RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000072232.8

Tmod3-201, Transcript of Tropomodulin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tmod3, Length 3,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Dync2h1Q45VK7 4306 aa4.62□□□□□ -1.67
Tmod3-201ENSMUST00000072232 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa4.6□□□□□ -1.67
Tmod3-201ENSMUST00000072232 BC029722A0A0N4SW31 51 aa4.59□□□□□ -1.68
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa4.58□□□□□ -1.68
Tmod3-201ENSMUST00000072232 ApobE9Q414 4505 aa4.58□□□□□ -1.68
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa4.57□□□□□ -1.68
Tmod3-201ENSMUST00000072232 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa4.57□□□□□ -1.68
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Ryr1E9PZQ0 5035 aa4.57□□□□□ -1.68
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Camk2n1Q6QWF9 78 aa4.52□□□□□ -1.69
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Dnah2P0C6F1 4456 aa4.52□□□□□ -1.69
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Rps29P62274 56 aa4.52□□□□□ -1.69
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm19668J3QMD1 248 aa4.51□□□□□ -1.69
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Fat1A0A1L1SQU7 4645 aa4.5□□□□□ -1.69
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm40193A0A1B0GT39 78 aa4.48□□□□□ -1.69
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Pkd1O08852 4293 aa4.47□□□□□ -1.69
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Sec61bQ9CQS8 96 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
Tmod3-201ENSMUST00000072232 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa4.45□□□□□ -1.7
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap19-5O08632 62 aa4.45□□□□□ -1.7
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa4.42□□□□□ -1.7
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Fat2Q5F226 4351 aa4.39□□□□□ -1.71
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Fat3Q8BNA6 4555 aa4.39□□□□□ -1.71
Tmod3-201ENSMUST00000072232 SacsQ9JLC8 4582 aa4.36□□□□□ -1.71
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Pkhd1E9PZ36 4059 aa4.36□□□□□ -1.71
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap3-1A2A591 98 aa4.35□□□□□ -1.71
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa4.34□□□□□ -1.71
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa4.34□□□□□ -1.71
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Abca13Q5SSE9 5034 aa4.34□□□□□ -1.72
Tmod3-201ENSMUST00000072232 HydinQ80W93 5154 aa4.32□□□□□ -1.72
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Herc2Q4U2R1 4836 aa4.32□□□□□ -1.72
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm10318A0A1W2P728 225 aa4.3□□□□□ -1.72
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa4.28□□□□□ -1.72
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa4.27□□□□□ -1.73
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm17416Q30KP4 66 aa4.26□□□□□ -1.73
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lrp2A2ARV4 4660 aa4.25□□□□□ -1.73
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa4.24□□□□□ -1.73
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap13-1Q8K198 168 aa4.23□□□□□ -1.73
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Crct1Q6PAI5 102 aa4.21□□□□□ -1.74
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Tnp1P10856 55 aa4.2□□□□□ -1.74
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa4.2□□□□□ -1.74
Tmod3-201ENSMUST00000072232 PcloQ9QYX7 5068 aa4.18□□□□□ -1.74
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Dnah8Q91XQ0 4731 aa4.16□□□□□ -1.74
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm17402F6Z0L5 76 aa4.14□□□□□ -1.75
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lce1jD3YUU5 139 aa4.13□□□□□ -1.75
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa4.1□□□□□ -1.75
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lce1hQ9D6R3 140 aa4.07□□□□□ -1.76
Tmod3-201ENSMUST00000072232 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa4.06□□□□□ -1.76
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Herc1E9PZP8 4859 aa4.04□□□□□ -1.76
Tmod3-201ENSMUST00000072232 A0A1Y7VJ07 166 aa4.04□□□□□ -1.76
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Birc6O88738 4882 aa4.03□□□□□ -1.76
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa4.02□□□□□ -1.77
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Sprr2a3Q4KL71 83 aa3.96□□□□□ -1.78
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa3.96□□□□□ -1.78
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lce1bQ9D149 137 aa3.93□□□□□ -1.78
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lce1a1Q9CQH5 143 aa3.92□□□□□ -1.78
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lce1gQ9D195 139 aa3.92□□□□□ -1.78
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Ubr4A2AN08 5180 aa3.91□□□□□ -1.78
Tmod3-201ENSMUST00000072232 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa3.87□□□□□ -1.79
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap31-1Q9D644 177 aa3.86□□□□□ -1.79
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm18596A0A1W2P860 280 aa3.85□□□□□ -1.79
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap1-5A2A590 122 aa3.85□□□□□ -1.79
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap16-3Q8C1I6 86 aa3.82□□□□□ -1.8
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Ush2AQ2QI47 5193 aa3.78□□□□□ -1.8
Tmod3-201ENSMUST00000072232 LorP18165 486 aa3.78□□□□□ -1.8
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap19-3Q925H6 87 aa3.75□□□□□ -1.81
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Fat4Q2PZL6 4981 aa3.75□□□□□ -1.81
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap19-1Q925H2 87 aa3.73□□□□□ -1.81
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lce1eQ9D139 143 aa3.73□□□□□ -1.81
Tmod3-201ENSMUST00000072232 ZanO88799 5376 aa3.73□□□□□ -1.81
Tmod3-201ENSMUST00000072232 A0A286YCP9 139 aa3.73□□□□□ -1.81
Tmod3-201ENSMUST00000072232 4932415D10RikA0A1W2P6U8 4986 aa3.71□□□□□ -1.82
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa3.71□□□□□ -1.82
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Hmcn2A2AJ76 5100 aa3.66□□□□□ -1.82
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Rnf213E9Q555 5152 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lce1lQ9D1G7 135 aa3.64□□□□□ -1.83
Tmod3-201ENSMUST00000072232 4933428G20RikQ9D3X4 101 aa3.61□□□□□ -1.83
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap1-3A2A588 173 aa3.59□□□□□ -1.83
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap12-1Q9Z287 130 aa3.58□□□□□ -1.84
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm11559Q9D3H7 191 aa3.58□□□□□ -1.84
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap19-9aF8WH65 55 aa3.56□□□□□ -1.84
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm7735D3YX18 52 aa3.52□□□□□ -1.85
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm9789Q8BIG3 52 aa3.51□□□□□ -1.85
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap17-1A2A5X6 109 aa3.49□□□□□ -1.85
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Prm1P02319 51 aa3.49□□□□□ -1.85
Tmod3-201ENSMUST00000072232 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa3.48□□□□□ -1.85
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap19-9bQ99NG9 58 aa3.47□□□□□ -1.85
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lce1dQ9D731 133 aa3.46□□□□□ -1.86
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa3.46□□□□□ -1.86
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap9-5A2A5X3 358 aa3.43□□□□□ -1.86
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap8-1O08633 61 aa3.38□□□□□ -1.87
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Krtap19-2Q925I0 141 aa3.35□□□□□ -1.87
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm6358A0A087WPH4 74 aa3.32□□□□□ -1.88
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lce1iQ9D6P5 149 aa3.32□□□□□ -1.88
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Syne1Q6ZWR6 8799 aa3.31□□□□□ -1.88
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lce1a2Q9D1K4 149 aa3.29□□□□□ -1.88
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm10061D3Z714 54 aa3.26□□□□□ -1.89
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Mt2P02798 61 aa3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 138.2 ms