RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599427.5

PCBP1-AS1-253, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 662 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 LY6G6CO95867 125 aa3.14□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.14□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 A8MUU9 505 aa3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 LINC01554Q52M75 96 aa3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 K7ERS5 55 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 FBN3Q75N90 2809 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP10-1P60331 282 aa3.1□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.1□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP10-12P60413 245 aa3.09□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.08□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.08□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.08□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KMT2AQ03164 3969 aa3.07□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 A0A1B0GU33 70 aa3.04□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 H0YAA0 97 aa3.04□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.04□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PKD1P98161 4303 aa3.04□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 TGP01266 2768 aa3.04□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.03□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.03□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 A0A1B0GVY2 172 aa3.02□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 CSAG1Q6PB30 78 aa3.02□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.02□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.01□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.01□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.01□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.01□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 LCE3CQ5T5A8 94 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.98□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PKHD1P08F94 4074 aa2.95□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 APOBP04114 4563 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ROMO1P60602 79 aa2.93□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 C9orf92A6NGG3 77 aa2.91□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP10-8P60410 259 aa2.91□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.89□□□□□ -1.95
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 TNXBP22105 4242 aa2.88□□□□□ -1.95
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 S4R3F8 94 aa2.87□□□□□ -1.95
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 DNHD1Q96M86 4753 aa2.87□□□□□ -1.95
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP10-5P60370 271 aa2.85□□□□□ -1.95
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 M0QZ58 72 aa2.84□□□□□ -1.95
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 HSPG2P98160 4391 aa2.83□□□□□ -1.96
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 FAT1Q14517 4588 aa2.83□□□□□ -1.96
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.83□□□□□ -1.96
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 FAT3Q8TDW7 4589 aa2.81□□□□□ -1.96
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 R4GN34 69 aa2.81□□□□□ -1.96
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 TPRXLQ17RH7 258 aa2.8□□□□□ -1.96
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 P0C880 135 aa2.79□□□□□ -1.96
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 LCE1EQ5T753 118 aa2.79□□□□□ -1.96
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 CRIPTQ9P021 101 aa2.79□□□□□ -1.96
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP12-1P59990 96 aa2.78□□□□□ -1.96
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP12-2P59991 146 aa2.78□□□□□ -1.96
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 RYR2Q92736 4967 aa2.76□□□□□ -1.97
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 MT1HL1P0DM35 61 aa2.75□□□□□ -1.97
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 Q5VSD8 79 aa2.75□□□□□ -1.97
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 A0A0D9SG42 100 aa2.74□□□□□ -1.97
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.73□□□□□ -1.97
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 MYCBP2O75592 4640 aa2.72□□□□□ -1.97
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 RYR1P21817 5038 aa2.7□□□□□ -1.98
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.68□□□□□ -1.98
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PP632Q6XCG6 107 aa2.67□□□□□ -1.98
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.63□□□□□ -1.99
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa2.61□□□□□ -1.99
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PLAC4Q8WY50 150 aa2.59□□□□□ -1.99
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.58□□□□□ -2
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 RYR3Q15413 4870 aa2.57□□□□□ -2
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 LRP2P98164 4655 aa2.55□□□□□ -2
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.54□□□□□ -2
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 MUC17Q685J3 4493 aa2.53□□□□□ -2
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.52□□□□□ -2.01
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.5□□□□□ -2.01
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 HERC1Q15751 4861 aa2.49□□□□□ -2.01
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 TNP1P09430 55 aa2.49□□□□□ -2.01
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 LPAP08519 4548 aa2.49□□□□□ -2.01
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.47□□□□□ -2.01
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.44□□□□□ -2.02
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ABCA13Q86UQ4 5058 aa2.43□□□□□ -2.02
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.42□□□□□ -2.02
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 BIRC6Q9NR09 4857 aa2.41□□□□□ -2.02
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP10-10P60014 251 aa2.41□□□□□ -2.02
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.38□□□□□ -2.03
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 HERC2O95714 4834 aa2.34□□□□□ -2.03
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.34□□□□□ -2.03
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms