RNA–Protein interactions for RNA: YDR297W

SUR2, Transcript of Sphinganine C4-hydroxylase, yeast

Gene SUR2, Length 1,050 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUR2	YDR297W	CGR1	P53188	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	YGR266W	P53326	701 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	DIP5	P53388	608 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	MEP3	P53390	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	MRPL19	P53875	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	ECM9	Q02202	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	RNT1	Q02555	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	DON1	Q05610	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	YIG1	Q08956	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	GPA1	P08539	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	CDC6	P09119	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	MRPL8	P22353	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	VPS17	P32913	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	PPQ1	P32945	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	STV1	P37296	890 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	APD1	P38281	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	RRM3	P38766	723 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
SUR2	YDR297W	SKP2	P42843	763 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	SNZ3	P43545	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	MDE1	P47095	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	TOM22	P49334	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	RET3	P53600	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	HST3	P53687	447 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	SNZ2	P53824	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	YHM2	Q04013	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	CRF1	Q04930	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
SUR2	YDR297W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	SOG2	Q08817	791 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	TRM8	Q12009	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	DCS2	Q12123	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	ARP7	Q12406	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	AHC1	Q12433	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	SEM1	O94742	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	CKA2	P19454	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	PRE8	P23639	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	CLB1	P24868	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	RPC53	P25441	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	PER1	P25625	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	ORC2	P32833	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	VPS51	P36116	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	PCI8	P40512	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	ROG3	P43602	733 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	SNX4	P47057	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	YJR124C	P47159	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	GCV1	P48015	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	MIG2	P53035	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	AIM14	P53109	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	SSL2	Q00578	843 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	MUB1	Q03162	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	HFI1	Q12060	488 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	NFS1	P25374	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	DMC1	P25453	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	KIP1	P28742	1111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	LHS1	P36016	881 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	UBS1	P38290	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	POP7	P38291	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	MSG5	P38590	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	NEM1	P38757	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	BUD16	P39988	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	YGL138C	P53122	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	HLR1	Q04429	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	IVY1	Q04934	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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