RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	YKL050C	AFG2	P32794	780 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	LYS9	P38999	446 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	MRX1	P40050	688 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	PKP1	P40530	394 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	PXA1	P41909	870 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	SRC1	Q03707	834 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	GLO4	Q12320	285 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	GPM3	Q12326	303 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	KSS1	P14681	368 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	AFT1	P22149	690 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	SRB2	P34162	210 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	HEL1	P36113	551 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	YBL029W	P38201	376 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	PEX32	P38292	413 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	SSN3	P39073	555 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	VID28	P40547	921 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	DSD1	P53095	428 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	YSA1	Q01976	231 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	YPL277C	Q08989	487 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	NMD4	Q12129	218 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YKL050C	YKL050C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	FUS1	P11710	512 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	CPR2	P23285	205 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	HMX1	P32339	317 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	HXT4	P32467	576 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	NEM1	P38757	446 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	PIH1	P38768	344 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	HXT16	P47185	567 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YBP2	P53169	641 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	CGR1	P53188	120 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.84	□□□□□ -1.8	not detected
YKL050C	YKL050C	RRT8	Q08219	342 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	CIR2	Q08822	631 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	NSI1	Q12457	570 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	PTC5	Q12511	572 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YCR051W	P25631	222 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	DGR2	P32330	852 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	SFA1	P32771	386 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YHR054C	P38780	354 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	SMF1	P38925	575 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	FET4	P40988	552 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	CLA4	P48562	842 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	DSE4	P53753	1117 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	DSL1	P53847	754 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	GAL7	P08431	366 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	CBS1	P14066	229 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	GPT2	P36148	743 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YHL017W	P38745	532 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	PSD1	P39006	500 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	GIP4	P39732	760 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	SKP1	P52286	194 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	VID30	P53076	958 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	SKG3	Q06315	1026 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	ARR1	Q06596	294 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	FMP45	Q07651	309 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RIM20	Q12033	661 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	HMI1	Q12039	706 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TAO3	P40468	2376 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	DIF1	O13577	133 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	BIK1	P11709	440 aa		3.82	□□□□□ -1.8

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