Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Krtap1-3A2A588 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krtap1-3A2A588 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krtap1-3A2A588 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap1-3A2A588 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krtap1-3A2A588 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krtap1-3A2A588 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krtap1-3A2A588 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krtap1-3A2A588 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krtap1-3A2A588 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Krtap1-3A2A588 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Krtap1-3A2A588 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krtap1-3A2A588 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krtap1-3A2A588 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krtap1-3A2A588 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krtap1-3A2A588 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krtap1-3A2A588 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krtap1-3A2A588 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krtap1-3A2A588 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap1-3A2A588 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krtap1-3A2A588 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krtap1-3A2A588 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krtap1-3A2A588 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krtap1-3A2A588 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krtap1-3A2A588 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krtap1-3A2A588 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap1-3A2A588 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krtap1-3A2A588 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krtap1-3A2A588 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krtap1-3A2A588 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krtap1-3A2A588 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krtap1-3A2A588 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krtap1-3A2A588 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krtap1-3A2A588 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krtap1-3A2A588 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krtap1-3A2A588 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krtap1-3A2A588 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krtap1-3A2A588 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krtap1-3A2A588 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krtap1-3A2A588 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krtap1-3A2A588 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krtap1-3A2A588 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krtap1-3A2A588 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krtap1-3A2A588 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krtap1-3A2A588 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krtap1-3A2A588 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krtap1-3A2A588 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap1-3A2A588 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap1-3A2A588 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap1-3A2A588 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap1-3A2A588 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krtap1-3A2A588 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap1-3A2A588 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap1-3A2A588 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krtap1-3A2A588 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krtap1-3A2A588 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap1-3A2A588 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap1-3A2A588 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap1-3A2A588 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap1-3A2A588 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap1-3A2A588 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap1-3A2A588 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap1-3A2A588 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap1-3A2A588 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap1-3A2A588 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krtap1-3A2A588 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krtap1-3A2A588 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krtap1-3A2A588 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krtap1-3A2A588 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap1-3A2A588 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap1-3A2A588 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krtap1-3A2A588 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krtap1-3A2A588 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap1-3A2A588 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap1-3A2A588 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap1-3A2A588 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krtap1-3A2A588 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krtap1-3A2A588 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krtap1-3A2A588 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krtap1-3A2A588 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krtap1-3A2A588 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krtap1-3A2A588 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krtap1-3A2A588 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krtap1-3A2A588 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krtap1-3A2A588 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap1-3A2A588 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap1-3A2A588 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap1-3A2A588 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krtap1-3A2A588 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krtap1-3A2A588 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krtap1-3A2A588 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krtap1-3A2A588 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krtap1-3A2A588 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krtap1-3A2A588 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krtap1-3A2A588 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krtap1-3A2A588 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krtap1-3A2A588 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krtap1-3A2A588 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krtap1-3A2A588 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krtap1-3A2A588 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms