RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410506.1

RNU6-1077P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1077, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1077P, Length 102 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DNAH8Q96JB1 4490 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ITPR3Q14573 2671 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPRR2FQ96RM1 72 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DNAH6Q9C0G6 4158 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FASNP49327 2511 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MUC5ACP98088 5654 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPRR2EP22531 72 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TENM3Q9P273 2699 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZFHX4Q86UP3 3567 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 APOBP04114 4563 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZANQ9Y493 2812 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MYO18BQ8IUG5 2567 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PKHD1P08F94 4074 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NBEAQ8NFP9 2946 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HIVEP1P15822 2718 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MGAQ8IWI9 3026 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TLN2Q9Y4G6 2542 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LRP1BQ9NZR2 4599 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DEFB133Q30KQ1 61 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CEP250Q9BV73 2442 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KALRNO60229 2985 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRIOO75962 3097 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 AKAP9Q99996 3911 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DNAH1Q9P2D7 4330 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SVEP1Q4LDE5 3571 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LAMA5O15230 3695 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HMCN2Q8NDA2 5059 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MAST4O15021 2626 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LAMA1P25391 3075 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TGP01266 2768 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MGAM2Q2M2H8 2515 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FAT1Q14517 4588 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 COL6A3P12111 3177 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DNAH10Q8IVF4 4471 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 STATHP02808 62 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CFAP54Q96N23 3096 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CSMD1Q96PZ7 3565 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CMYA5Q8N3K9 4069 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 A0A096LPF7 62 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MXRA5Q9NR99 2828 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RELNP78509 3460 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ITPR1Q14643 2758 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PHGR1C9JFL3 82 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RPS29P62273 56 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HTTP42858 3142 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DEFB108BQ8NET1 73 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LAMA3Q16787 3333 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LINC01556Q5JQF7 62 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LRP2P98164 4655 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HERC1Q15751 4861 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MT1EP04732 61 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MT1HP80294 61 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TEX15Q9BXT5 2789 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CD52P31358 61 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ATMQ13315 3056 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DEFB4AO15263 64 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MDN1Q9NU22 5596 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KMT2DO14686 5537 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MT1LQ93083 61 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FRYLO94915 3013 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LRBAP50851 2863 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DNAH17Q9UFH2 4485 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 Q9Y3F1 56 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 STAB2Q8WWQ8 2551 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DNAH5Q8TE73 4624 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MUC17Q685J3 4493 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 C5orf42Q9H799 3197 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DNAH12Q6ZR08 3092 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CFAP46Q8IYW2 2715 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ITPR2Q14571 2701 aa0.21□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.3 ms