RNA–Protein interactions for RNA: YMR117C

SPC24, Transcript of Component of the kinetochore-associated Ndc80 complex, yeast

Gene SPC24, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC24	YMR117C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	RIT1	P23796	513 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	HOT13	P36078	116 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	ERG11	P10614	530 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	AMD2	P22580	549 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	APD1	P38281	316 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	SPC72	P39723	622 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	UBP16	Q02863	499 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	YML119W	Q03208	357 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SPC24	YMR117C	AQY1	P0CD91	305 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	PDE1	P22434	369 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	SWC3	P31376	625 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	EXO1	P39875	702 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	ACA1	P39970	489 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	RTS3	P53289	263 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	AAT1	Q01802	451 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	ATG21	Q02887	496 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	RAD33	Q04231	177 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	ICL2	Q12031	575 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	LCB4	Q12246	624 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	GSY2	P27472	705 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	IMA1	P53051	589 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	IRC3	Q06683	689 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	YDL242W	Q07746	117 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	THI7	Q05998	598 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	ORM2	Q06144	216 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	CYK3	Q07533	885 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	MSM1	P22438	575 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	PTH2	P34222	208 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	CIR1	P42940	261 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	SEG1	Q04279	960 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	PLM2	Q04383	521 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	BI2	P03873	423 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	BIK1	P11709	440 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	SIP1	P32578	815 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	VPS8	P39702	1274 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	PUG1	P40100	303 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	YNL058C	P53947	316 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	YML053C	Q04978	212 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	HRD3	Q05787	833 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	PET122	P10355	254 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	CLB4	P24871	460 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	YPT53	P36019	220 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	SKP2	P42843	763 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	ATP23	P53722	227 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	RIM13	Q03792	727 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	BSP1	Q06604	576 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	YPL191C	Q08930	360 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SPC24	YMR117C	NUP1	P20676	1076 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	MBR1	P23493	339 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	SAE2	P46946	345 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	YML122C	Q03207	126 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	TRS130	Q03660	1102 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	BLS1	Q06071	122 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	MRPL36	P36531	177 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	YBR138C	P38277	524 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	ERC1	P38767	581 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	SUL2	Q12325	893 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	APN1	P22936	367 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	YCL049C	P25577	312 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	DBF20	P32328	564 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	BST1	P43571	1029 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	TAM41	P53230	385 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	ATG16	Q03818	150 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	NPR3	P38742	1146 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SPC24	YMR117C	SAP185	P40856	1058 aa		5.68	□□□□□ -1.5

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