RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)D

tK(UUU)D, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)D, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)DtK(UUU)D RRT5P43607 289 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D RPC17P47076 161 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D NNF1P47149 201 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D COQ5P49017 307 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D APT1P49435 187 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D AMA1P50082 593 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D RTA1P53047 317 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YGL140CP53120 1219 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D TEP1P53916 434 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D AQR1P53943 586 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YDR131CQ03899 556 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D UFO1Q04511 668 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YFT2Q06676 274 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D VAC14Q06708 880 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D ADY3Q07732 790 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D CMS1Q07897 291 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data3.33□□□□□ -1.88not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D INH1P01097 85 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D INO1P11986 533 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D UBA1P22515 1024 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D AAT2P23542 418 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YSP3P25036 478 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YCR015CP25616 317 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D BRF1P29056 596 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D PLC1P32383 869 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D SPS19P32573 292 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D BYE1P36106 594 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D PCH2P38126 564 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D OLA1P38219 394 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D RCK2P38623 610 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YAT2P40017 923 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YMR134WP40207 237 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D TIF34P40217 347 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D NDC80P40460 691 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D RPL34BP40525 121 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D PXA1P41909 870 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D BRO1P48582 844 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D MNT2P53059 558 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D SIW14P53965 281 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D RPL22BP56628 122 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YPL113CQ02961 396 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D PIR1Q03178 341 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YDR109CQ04585 715 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D ARG7Q04728 441 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D CIA1Q05583 330 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YLR456WQ06199 204 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D ESC2Q06340 456 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D YLR001CQ07895 862 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D TFB4Q12004 338 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D APL4Q12028 832 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D AVL9Q12500 764 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D FRT1Q99332 602 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D Q0182Q9ZZW1 134 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D MDM35O60200 86 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D COX5AP00424 153 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D CPA1P07258 411 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D LEU1P07264 779 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D SBP1P10080 294 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D VAN1P23642 535 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D RAD57P25301 460 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D DCC1P25559 380 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D AEP1P32493 518 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D SPT16P32558 1035 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D RML2P32611 393 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YEL043WP32618 956 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D SLX5P32828 619 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D UBP14P38237 781 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D POP4P38336 279 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YBR259WP38338 688 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D SMF2P38778 549 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D PPE1P38796 400 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YPT35P38815 214 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D END3P39013 349 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D ELO1P39540 310 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D ATM1P40416 690 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D SER33P40510 469 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D REF2P42073 533 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D OSW7P43611 510 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D NUP85P46673 744 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D ARH1P48360 493 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D TRF5P48561 642 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D STR3P53101 465 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YGL108CP53139 140 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D SWC4P53201 476 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D RTS3P53289 263 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D CWC22P53333 577 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YPR003CP53394 754 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D YMR187CQ03236 431 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D TRM82Q03774 444 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D SML1Q04964 104 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)DtK(UUU)D ARP9Q05123 467 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.4 ms