RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP12-2P59991 146 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRG-201ENST00000295874 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
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PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRG-201ENST00000295874 MT1GP13640 62 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRG-201ENST00000295874 LCE3BQ5TA77 95 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRG-201ENST00000295874 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRG-201ENST00000295874 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRG-201ENST00000295874 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.21□□□□□ -1.73
PTPRG-201ENST00000295874 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRG-201ENST00000295874 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.16□□□□□ -1.74
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