Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmcn2A2AJ76 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hmcn2A2AJ76 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hmcn2A2AJ76 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmcn2A2AJ76 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hmcn2A2AJ76 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hmcn2A2AJ76 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmcn2A2AJ76 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hmcn2A2AJ76 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hmcn2A2AJ76 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmcn2A2AJ76 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmcn2A2AJ76 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmcn2A2AJ76 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hmcn2A2AJ76 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmcn2A2AJ76 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmcn2A2AJ76 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmcn2A2AJ76 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmcn2A2AJ76 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmcn2A2AJ76 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmcn2A2AJ76 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hmcn2A2AJ76 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmcn2A2AJ76 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmcn2A2AJ76 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmcn2A2AJ76 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmcn2A2AJ76 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmcn2A2AJ76 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmcn2A2AJ76 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmcn2A2AJ76 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hmcn2A2AJ76 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmcn2A2AJ76 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmcn2A2AJ76 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmcn2A2AJ76 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmcn2A2AJ76 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmcn2A2AJ76 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmcn2A2AJ76 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmcn2A2AJ76 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmcn2A2AJ76 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmcn2A2AJ76 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hmcn2A2AJ76 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmcn2A2AJ76 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmcn2A2AJ76 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmcn2A2AJ76 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmcn2A2AJ76 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmcn2A2AJ76 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmcn2A2AJ76 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmcn2A2AJ76 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmcn2A2AJ76 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmcn2A2AJ76 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmcn2A2AJ76 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmcn2A2AJ76 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmcn2A2AJ76 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmcn2A2AJ76 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmcn2A2AJ76 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmcn2A2AJ76 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmcn2A2AJ76 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmcn2A2AJ76 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmcn2A2AJ76 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmcn2A2AJ76 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmcn2A2AJ76 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmcn2A2AJ76 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmcn2A2AJ76 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmcn2A2AJ76 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmcn2A2AJ76 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmcn2A2AJ76 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmcn2A2AJ76 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmcn2A2AJ76 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmcn2A2AJ76 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmcn2A2AJ76 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmcn2A2AJ76 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmcn2A2AJ76 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmcn2A2AJ76 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmcn2A2AJ76 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmcn2A2AJ76 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmcn2A2AJ76 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmcn2A2AJ76 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmcn2A2AJ76 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmcn2A2AJ76 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmcn2A2AJ76 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmcn2A2AJ76 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmcn2A2AJ76 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmcn2A2AJ76 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmcn2A2AJ76 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmcn2A2AJ76 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmcn2A2AJ76 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmcn2A2AJ76 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmcn2A2AJ76 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmcn2A2AJ76 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmcn2A2AJ76 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmcn2A2AJ76 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmcn2A2AJ76 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmcn2A2AJ76 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmcn2A2AJ76 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmcn2A2AJ76 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmcn2A2AJ76 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmcn2A2AJ76 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmcn2A2AJ76 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmcn2A2AJ76 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmcn2A2AJ76 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmcn2A2AJ76 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmcn2A2AJ76 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms