RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeastyeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR104WYKR104W PDR12Q02785 1511 aa5.56□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W DNF3Q12674 1656 aa5.56□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W NOP16P40007 231 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W GPD2P41911 440 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W MRPL13Q02204 264 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W YCG1Q06680 1035 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W AFT2Q08957 416 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W ULA1Q12059 462 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data5.55□□□□□ -1.52not detected
YKR104WYKR104W NUC1P08466 329 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W CMK1P27466 446 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W FAT1P38225 669 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W SRP72P38688 640 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W ENP2P48234 707 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W SAP4P53036 818 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W MRPL19P53875 158 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W YKU80Q04437 629 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W IMH1Q06704 911 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W PSF3Q12146 194 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W PDR10P51533 1564 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W PRE4P30657 266 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W YMC1P32331 307 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W NOP4P37838 685 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W PIH1P38768 344 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W TMN3P40071 706 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W UPF3P48412 387 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W CPR8P53728 308 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W ARC35P53731 342 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W RIM13Q03792 727 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W TDA9Q04545 1251 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W IRC3Q06683 689 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR104WYKR104W CYB2P00175 591 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W STE4P18851 423 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W ATP12P22135 325 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W RAD16P31244 790 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W SAS3P34218 831 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W UME6P39001 836 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W YGR016WP53209 190 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W TIM10P87108 93 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W ARA2Q04212 335 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W ERG11P10614 530 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W YCL049CP25577 312 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W AXL2P38928 823 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W CAJ1P39101 391 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W SPC72P39723 622 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W STL1P39932 569 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W PSF2P40359 213 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W DPH1P40487 425 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W MAD3P47074 515 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W BTN2P53286 410 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W CBK1P53894 756 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W VID22Q05934 901 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W PGK1P00560 416 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W MTF2P10849 440 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W GUK1P15454 187 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data5.5□□□□□ -1.53not detected
YKR104WYKR104W BRF1P29056 596 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W DBF4P32325 704 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W TGL1P34163 548 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data5.5□□□□□ -1.53 RIP-Chip
YKR104WYKR104W EAF5P39995 279 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W SCS2P40075 244 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W LTP1P40347 161 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W YGL117WP53133 265 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W TRS23Q03784 219 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W TAF11Q04226 346 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W PSR1Q07800 427 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W AIM41Q12032 185 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W SMC6Q12749 1114 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W TRM3Q07527 1436 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W SEM1O94742 89 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W SNF1P06782 633 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W GLN4P13188 809 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W MET8P15807 274 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data5.49□□□□□ -1.53not detected
YKR104WYKR104W SPO16P17122 198 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W MRPL36P36531 177 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W FTR1P40088 404 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W RIC1P40395 1056 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W PRM2P40534 656 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W VID28P40547 921 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W IRC6P43615 237 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W MFM1Q02783 413 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W FCP1Q03254 732 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W ARG7Q04728 441 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W YDL073WQ07454 984 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W IQG1Q12280 1495 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR104WYKR104W USO1P25386 1790 aa5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 102.5 ms