Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4933428G20RikQ9D3X4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4933428G20RikQ9D3X4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933428G20RikQ9D3X4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4933428G20RikQ9D3X4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4933428G20RikQ9D3X4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4933428G20RikQ9D3X4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4933428G20RikQ9D3X4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4933428G20RikQ9D3X4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4933428G20RikQ9D3X4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4933428G20RikQ9D3X4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4933428G20RikQ9D3X4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4933428G20RikQ9D3X4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4933428G20RikQ9D3X4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
4933428G20RikQ9D3X4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4933428G20RikQ9D3X4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4933428G20RikQ9D3X4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4933428G20RikQ9D3X4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4933428G20RikQ9D3X4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4933428G20RikQ9D3X4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4933428G20RikQ9D3X4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
4933428G20RikQ9D3X4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
4933428G20RikQ9D3X4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
4933428G20RikQ9D3X4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
4933428G20RikQ9D3X4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4933428G20RikQ9D3X4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4933428G20RikQ9D3X4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4933428G20RikQ9D3X4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4933428G20RikQ9D3X4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4933428G20RikQ9D3X4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4933428G20RikQ9D3X4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4933428G20RikQ9D3X4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4933428G20RikQ9D3X4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4933428G20RikQ9D3X4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4933428G20RikQ9D3X4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4933428G20RikQ9D3X4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4933428G20RikQ9D3X4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
4933428G20RikQ9D3X4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4933428G20RikQ9D3X4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4933428G20RikQ9D3X4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4933428G20RikQ9D3X4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4933428G20RikQ9D3X4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
4933428G20RikQ9D3X4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4933428G20RikQ9D3X4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4933428G20RikQ9D3X4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4933428G20RikQ9D3X4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4933428G20RikQ9D3X4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4933428G20RikQ9D3X4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4933428G20RikQ9D3X4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
4933428G20RikQ9D3X4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4933428G20RikQ9D3X4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4933428G20RikQ9D3X4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4933428G20RikQ9D3X4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4933428G20RikQ9D3X4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
4933428G20RikQ9D3X4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
4933428G20RikQ9D3X4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
4933428G20RikQ9D3X4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4933428G20RikQ9D3X4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4933428G20RikQ9D3X4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4933428G20RikQ9D3X4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4933428G20RikQ9D3X4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4933428G20RikQ9D3X4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4933428G20RikQ9D3X4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4933428G20RikQ9D3X4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4933428G20RikQ9D3X4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4933428G20RikQ9D3X4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4933428G20RikQ9D3X4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4933428G20RikQ9D3X4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4933428G20RikQ9D3X4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
4933428G20RikQ9D3X4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4933428G20RikQ9D3X4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4933428G20RikQ9D3X4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4933428G20RikQ9D3X4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4933428G20RikQ9D3X4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933428G20RikQ9D3X4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933428G20RikQ9D3X4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933428G20RikQ9D3X4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
4933428G20RikQ9D3X4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933428G20RikQ9D3X4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4933428G20RikQ9D3X4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4933428G20RikQ9D3X4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4933428G20RikQ9D3X4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4933428G20RikQ9D3X4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
4933428G20RikQ9D3X4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4933428G20RikQ9D3X4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
4933428G20RikQ9D3X4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
4933428G20RikQ9D3X4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4933428G20RikQ9D3X4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4933428G20RikQ9D3X4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4933428G20RikQ9D3X4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms