RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 XIRP2A4UGR9 3374 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRT-209ENST00000612229 NF1P21359 2839 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRT-209ENST00000612229 REV3LO60673 3130 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRT-209ENST00000612229 TGP01266 2768 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRT-209ENST00000612229 ZZEF1O43149 2961 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP10-2P60368 255 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRT-209ENST00000612229 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRT-209ENST00000612229 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRT-209ENST00000612229 LAMA1P25391 3075 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRT-209ENST00000612229 TENM3Q9P273 2699 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRT-209ENST00000612229 USP34Q70CQ2 3546 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRT-209ENST00000612229 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRT-209ENST00000612229 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRT-209ENST00000612229 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRT-209ENST00000612229 ZANQ9Y493 2812 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRT-209ENST00000612229 HTTP42858 3142 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRT-209ENST00000612229 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRT-209ENST00000612229 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.81□□□□□ -1.8
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PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP10-8P60410 259 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRT-209ENST00000612229 COL6A3P12111 3177 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRT-209ENST00000612229 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRT-209ENST00000612229 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
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PTPRT-209ENST00000612229 UNC80Q8N2C7 3258 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRT-209ENST00000612229 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRT-209ENST00000612229 TPRXLQ17RH7 258 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRT-209ENST00000612229 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
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PTPRT-209ENST00000612229 ATMQ13315 3056 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRT-209ENST00000612229 BRCA2P51587 3418 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRT-209ENST00000612229 INE1O15225 51 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRT-209ENST00000612229 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRT-209ENST00000612229 CDH23Q9H251 3354 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRT-209ENST00000612229 VCANP13611 3396 aa3.66□□□□□ -1.82
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PTPRT-209ENST00000612229 XP32Q5T750 250 aa3.65□□□□□ -1.83
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PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.62□□□□□ -1.83
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PTPRT-209ENST00000612229 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRT-209ENST00000612229 SPEGQ15772 3267 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP10-10P60014 251 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRT-209ENST00000612229 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP12-1P59990 96 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.42□□□□□ -1.86
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PTPRT-209ENST00000612229 FBN3Q75N90 2809 aa3.41□□□□□ -1.86
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PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRT-209ENST00000612229 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRT-209ENST00000612229 RELNP78509 3460 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRT-209ENST00000612229 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRT-209ENST00000612229 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRT-209ENST00000612229 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRT-209ENST00000612229 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRT-209ENST00000612229 BSNQ9UPA5 3926 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP12-3P60328 96 aa3.11□□□□□ -1.91
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PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa3.09□□□□□ -1.91
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PTPRT-209ENST00000612229 DNAH3Q8TD57 4116 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRT-209ENST00000612229 CUBNO60494 3623 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRT-209ENST00000612229 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRT-209ENST00000612229 LYSTQ99698 3801 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRT-209ENST00000612229 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.02□□□□□ -1.93
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