W 333 nt12.93□□□□□ -0.34
ATG10Q07879 YGR021WYGR021W 873 nt12.92□□□□□ -0.34
ATG10Q07879 HOM6YJR139C 1080 nt12.91□□□□□ -0.34
ATG10Q07879 SSA3YBL075C 1950 nt12.89□□□□□ -0.35
ATG10Q07879 NPL3YDR432W 1245 nt12.88□□□□□ -0.35
ATG10Q07879 MNP1YGL068W 585 nt12.86□□□□□ -0.35
ATG10Q07879 BUD23YCR047C 828 nt12.77□□□□□ -0.37
ATG10Q07879 NAB2YGL122C 1578 nt12.76□□□□□ -0.37
ATG10Q07879 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.74□□□□□ -0.37
ATG10Q07879 BDH2YAL061W 1254 nt12.74□□□□□ -0.37
ATG10Q07879 YOL037CYOL037C 354 nt12.74□□□□□ -0.37
ATG10Q07879 RKM5YLR137W 1104 nt12.71□□□□□ -0.37
ATG10Q07879 BSC6YOL137W 1494 nt12.69□□□□□ -0.38
ATG10Q07879 INM2YDR287W 879 nt12.68□□□□□ -0.38
ATG10Q07879 LSM3YLR438C-A 270 nt12.64□□□□□ -0.39
ATG10Q07879 DAL1YIR027C 1383 nt12.63□□□□□ -0.39
ATG10Q07879 FIS1YIL065C 468 nt12.6□□□□□ -0.39
ATG10Q07879 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.57□□□□□ -0.4
ATG10Q07879 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.57□□□□□ -0.4
ATG10Q07879 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.57□□□□□ -0.4
ATG10Q07879 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.57□□□□□ -0.4
ATG10Q07879 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.57□□□□□ -0.4
ATG10Q07879 YBL100CYBL100C 315 nt12.57□□□□□ -0.4
ATG10Q07879 FPR4YLR449W 1179 nt12.56□□□□□ -0.4
ATG10Q07879 PHO4YFR034C 939 nt12.5□□□□□ -0.41
ATG10Q07879 TRM9YML014W 840 nt12.46□□□□□ -0.41
ATG10Q07879 YLR281CYLR281C 468 nt12.45□□□□□ -0.42
ATG10Q07879 FUN26YAL022C 1554 nt12.44□□□□□ -0.42
ATG10Q07879 PUS2YGL063W 1113 nt12.38□□□□□ -0.43
ATG10Q07879 WHI5YOR083W 888 nt12.36□□□□□ -0.43
ATG10Q07879 CCT6YDR188W 1641 nt12.33□□□□□ -0.43
ATG10Q07879 YPS1YLR120C 1710 nt12.2□□□□□ -0.46
ATG10Q07879 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.19□□□□□ -0.46
ATG10Q07879 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.19□□□□□ -0.46
ATG10Q07879 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.19□□□□□ -0.46
ATG10Q07879 ALF1YNL148C 765 nt12.19□□□□□ -0.46
ATG10Q07879 YDR095CYDR095C 411 nt12.16□□□□□ -0.46
ATG10Q07879 YPR011CYPR011C 981 nt12.14□□□□□ -0.47
ATG10Q07879 MOT3YMR070W 1473 nt12.13□□□□□ -0.47
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