Protein–RNA interactions for Protein: Q9D139

Lce1e, Late cornified envelope 1E, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce1eQ9D139 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lce1eQ9D139 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lce1eQ9D139 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lce1eQ9D139 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lce1eQ9D139 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lce1eQ9D139 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lce1eQ9D139 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lce1eQ9D139 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lce1eQ9D139 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lce1eQ9D139 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lce1eQ9D139 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Lce1eQ9D139 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lce1eQ9D139 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lce1eQ9D139 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Lce1eQ9D139 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Lce1eQ9D139 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Lce1eQ9D139 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lce1eQ9D139 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Lce1eQ9D139 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Lce1eQ9D139 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lce1eQ9D139 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lce1eQ9D139 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lce1eQ9D139 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lce1eQ9D139 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lce1eQ9D139 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lce1eQ9D139 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lce1eQ9D139 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lce1eQ9D139 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lce1eQ9D139 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lce1eQ9D139 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lce1eQ9D139 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lce1eQ9D139 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lce1eQ9D139 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Lce1eQ9D139 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lce1eQ9D139 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lce1eQ9D139 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lce1eQ9D139 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Lce1eQ9D139 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lce1eQ9D139 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lce1eQ9D139 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce1eQ9D139 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lce1eQ9D139 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lce1eQ9D139 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lce1eQ9D139 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lce1eQ9D139 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lce1eQ9D139 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lce1eQ9D139 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lce1eQ9D139 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lce1eQ9D139 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lce1eQ9D139 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lce1eQ9D139 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lce1eQ9D139 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lce1eQ9D139 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lce1eQ9D139 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lce1eQ9D139 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lce1eQ9D139 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Lce1eQ9D139 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lce1eQ9D139 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lce1eQ9D139 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lce1eQ9D139 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lce1eQ9D139 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce1eQ9D139 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lce1eQ9D139 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lce1eQ9D139 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lce1eQ9D139 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lce1eQ9D139 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lce1eQ9D139 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lce1eQ9D139 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lce1eQ9D139 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lce1eQ9D139 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lce1eQ9D139 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lce1eQ9D139 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lce1eQ9D139 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lce1eQ9D139 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lce1eQ9D139 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lce1eQ9D139 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lce1eQ9D139 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lce1eQ9D139 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lce1eQ9D139 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lce1eQ9D139 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lce1eQ9D139 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lce1eQ9D139 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lce1eQ9D139 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lce1eQ9D139 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lce1eQ9D139 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lce1eQ9D139 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lce1eQ9D139 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lce1eQ9D139 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lce1eQ9D139 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lce1eQ9D139 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lce1eQ9D139 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lce1eQ9D139 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lce1eQ9D139 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Lce1eQ9D139 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lce1eQ9D139 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lce1eQ9D139 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lce1eQ9D139 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lce1eQ9D139 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lce1eQ9D139 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lce1eQ9D139 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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