Protein–RNA interactions for Protein: F6Z0L5

Gm17402, Predicted gene, 17402, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17402F6Z0L5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17402F6Z0L5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17402F6Z0L5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17402F6Z0L5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17402F6Z0L5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17402F6Z0L5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17402F6Z0L5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm17402F6Z0L5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm17402F6Z0L5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm17402F6Z0L5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17402F6Z0L5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17402F6Z0L5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm17402F6Z0L5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm17402F6Z0L5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17402F6Z0L5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17402F6Z0L5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17402F6Z0L5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17402F6Z0L5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17402F6Z0L5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm17402F6Z0L5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17402F6Z0L5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17402F6Z0L5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17402F6Z0L5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17402F6Z0L5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17402F6Z0L5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17402F6Z0L5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17402F6Z0L5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17402F6Z0L5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17402F6Z0L5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17402F6Z0L5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17402F6Z0L5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17402F6Z0L5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17402F6Z0L5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17402F6Z0L5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17402F6Z0L5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17402F6Z0L5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm17402F6Z0L5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17402F6Z0L5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17402F6Z0L5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17402F6Z0L5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17402F6Z0L5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17402F6Z0L5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm17402F6Z0L5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17402F6Z0L5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17402F6Z0L5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17402F6Z0L5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17402F6Z0L5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17402F6Z0L5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17402F6Z0L5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17402F6Z0L5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17402F6Z0L5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17402F6Z0L5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17402F6Z0L5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17402F6Z0L5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17402F6Z0L5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17402F6Z0L5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17402F6Z0L5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17402F6Z0L5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17402F6Z0L5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17402F6Z0L5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17402F6Z0L5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17402F6Z0L5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm17402F6Z0L5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17402F6Z0L5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17402F6Z0L5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17402F6Z0L5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17402F6Z0L5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17402F6Z0L5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17402F6Z0L5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17402F6Z0L5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17402F6Z0L5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17402F6Z0L5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17402F6Z0L5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17402F6Z0L5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17402F6Z0L5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17402F6Z0L5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm17402F6Z0L5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17402F6Z0L5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17402F6Z0L5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17402F6Z0L5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17402F6Z0L5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17402F6Z0L5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17402F6Z0L5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm17402F6Z0L5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17402F6Z0L5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17402F6Z0L5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17402F6Z0L5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17402F6Z0L5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm17402F6Z0L5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm17402F6Z0L5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm17402F6Z0L5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm17402F6Z0L5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm17402F6Z0L5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm17402F6Z0L5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm17402F6Z0L5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm17402F6Z0L5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm17402F6Z0L5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm17402F6Z0L5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17402F6Z0L5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17402F6Z0L5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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