RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP12-2P59991 146 aa8.96□□□□□ -0.98
NOMO3-201ENST00000263012 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.95□□□□□ -0.98
NOMO3-201ENST00000263012 MYCBP2O75592 4640 aa8.93□□□□□ -0.98
NOMO3-201ENST00000263012 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
NOMO3-201ENST00000263012 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.85□□□□□ -0.99
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
NOMO3-201ENST00000263012 A0A1B0GVY2 172 aa8.83□□□□□ -1
NOMO3-201ENST00000263012 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.82□□□□□ -1
NOMO3-201ENST00000263012 A0A0A0MQY5 61 aa8.75□□□□□ -1.01
NOMO3-201ENST00000263012 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.72□□□□□ -1.01
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP12-1P59990 96 aa8.72□□□□□ -1.01
NOMO3-201ENST00000263012 PLAC4Q8WY50 150 aa8.72□□□□□ -1.01
NOMO3-201ENST00000263012 PKHD1P08F94 4074 aa8.67□□□□□ -1.02
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.66□□□□□ -1.02
NOMO3-201ENST00000263012 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
NOMO3-201ENST00000263012 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
NOMO3-201ENST00000263012 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.64□□□□□ -1.03
NOMO3-201ENST00000263012 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.61□□□□□ -1.03
NOMO3-201ENST00000263012 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.54□□□□□ -1.04
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NOMO3-201ENST00000263012 TNP1P09430 55 aa8.48□□□□□ -1.05
NOMO3-201ENST00000263012 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.46□□□□□ -1.06
NOMO3-201ENST00000263012 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.46□□□□□ -1.06
NOMO3-201ENST00000263012 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.41□□□□□ -1.06
NOMO3-201ENST00000263012 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
NOMO3-201ENST00000263012 RYR1P21817 5038 aa8.37□□□□□ -1.07
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.31□□□□□ -1.08
NOMO3-201ENST00000263012 MT1HL1P0DM35 61 aa8.3□□□□□ -1.08
NOMO3-201ENST00000263012 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.26□□□□□ -1.09
NOMO3-201ENST00000263012 PKD1P98161 4303 aa8.24□□□□□ -1.09
NOMO3-201ENST00000263012 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.22□□□□□ -1.09
NOMO3-201ENST00000263012 LRP2P98164 4655 aa8.21□□□□□ -1.09
NOMO3-201ENST00000263012 PP632Q6XCG6 107 aa8.2□□□□□ -1.1
NOMO3-201ENST00000263012 RYR3Q15413 4870 aa8.18□□□□□ -1.1
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP10-10P60014 251 aa8.13□□□□□ -1.11
NOMO3-201ENST00000263012 HSPG2P98160 4391 aa8.11□□□□□ -1.11
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.1□□□□□ -1.11
NOMO3-201ENST00000263012 LPAP08519 4548 aa7.98□□□□□ -1.13
NOMO3-201ENST00000263012 RYR2Q92736 4967 aa7.91□□□□□ -1.14
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.85□□□□□ -1.15
NOMO3-201ENST00000263012 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
NOMO3-201ENST00000263012 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.8□□□□□ -1.16
NOMO3-201ENST00000263012 MUC2Q02817 5179 aa7.75□□□□□ -1.17
NOMO3-201ENST00000263012 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.66□□□□□ -1.18
NOMO3-201ENST00000263012 TNXBP22105 4242 aa7.6□□□□□ -1.19
NOMO3-201ENST00000263012 HERC2O95714 4834 aa7.59□□□□□ -1.19
NOMO3-201ENST00000263012 LCE3AQ5TA76 89 aa7.54□□□□□ -1.2
NOMO3-201ENST00000263012 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.4□□□□□ -1.23
NOMO3-201ENST00000263012 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.38□□□□□ -1.23
NOMO3-201ENST00000263012 RNF213Q63HN8 5207 aa7.37□□□□□ -1.23
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP10-12P60413 245 aa7.3□□□□□ -1.24
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP12-3P60328 96 aa7.28□□□□□ -1.24
NOMO3-201ENST00000263012 HERC1Q15751 4861 aa7.28□□□□□ -1.24
NOMO3-201ENST00000263012 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.23□□□□□ -1.25
NOMO3-201ENST00000263012 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.11□□□□□ -1.27
NOMO3-201ENST00000263012 MT1FP04733 61 aa7.08□□□□□ -1.28
NOMO3-201ENST00000263012 MT2AP02795 61 aa7.04□□□□□ -1.28
NOMO3-201ENST00000263012 MT1HP80294 61 aa7.04□□□□□ -1.28
NOMO3-201ENST00000263012 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.04□□□□□ -1.28
NOMO3-201ENST00000263012 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.02□□□□□ -1.29
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7□□□□□ -1.29
NOMO3-201ENST00000263012 MUC17Q685J3 4493 aa6.98□□□□□ -1.29
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.97□□□□□ -1.29
NOMO3-201ENST00000263012 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.97□□□□□ -1.29
NOMO3-201ENST00000263012 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.95□□□□□ -1.3
NOMO3-201ENST00000263012 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.94□□□□□ -1.3
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.93□□□□□ -1.3
NOMO3-201ENST00000263012 INE1O15225 51 aa6.91□□□□□ -1.3
NOMO3-201ENST00000263012 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
NOMO3-201ENST00000263012 LCE2CQ5TA81 110 aa6.78□□□□□ -1.32
NOMO3-201ENST00000263012 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.78□□□□□ -1.32
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.74□□□□□ -1.33
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.74□□□□□ -1.33
NOMO3-201ENST00000263012 USH2AO75445 5202 aa6.68□□□□□ -1.34
NOMO3-201ENST00000263012 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NOMO3-201ENST00000263012 MT1XP80297 61 aa6.65□□□□□ -1.34
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.62□□□□□ -1.35
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP10-5P60370 271 aa6.62□□□□□ -1.35
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.62□□□□□ -1.35
NOMO3-201ENST00000263012 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.61□□□□□ -1.35
NOMO3-201ENST00000263012 MT1BP07438 61 aa6.6□□□□□ -1.35
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.6□□□□□ -1.35
NOMO3-201ENST00000263012 KMT2DO14686 5537 aa6.58□□□□□ -1.36
NOMO3-201ENST00000263012 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.52□□□□□ -1.37
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.48□□□□□ -1.37
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.47□□□□□ -1.37
NOMO3-201ENST00000263012 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
NOMO3-201ENST00000263012 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.3□□□□□ -1.4
NOMO3-201ENST00000263012 LCE2BO14633 110 aa6.21□□□□□ -1.42
NOMO3-201ENST00000263012 MT1GP13640 62 aa6.14□□□□□ -1.43
NOMO3-201ENST00000263012 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.05□□□□□ -1.44
NOMO3-201ENST00000263012 LCE3BQ5TA77 95 aa6.02□□□□□ -1.45
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP12-4P60329 112 aa6.01□□□□□ -1.45
NOMO3-201ENST00000263012 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6□□□□□ -1.45
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms