Protein–RNA interactions for Protein: P40217

TIF34, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIF34P40217 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.23■□□□□ 0.83
TIF34P40217 NOP1YDL014W 984 nt19.84■□□□□ 0.77
TIF34P40217 NSR1YGR159C 1245 nt19.82■□□□□ 0.76
TIF34P40217 YKL036CYKL036C 393 nt18.65■□□□□ 0.58
TIF34P40217 Q0297Q0297 156 nt17.51■□□□□ 0.39
TIF34P40217 YJL027CYJL027C 417 nt17.46■□□□□ 0.39
TIF34P40217 SRX1YKL086W 384 nt17.35■□□□□ 0.37
TIF34P40217 MDJ1YFL016C 1536 nt17.22■□□□□ 0.35
TIF34P40217 SCS3YGL126W 1143 nt17.15■□□□□ 0.34
TIF34P40217 YCR051WYCR051W 669 nt16.45■□□□□ 0.22
TIF34P40217 YOL085CYOL085C 342 nt16.14■□□□□ 0.17
TIF34P40217 PKP1YIL042C 1185 nt15.82■□□□□ 0.12
TIF34P40217 RPP1BYDL130W 321 nt15.7■□□□□ 0.1
TIF34P40217 SCJ1YMR214W 1134 nt15.69■□□□□ 0.1
TIF34P40217 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.47■□□□□ 0.07
TIF34P40217 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.47■□□□□ 0.07
TIF34P40217 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.47■□□□□ 0.07
TIF34P40217 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.47■□□□□ 0.07
TIF34P40217 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.47■□□□□ 0.07
TIF34P40217 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.47■□□□□ 0.07
TIF34P40217 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.47■□□□□ 0.07
TIF34P40217 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.47■□□□□ 0.07
TIF34P40217 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.47■□□□□ 0.07
TIF34P40217 ATS1YAL020C 1002 nt15.45■□□□□ 0.06
TIF34P40217 DBP2YNL112W 1641 nt15.42■□□□□ 0.06
TIF34P40217 CCC1YLR220W 969 nt15.27■□□□□ 0.04
TIF34P40217 PET122YER153C 765 nt14.94□□□□□ -0.02
TIF34P40217 SCR1SCR1 522 nt14.88□□□□□ -0.03
TIF34P40217 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.75□□□□□ -0.05
TIF34P40217 YBR190WYBR190W 312 nt14.62□□□□□ -0.07
TIF34P40217 RVS167YDR388W 1449 nt14.57□□□□□ -0.08
TIF34P40217 RRN5YLR141W 1092 nt14.55□□□□□ -0.08
TIF34P40217 RSB1YOR049C 1065 nt14.34□□□□□ -0.11
TIF34P40217 YDJ1YNL064C 1230 nt14.29□□□□□ -0.12
TIF34P40217 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.28□□□□□ -0.12
TIF34P40217 RTC3YHR087W 336 nt14.28□□□□□ -0.12
TIF34P40217 PST2YDR032C 597 nt14.26□□□□□ -0.13
TIF34P40217 SHR5YOL110W 714 nt14.15□□□□□ -0.14
TIF34P40217 YKL097CYKL097C 411 nt13.87□□□□□ -0.19
TIF34P40217 GAR1YHR089C 618 nt13.86□□□□□ -0.19
TIF34P40217 DEP1YAL013W 1218 nt13.59□□□□□ -0.23
TIF34P40217 SHU1YHL006C 453 nt13.58□□□□□ -0.24
TIF34P40217 URN1YPR152C 1398 nt13.51□□□□□ -0.25
TIF34P40217 YNL208WYNL208W 600 nt13.45□□□□□ -0.26
TIF34P40217 RPN10YHR200W 807 nt13.41□□□□□ -0.26
TIF34P40217 TIR1YER011W 765 nt13.4□□□□□ -0.26
TIF34P40217 OPI9YLR338W 858 nt13.27□□□□□ -0.29
TIF34P40217 YOR139CYOR139C 393 nt13.26□□□□□ -0.29
TIF34P40217 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.23□□□□□ -0.29
TIF34P40217 SSA1YAL005C 1929 nt13.17□□□□□ -0.3
TIF34P40217 SAH1YER043C 1350 nt13.07□□□□□ -0.32
TIF34P40217 NPL3YDR432W 1245 nt13.04□□□□□ -0.32
TIF34P40217 SRB2YHR041C 633 nt13.01□□□□□ -0.33
TIF34P40217 PUT4YOR348C 1884 nt12.99□□□□□ -0.33
TIF34P40217 YGR021WYGR021W 873 nt12.93□□□□□ -0.34
TIF34P40217 YJR018WYJR018W 363 nt12.92□□□□□ -0.34
TIF34P40217 HOM6YJR139C 1080 nt12.9□□□□□ -0.34
TIF34P40217 PUN1YLR414C 792 nt12.88□□□□□ -0.35
TIF34P40217 WWM1YFL010C 636 nt12.87□□□□□ -0.35
TIF34P40217 ARE1YCR048W 1833 nt12.87□□□□□ -0.35
TIF34P40217 MNP1YGL068W 585 nt12.86□□□□□ -0.35
TIF34P40217 YJR120WYJR120W 351 nt12.83□□□□□ -0.36
TIF34P40217 YOL037CYOL037C 354 nt12.83□□□□□ -0.36
TIF34P40217 RPP2BYDR382W 333 nt12.75□□□□□ -0.37
TIF34P40217 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.72□□□□□ -0.37
TIF34P40217 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.72□□□□□ -0.37
TIF34P40217 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.72□□□□□ -0.37
TIF34P40217 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.72□□□□□ -0.37
TIF34P40217 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.72□□□□□ -0.37
TIF34P40217 RKM5YLR137W 1104 nt12.7□□□□□ -0.38
TIF34P40217 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.68□□□□□ -0.38
TIF34P40217 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.68□□□□□ -0.38
TIF34P40217 SSA3YBL075C 1950 nt12.64□□□□□ -0.39
TIF34P40217 PTC2YER089C 1395 nt12.64□□□□□ -0.39
TIF34P40217 POA1YBR022W 534 nt12.59□□□□□ -0.39
TIF34P40217 BDH2YAL061W 1254 nt12.58□□□□□ -0.4
TIF34P40217 YLR281CYLR281C 468 nt12.51□□□□□ -0.41
TIF34P40217 LSM3YLR438C-A 270 nt12.51□□□□□ -0.41
TIF34P40217 PUS2YGL063W 1113 nt12.47□□□□□ -0.41
TIF34P40217 NAB2YGL122C 1578 nt12.43□□□□□ -0.42
TIF34P40217 INM2YDR287W 879 nt12.43□□□□□ -0.42
TIF34P40217 BUD23YCR047C 828 nt12.4□□□□□ -0.42
TIF34P40217 WHI5YOR083W 888 nt12.39□□□□□ -0.43
TIF34P40217 MOT3YMR070W 1473 nt12.36□□□□□ -0.43
TIF34P40217 DAL1YIR027C 1383 nt12.35□□□□□ -0.43
TIF34P40217 YBL100CYBL100C 315 nt12.35□□□□□ -0.43
TIF34P40217 FIS1YIL065C 468 nt12.31□□□□□ -0.44
TIF34P40217 FPR4YLR449W 1179 nt12.29□□□□□ -0.44
TIF34P40217 TRM9YML014W 840 nt12.27□□□□□ -0.45
TIF34P40217 BSC6YOL137W 1494 nt12.26□□□□□ -0.45
TIF34P40217 FUN26YAL022C 1554 nt12.23□□□□□ -0.45
TIF34P40217 PHO4YFR034C 939 nt12.22□□□□□ -0.45
TIF34P40217 DSK2YMR276W 1122 nt12.17□□□□□ -0.46
TIF34P40217 YPR011CYPR011C 981 nt12.17□□□□□ -0.46
TIF34P40217 FMP45YDL222C 930 nt12.16□□□□□ -0.46
TIF34P40217 CCT6YDR188W 1641 nt12.15□□□□□ -0.46
TIF34P40217 IMP2'YIL154C 1041 nt12.14□□□□□ -0.47
TIF34P40217 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.12□□□□□ -0.47
TIF34P40217 YLR236CYLR236C 324 nt12.12□□□□□ -0.47
TIF34P40217 YCH1YGR203W 447 nt12.08□□□□□ -0.48
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